基因页：Rapgefl1

概括？
基因 51195
象征 Rapgefl1
同义词 link-gefii
描述 RAP鸟嘌呤核苷酸交换因子像1
参考 HGNC：HGNC：17428|ENSEMBL：ENSG00000108352|HPRD：17954|Vega：Otthumg00000133325
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17q21.1
Pascal P值 0.293
Sherlock P值 0.443
胎儿β -1.471
DMG 2（＃研究）
支持 COMPOSITESET
Darnell FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Vaneijk_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点，对应于精神分裂症患者（n = 260）和未受影响的对照（n = 250）之间的391个独特的转录本。 2
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 2
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中：1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG02722657 17 38334439 Rapgefl1 5.881E-4 0.388 0.05 DMG：Wockner_2014
CG00236832 17 38465489 Rapgefl1 0.002 -3.962 DMG：Vaneijk_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005085 鸟苷核苷酸交换因子活性 塔斯 9582122
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0007399 神经系统的发展 塔斯 神经突（GO期限：5） 9789079
去：0007186 G蛋白偶联受体蛋白信号通路 塔斯 9582122
去：0007165 信号转导 IEA -
去：0007264 小GTPase介导的信号转导 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005622 细胞内 IEA -
去：0005624 膜分数 塔斯 9582122

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Jaeger转移DN 258 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应表皮DN 508 354 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hatada甲基化在肺癌中 390 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌17q11 Q21 Amplicon 133 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病初期DN 165 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggins他莫昔芬抗性 66 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
恩格曼癌祖细胞dn 70 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 491 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应6小时 229 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时 324 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1目标不是通过AKT1向上的 211 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 281 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-125/351 795 802 1A，M8 HSA-MIR-125B脑 ucccugagacccuaacuuguga
HSA-MIR-125A脑 ucccugagacccuuaaccugug
mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D 52 58 M8 HSA-MIR-17-5P caaagugcuuacugcagguagu
HSA-MIR-20A脑 uaaagugcuuauagugcagguag
HSA-MIR-106A aaaagugcuuacugugcagguagc
HSA-MIR-106BSZ uaaagugcugacagugcagau
HSA-MIR-20BSZ caaagugcuugugcagguag
HSA-MIR-519D caaagugccucccuuuagugugu
mir-19 56 62 M8 HSA-MIR-19A ugugcaaauaugauaugaaaacuga
HSA-MIR-19B ugugcaaauccaugcaaaacuga
mir-214 163 170 1A，M8 HSA-MIR-214脑 acagcaggcacagacaggcag
mir-22 1192 1199 1A，M8 HSA-MIR-22脑 Aagcugccaguugaagaacugu
mir-29 564 571 1A，M8 HSA-MIR-29ASZ uagcaccaucugaaaucgguu
HSA-MIR-29BSZ uagcaccauuugaaaucaguguu
HSA-MIR-29CSZ uagcaccauuugaaaucggu
mir-376 1837年 1844年 1A，M8 HSA-MIR-376A aucauagaaaaauccacgu
HSA-MIR-376B aucauagaaaaauccauguu
mir-544 1801年 1808年 1A，M8 HSA-MIR-544 auucugcauuuuuuagcaagu
mir-93.hd/291-3p/294/295/302/372/373/520 51 57 M8 HSA-MIR-93脑 aaagugcuguucgugcagguag
HSA-MIR-302A uaagugcuugcauguuuguga
HSA-MIR-302B uaagugcuuccauguuuaguag
HSA-MIR-302C uaagugcuuccauguucagugg
HSA-MIR-302D Uaagugcuauguugugugu
HSA-MIR-372 aaagugcugcgacauuugagcgu
HSA-MIR-373 Gaagugcuucgauuuggggugu
HSA-MIR-520E Aaagugcuuuuuugaggg
HSA-MIR-520A aaagugcuucccuuguggugu
HSA-MIR-520B aaagugcuuuuuuagaggg
HSA-MIR-520C aaagugcuuuuuuaggggug
HSA-MIR-520D aaaguguuugugggguggguu