基因页：PCSK1
概括？
| 基因 | 5122 |
| 象征 | PCSK1 |
| 同义词 | BMIQ12 | NEC1 | PC1 | PC3 | SPC3 |
| 描述 | 普罗蛋白转化酶枯草蛋白/KEXIN类型1 |
| 参考 | MIM：162150|HGNC：HGNC：8743|ENSEMBL：ENSG00000175426|HPRD：01201|Vega：Otthumg00000122089 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 5Q15-Q21 |
| Pascal P值 | 0.01 |
| Sherlock P值 | 0.223 |
| 胎儿β | -4.828 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | 神经营养蛋白信号传导 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS1467642 | Chr10 | 21058685 | PCSK1 | 5122 | 0.17 | 反式 | ||
| RS8036059 | CHR15 | 28112722 | PCSK1 | 5122 | 0.19 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| Bin1 | 0.81 | 0.82 |
| 猪 | 0.77 | 0.81 |
| KIFC2 | 0.76 | 0.82 |
| SYNGR3 | 0.76 | 0.79 |
| FBXO27 | 0.75 | 0.76 |
| P2RX5 | 0.75 | 0.77 |
| Rhof | 0.73 | 0.74 |
| C19orf28 | 0.73 | 0.74 |
| KCNQ4 | 0.73 | 0.78 |
| AMDHD2 | 0.73 | 0.73 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.21 | -0.41 | -0.19 |
| RPS20 | -0.41 | -0.46 |
| snrpg | -0.38 | -0.41 |
| TPT1 | -0.38 | -0.35 |
| Clic1 | -0.36 | -0.45 |
| Rab13 | -0.36 | -0.37 |
| FAM60A | -0.36 | -0.17 |
| RPL24 | -0.36 | -0.35 |
| NCAPG | -0.36 | -0.15 |
| RPL27 | -0.35 | -0.35 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0004252 | 丝氨酸型内肽酶活性 | IEA | 谷氨酸（GO期限：7） | - |
| 去：0005509 | 钙离子结合 | IEA | - | |
| 去：0008233 | 肽酶活性 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006508 | 蛋白水解 | 塔斯 | 9207799 | |
| 去：0007267 | 细胞细胞信号传导 | 塔斯 | 9207799 | |
| 去：0008152 | 代谢过程 | 塔斯 | 9207799 | |
| 去：0043043 | 肽生物合成过程 | ISS | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005615 | 细胞外空间 | 艾达 | 8397508 | |
| GO：0031410 | 细胞质囊泡 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 氨基酸和衍生物的反应组代谢 | 200 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 能量代谢的反应组整合 | 120 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome糖尿病途径 | 133 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组肽激素生物合成 | 14 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome胰岛素合成和加工 | 21 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 胰岛素分泌的反应组调节 | 93 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 变形素的反应组合成和脱酰化 | 16 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组的合成分泌和GIP失活 | 14 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome泌尿素合成分泌和失活 | 22 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome合成分泌和GLP1的失活 | 19 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 中村肿瘤区周围与中央DN | 634 | 384 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| sabates结直肠腺瘤 | 141 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 环氧化物素的浓凋亡 | 239 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 由FOXP3绑定的Marson刺激 | 1022 | 619 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MEF ICP，带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 38 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 | 718 | 401 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim所有疾病Calb1 Corr Up | 548 | 370 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Servitja Islet HNF1A靶向DN | 109 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fortschegger PHF8靶向 | 279 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-186 | 2293 | 2299 | 1a | HSA-MIR-186 | caaagaauuuugggcuu |
| mir-203.1 | 309 | 315 | 1a | HSA-MIR-203 | ugaaauguuuaggaccacuag |
| mir-320 | 2129 | 2135 | 1a | HSA-MIR-320 | aaaagcugggugagaggggcgaa |
| mir-410 | 2257 | 2263 | 1a | HSA-MIR-410 | aauauaacacagauggcugu |
| mir-494 | 2159 | 2165 | M8 | HSA-MIR-494脑 | ugaaacauacgggaaaccucuu |