基因页:FAM178B
概括?
基因 | 51252 |
象征 | FAM178B |
同义词 | - |
描述 | 具有序列相似性的家庭178成员b |
参考 | HGNC:HGNC:28036|ENSEMBL:ENSG00000168754|HPRD:14235|Vega:Otthumg00000155257 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 2q11.2 |
Pascal P值 | 1.335E-4 |
主持人 | 皮质 额叶皮质BA9 梭子基底神经节 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS62152901 | 2 | 97564898 | FAM178B | ENSG00000168754.9 | 8.702E-6 | 0.02 | 119277 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7589232 | 2 | 97566148 | FAM178B | ENSG00000168754.9 | 9.316E-6 | 0.02 | 118027 | gtex_brain_putamen_basal |
RS6721921 | 2 | 97566501 | FAM178B | ENSG00000168754.9 | 9.328E-6 | 0.02 | 117674 | gtex_brain_putamen_basal |
RS59131346 | 2 | 97566768 | FAM178B | ENSG00000168754.9 | 9.328E-6 | 0.02 | 117407 | gtex_brain_putamen_basal |
RS140006341 | 2 | 97568771 | FAM178B | ENSG00000168754.9 | 9.106E-6 | 0.02 | 115404 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4260285 | 2 | 97570081 | FAM178B | ENSG00000168754.9 | 9.106E-6 | 0.02 | 114094 | gtex_brain_putamen_basal |
RS62152904 | 2 | 97571873 | FAM178B | ENSG00000168754.9 | 9.396E-6 | 0.02 | 112302 | gtex_brain_putamen_basal |
RS140933337 | 2 | 97572551 | FAM178B | ENSG00000168754.9 | 9.69e-6 | 0.02 | 111624 | gtex_brain_putamen_basal |
RS10191663 | 2 | 97573844 | FAM178B | ENSG00000168754.9 | 5.924e-6 | 0.02 | 110331 | gtex_brain_putamen_basal |
RS62152910 | 2 | 97577082 | FAM178B | ENSG00000168754.9 | 6.353E-6 | 0.02 | 107093 | gtex_brain_putamen_basal |
RS6734673 | 2 | 97577241 | FAM178B | ENSG00000168754.9 | 6.147E-6 | 0.02 | 106934 | gtex_brain_putamen_basal |
RS6717064 | 2 | 97577343 | FAM178B | ENSG00000168754.9 | 3.762E-6 | 0.02 | 106832 | gtex_brain_putamen_basal |
RS17119655 | 2 | 97577495 | FAM178B | ENSG00000168754.9 | 5.862e-6 | 0.02 | 106680 | gtex_brain_putamen_basal |
RS13390019 | 2 | 97797680 | FAM178B | ENSG00000168754.9 | 6.533E-6 | 0.02 | -113505 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/FAM178B_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Darwiche皮肤肿瘤启动子DN | 185 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Darwiche Papilloma风险低DN | 165 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Darwiche Papilloma风险高DN | 180 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
darwiche鳞状细胞癌DN | 181 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血晚期祖先 | 544 | 307 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性1 | 528 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 | 940 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF HCP与H3未甲基化 | 228 | 119 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |