概括
基因 51252
象征 FAM178B
同义词 -
描述 具有序列相似性的家庭178成员b
参考 HGNC:HGNC:28036|ENSEMBL:ENSG00000168754|HPRD:14235|Vega:Otthumg00000155257
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2q11.2
Pascal P值 1.335E-4
主持人 皮质
额叶皮质BA9
梭子基底神经节

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS62152901 2 97564898 FAM178B ENSG00000168754.9 8.702E-6 0.02 119277 gtex_brain_putamen_basal
RS7589232 2 97566148 FAM178B ENSG00000168754.9 9.316E-6 0.02 118027 gtex_brain_putamen_basal
RS6721921 2 97566501 FAM178B ENSG00000168754.9 9.328E-6 0.02 117674 gtex_brain_putamen_basal
RS59131346 2 97566768 FAM178B ENSG00000168754.9 9.328E-6 0.02 117407 gtex_brain_putamen_basal
RS140006341 2 97568771 FAM178B ENSG00000168754.9 9.106E-6 0.02 115404 gtex_brain_putamen_basal
RS4260285 2 97570081 FAM178B ENSG00000168754.9 9.106E-6 0.02 114094 gtex_brain_putamen_basal
RS62152904 2 97571873 FAM178B ENSG00000168754.9 9.396E-6 0.02 112302 gtex_brain_putamen_basal
RS140933337 2 97572551 FAM178B ENSG00000168754.9 9.69e-6 0.02 111624 gtex_brain_putamen_basal
RS10191663 2 97573844 FAM178B ENSG00000168754.9 5.924e-6 0.02 110331 gtex_brain_putamen_basal
RS62152910 2 97577082 FAM178B ENSG00000168754.9 6.353E-6 0.02 107093 gtex_brain_putamen_basal
RS6734673 2 97577241 FAM178B ENSG00000168754.9 6.147E-6 0.02 106934 gtex_brain_putamen_basal
RS6717064 2 97577343 FAM178B ENSG00000168754.9 3.762E-6 0.02 106832 gtex_brain_putamen_basal
RS17119655 2 97577495 FAM178B ENSG00000168754.9 5.862e-6 0.02 106680 gtex_brain_putamen_basal
RS13390019 2 97797680 FAM178B ENSG00000168754.9 6.533E-6 0.02 -113505 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Darwiche皮肤肿瘤启动子DN 185 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche Papilloma风险低DN 165 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche Papilloma风险高DN 180 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
darwiche鳞状细胞癌DN 181 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血晚期祖先 544 307 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性1 528 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 940 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP与H3未甲基化 228 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因