基因页面:TBC1D7
总结吗?
| GeneID | 51256年 |
| 象征 | TBC1D7 |
| 同义词 | MGCPH | PIG51 | TBC7 |
| 描述 | TBC1域家庭成员7 |
| 参考 | MIM: 612655|HGNC: HGNC: 21066|运用:ENSG00000145979|HPRD: 18165|织女:OTTHUMG00000014272 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 6 p24.1 |
| 帕斯卡假定值 | 0.031 |
| 夏洛克假定值 | 0.193 |
| 胎儿β | 0.257 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 前扣带皮层BA24 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 伏隔核基底神经节 硬膜基底神经节 迈尔斯的顺式和反式 元 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
| GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.0159 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg22477331 | 6 | 13328902 | TBC1D7 | 1.43 e-5 | -0.326 | 0.014 | DMG: Wockner_2014 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs12407228 | chr1 | 245900038 | TBC1D7 | 51256年 | 0.09 | 反式 | ||
| rs398151 | 6 | 13281628 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 5.573 e - | 0.01 | 47187年 | gtex_brain_ba24 |
| rs202041 | 6 | 13288425 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 5.572 e - | 0.01 | 40390年 | gtex_brain_ba24 |
| rs202039 | 6 | 13288578 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 5.572 e - | 0.01 | 40237年 | gtex_brain_ba24 |
| rs67298859 | 6 | 13288679 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 5.572 e - | 0.01 | 40136年 | gtex_brain_ba24 |
| rs202036 | 6 | 13288737 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 5.572 e - | 0.01 | 40078年 | gtex_brain_ba24 |
| rs361522 | 6 | 13289996 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 5.591 e - | 0.01 | 38819年 | gtex_brain_ba24 |
| rs202070 | 6 | 13267938 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 5.228 e - | 0 | 60877年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs202071 | 6 | 13268158 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 5.228 e - | 0 | 60657年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs202072 | 6 | 13268211 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 5.228 e - | 0 | 60604年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs202073 | 6 | 13268605 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 4.696 e - | 0 | 60210年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs35742117 | 6 | 13269369 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 6.053 e - | 0 | 59446年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs202077 | 6 | 13271438 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 1.881 e - | 0 | 57377年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs202053 | 6 | 13273643 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 1.304 e - | 0 | 55172年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs202050 | 6 | 13274137 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 4.714 e - | 0 | 54678年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs202048 | 6 | 13274501 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 1.404 e - | 0 | 54314年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs202046 | 6 | 13275570 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 1.362 e-9 | 0 | 53245年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs202045 | 6 | 13275914 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 1.3 e-9 | 0 | 52901年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs202044 | 6 | 13275950 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 1.031 e - | 0 | 52865年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2235173 | 6 | 13276545 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 2.224 e-6 | 0 | 52270年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs202042 | 6 | 13277714 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 9.654 e-8 | 0 | 51101年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs495895 | 6 | 13277915 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 2.169 e-8 | 0 | 50900年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs3817735 | 6 | 13278648 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 7.041 e - | 0 | 50167年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs375661 | 6 | 13279431 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 9.598平台以及 | 0 | 49384年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs405078 | 6 | 13279867 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 9.598平台以及 | 0 | 48948年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs441213 | 6 | 13279906 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 1.116 e - | 0 | 48909年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs377704 | 6 | 13280019 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 9.598平台以及 | 0 | 48796年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs413120 | 6 | 13280641 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 9.598平台以及 | 0 | 48174年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs445590 | 6 | 13280864 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 9.598平台以及 | 0 | 47951年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs445591 | 6 | 13280866 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 9.598平台以及 | 0 | 47949年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs445714 | 6 | 13280958 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 9.6平台以及 | 0 | 47857年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs202040 | 6 | 13288535 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 8.98 e-8 | 0 | 40280年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs202038 | 6 | 13288648 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 8.98 e-8 | 0 | 40167年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs8541 | 6 | 13290238 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 6.67 e-8 | 0 | 38577年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs202034 | 6 | 13291015 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 4.248 e-8 | 0 | 37800年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs202030 | 6 | 13292152 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 8.98 e-8 | 0 | 36663年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs202028 | 6 | 13292429 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 8.988 e-8 | 0 | 36386年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs515111 | 6 | 13293948 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 2.729 e - | 0 | 34867年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs4602719 | 6 | 13295502 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 8.701 e-8 | 0 | 33313年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs1550526 | 6 | 13295515 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 1.389 e-6 | 0 | 33300年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs454563 | 6 | 13295536 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 8.701 e-8 | 0 | 33279年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7755309 | 6 | 13296347 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 3.314 e-6 | 0 | 32468年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs475165 | 6 | 13297163 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 4.286 e - | 0 | 31652年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6924855 | 6 | 13297476 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 3.316 e-6 | 0 | 31339年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9369976 | 6 | 13297524 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 3.316 e-6 | 0 | 31291年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6923757 | 6 | 13297558 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 3.316 e-6 | 0 | 31257年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9473908 | 6 | 13297883 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 3.316 e-6 | 0 | 30932年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9473909 | 6 | 13297945 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 3.316 e-6 | 0 | 30870年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9296641 | 6 | 13298011 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 3.316 e-6 | 0 | 30804年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9296642 | 6 | 13298184 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 3.316 e-6 | 0 | 30631年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6909879 | 6 | 13298330 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 3.316 e-6 | 0 | 30485年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2002961 | 6 | 13298898 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 3.316 e-6 | 0 | 29917年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs909508 | 6 | 13298992 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 3.316 e-6 | 0 | 29823年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs3857594 | 6 | 13299110 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 3.316 e-6 | 0 | 29705年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs878700 | 6 | 13299318 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 3.316 e-6 | 0 | 29497年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7742398 | 6 | 13300999 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 1.255 e - | 0 | 27816年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs34142643 | 6 | 13301178 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 3.316 e-6 | 0 | 27637年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs35952102 | 6 | 13301215 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 1.255 e - | 0 | 27600年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9369978 | 6 | 13301704 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 3.316 e-6 | 0 | 27111年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6922200 | 6 | 13302034 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 3.316 e-6 | 0 | 26781年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9369979 | 6 | 13302285 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 3.316 e-6 | 0 | 26530年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9473929 | 6 | 13305816 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 1.255 e - | 0 | 22999年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs9473930 | 6 | 13305950 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 1.399 e - | 0 | 22865年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs3800486 | 6 | 13306331 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 2.015 e - | 0 | 22484年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs3800485 | 6 | 13306354 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 1.255 e - | 0 | 22461年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs3800484 | 6 | 13307046 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 1.255 e - | 0 | 21769年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs3800483 | 6 | 13307077 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 1.255 e - | 0 | 21738年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs3800482 | 6 | 13307520 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 1.255 e - | 0 | 21295年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs3800481 | 6 | 13307536 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 1.255 e - | 0 | 21279年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs3823443 | 6 | 13308289 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 1.255 e - | 0 | 20526年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs3823442 | 6 | 13308314 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 1.255 e - | 0 | 20501年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs6914796 | 6 | 13313458 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 1.278 e - | 0 | 15357年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs12697949 | 6 | 13315212 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 8.199 e-8 | 0 | 13603年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs11759028 | 6 | 13315898 | TBC1D7 | ENSG00000145979.13 | 9.076 e-8 | 0 | 12917年 | gtex_brain_putamen_basal |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005097 | Rab GTPase激活活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005096 | GTPase激活活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0032313 | Rab GTPase监管活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005622 | 细胞内的 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 王LMO4 DN的目标 | 352年 | 225年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 罗德里格斯甲状腺癌分化不良 | 633年 | 376年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NUYTTEN NIPP1的目标了 | 769年 | 437年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NUYTTEN EZH2的目标了 | 1037年 | 673年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NIKOLSKY乳腺癌6 p24第22位扩增子 | 21 | 17 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 道格拉斯BMI1 DN的目标 | 314年 | 188年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 桑塞姆APC的目标 | 212年 | 121年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ZEMBUTSU对丝裂霉素的敏感性 | 19 | 11 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 棕熊短波紫外线反应迟 | 1137年 | 655年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CHANGOLKAR H2AFY目标了 | 48 | 28 | 所有SZGR 2.0基因通路 |