概括
基因 51294
象征 PCDH12
同义词 VE-Cadherin-2 | Vecad2
描述 原钙粘蛋白12
参考 MIM:605622|HGNC:HGNC:8657|ENSEMBL:ENSG00000113555|HPRD:09287|Vega:Otthumg00000129658
基因类型 蛋白质编码
地图位置 5Q31
Pascal P值 0.061
胎儿β 0.741
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.0032
表达 基因表达的荟萃分析 p价值:1.57
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中:1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS7132043 CHR12 80968399 PCDH12 51294 0.12 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005509 钙离子结合 IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0008038 神经元识别 塔斯 神经元(GO期限:4) 10380929
去:0007155 细胞粘附 IEA -
去:0007156 同粒细胞粘附 IEA -
GO:0016339 钙依赖性细胞 - 细胞粘附 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005911 细胞电池连接 IEA -
去:0005886 质膜 塔斯 10380929
去:0005887 质膜的积分 塔斯 10716726

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
悍马良性皮肤肿瘤DN 18 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
悍马恶性皮肤肿瘤DN 18 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
悍马皮肤癌进度DN 100 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞DN 216 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 ICP带有H3K27ME3 74 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF ICP与H3K27Me3 206 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因