基因页:ATP5D
概括?
基因 | 513 |
象征 | ATP5D |
同义词 | - |
描述 | ATP合酶,H+转运,线粒体F1复合物,三角洲亚基 |
参考 | MIM:603150|HGNC:HGNC:837|Ensembl:ENSG0000000099624|HPRD:04397|Vega:Otthumg00000180143 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19p13.3 |
Pascal P值 | 0.017 |
Sherlock P值 | 0.993 |
胎儿β | -1.311 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
支持 | COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS10409262 | CHR19 | 58154954 | ATP5D | 513 | 0.17 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ATP5D_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
apoa1bp | 0.90 | 0.84 |
ATP5G3 | 0.89 | 0.82 |
MGST3 | 0.89 | 0.82 |
C19orf70 | 0.88 | 0.82 |
COX5A | 0.88 | 0.80 |
FAM58A | 0.88 | 0.84 |
KHDC1 | 0.88 | 0.81 |
MRPL12 | 0.87 | 0.81 |
乌罗德 | 0.87 | 0.80 |
GPX4 | 0.87 | 0.83 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
RBM25 | -0.45 | -0.46 |
SFRS12 | -0.44 | -0.44 |
EIF5B | -0.44 | -0.57 |
CD2AP | -0.40 | -0.35 |
MAP4K4 | -0.40 | -0.41 |
ZC3H13 | -0.40 | -0.34 |
CCDC55 | -0.40 | -0.34 |
ZNF326 | -0.39 | -0.37 |
SFRS18 | -0.39 | -0.54 |
myh9 | -0.39 | -0.28 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG氧化磷酸化 | 135 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg阿尔茨海默氏病 | 169 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg帕金森氏病 | 133 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg Huntingtons病 | 185 | 109 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome TCA循环和呼吸电子传输 | 141 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组呼吸电子传输ATP通过化学含量耦合和热量产生通过解偶联蛋白来合成 | 98 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过化学含量耦合对ATP的反应组形成 | 16 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gary CD5目标 | 473 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pramoonjago Sox4靶向DN | 51 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Huttmann B Cll生存不佳 | 276 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Doane对雄激素DN的反应 | 241 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞 | 530 | 342 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal乳房4 5WK DN | 196 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dairkee Tert目标 | 380 | 213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 | 479 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼转移DN | 261 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
戈德拉斯体内平衡增殖 | 171 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈肺癌的生存 | 28 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha Voxphos | 87 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
宁慢性阻塞性肺疾病 | 157 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LEI MYB目标 | 318 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Cromer转移DN | 81 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bandres对Carmustin没有MGMT 48小时DN的响应 | 32 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zamora NOS2靶向DN | 96 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成生成6 | 189 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 6小时的反应 | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha Human Mitodb 6 2002 | 429 | 260 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha线粒体 | 447 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
霍夫曼大到小淋巴细胞向上 | 163 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
骨髓瘤与成熟B淋巴细胞中的Shaffer IRF4靶标 | 101 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
活化B淋巴细胞中的Shaffer IRF4靶标 | 81 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌晚期复发DN | 69 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌生存DN | 113 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌亚类S3 | 266 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇的时间反应13 | 172 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MariaDason对丁酸姜黄素Sulindac TSA 2的反应 | 8 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |