概括
基因 51306
象征 FAM13B
同义词 arhgap49 | c5orf5 | fam13b1 | khchp | n61
描述 具有序列相似性的家庭13成员b
参考 MIM:609371|HGNC:HGNC:1335|Ensembl:ENSG00000031003|HPRD:06464|Vega:Otthumg00000129202
基因类型 蛋白质编码
地图位置 5Q31
Pascal P值 0.006
Sherlock P值 0.054

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005096 GTPase激活剂活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007165 信号转导 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005622 细胞内 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Rho GTPases的Reactome信号传导 113 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
UDayakumar Med1靶向DN 240 171 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wamunyokoli卵巢癌LMP DN 199 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Markey RB1急性lof 215 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
哈马凋亡通过Trail Up 584 356 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼肿瘤区分良好,而不是很差 236 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼转移 344 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard粉碎和燃烧突变体DN 185 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张乳腺癌祖细胞 425 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chen Hoxa5靶向9小时 223 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足 518 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-129-5p 1860年 1866年 M8 HSA-MIR-129 cuuuuugcgguggggcuugc
HSA-MIR-129-5P cuuuuugcgguggggcuugcu
mir-130/301 1875年 1881年 1a HSA-MIR-130A cagugcaauguaaaaggggau
HSA-MIR-301 cagugcaauaugucaaagc
HSA-MIR-130b Cagugcaaugaagggauggau
HSA-MIR-454-3P uagugcaauauugcuuauaggguuu
mir-148/152 1816年 1822年 M8 HSA-MIR-148A ucagugcacuacaacuuugu
HSA-MIR-152 UCAGUGCAUGACACUUGGG
HSA-MIR-148B ucagugcaucacacaacuuugu
mir-181 1834年 1840年 M8 HSA-MIR-181A aacauucaacgcugucggugagu
HSA-MIR-181BSZ aacauucauugcugucggggg
HSA-MIR-181C aacauucaaccugucggugagu
HSA-MIR-181D aacauucauuguugucggggguggguu
mir-23 825 831 M8 HSA-MIR-23A aucacauugccagggauucc
HSA-MIR-23B aucacauugccagggauuacc
mir-25/32/92/363/367 1549年 1555年 M8 HSA-MIR-25 Cauugcacuugucucggucuga
HSA-MIR-32 uauugcacauacuaaguugc
HSA-MIR-92 uauugcacuugucccgcgcug
HSA-MIR-367 Aauugcacuuuagcaaugga
HSA-MIR-92BSZ uauugcacucgucccgcgcuc
mir-29 865 871 M8 HSA-MIR-29ASZ uagcaccaucugaaaucgguu
HSA-MIR-29BSZ uagcaccauuugaaaucaguguu
HSA-MIR-29CSZ uagcaccauuugaaaucggu
mir-30-3p 429 436 1A,M8 HSA-MIR-30A-3P cuuucagucggauguugcagc
HSA-MIR-30E-3P cuuucagucggauguauacagc
mir-323 824 831 1A,M8 HSA-MIR-323 gcacauuacggucgaccucu
mir-342 827 833 1a HSA-MIR-342 ucucacacagaaaucgcacccccguc
mir-34b 718 724 1a HSA-MIR-34B uaggcagugucauagcugauug
mir-450 1860年 1866年 1a HSA-MIR-450 uuuuugcgauguuccuaaua
mir-543 1835年 1841年 M8 HSA-MIR-543 aaacauucgcggugcacuucu