概括
基因 51318
象征 MRPL35
同义词 L35MT | MRP-L35
描述 线粒体核糖体蛋白L35
参考 MIM:611841|HGNC:HGNC:14489|ENSEMBL:ENSG00000132313|HPRD:14755|Vega:Otthumg0000000037385
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2P11.2
Pascal P值 0.354
Sherlock P值 6.858e-5
胎儿β -0.534
主持人 小脑半球
小脑
皮质
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.0004
表达 基因表达的荟萃分析 p价值:1.463

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS6702538 CHR1 225624512 MRPL35 51318 0.18 反式
RS10799319 CHR1 225703484 MRPL35 51318 0.18 反式
RS8124502 CHR20 19231131 MRPL35 51318 0.17 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003735 核糖体的结构成分 nas 11543634
GO:0045182 翻译调节器活动 nas 11543634
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006412 翻译 nas 11543634
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005840 核糖体 IEA -
去:0005739 线粒体 IEA -
去:0005761 线粒体核糖体 nas 11543634

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Gary CD5目标DN 431 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周炎性反应活DN 384 220 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan mll签名1 380 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名2 UP 418 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Provenzani转移DN 136 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
带有E盒的WEI MYCN目标 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL顺式 128 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血细胞和脑QTL顺式 65 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
斯坦因·埃斯拉(Stein Esrra)瞄准 388 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2 CDC25A的射线肿瘤发生 104 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha Human Mitodb 6 2002 429 260 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha线粒体 447 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对CSF2RB和IL4的响应 338 225 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF的反应 418 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 408 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra目标 535 325 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fournier腺泡开发2 277 172 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 718 401 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 445 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇的时间反应13 172 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因
寄养KDM1A靶向DN 211 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOSCO过敏原诱导TH2相关模块 151 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Durand Stroma ns 162 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-194 175 182 1A,M8 HSA-MIR-194 uguaacagcaacuccauga
mir-204/211 311 318 1A,M8 HSA-MIR-204 Uucccuuugucauccuaugccu
HSA-MIR-211 uucccuuugucauccuucgccu