概括
基因 51363
象征 CHST15
同义词 吹牛| galnac4s-6st
描述 碳水化合物(N-乙酰基半乳糖胺4-硫酸盐6-O)磺化酶15
参考 MIM:608277|HGNC:HGNC:18137|Ensembl:ENSG00000182022|HPRD:12203|Vega:Otthumg0000000019208
基因类型 蛋白质编码
地图位置 10Q26
Pascal P值 0.753
Sherlock P值 0.67
胎儿β 0.573
主持人

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0016740 转移酶活性 IEA -
GO:0050656 3'-磷酸腺苷5'-磷脂结合 艾达 11572857
GO:0050659 N-乙酰基半乳糖胺4-硫酸盐6-O-硫代转移酶活性 艾达 11572857
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0019319 己糖生物合成过程 艾达 11572857
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000139 高尔基膜 IEA -
去:0005794 高尔基体 IEA -
去:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 nas 11572857

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG糖胺聚糖生物合成软骨素硫酸盐 22 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组软骨素硫酸盐生物合成 21 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组软骨素硫酸盐皮肤硫酸盐代谢 49 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome糖胺聚糖代谢 111 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
碳水化合物的反应组代谢 247 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村肿瘤区周围与中央DN 634 384 该途径中的所有SZGR 2.0基因
gal白血病干细胞DN 244 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn 800 473 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌根源与腔内 326 213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WU细胞迁移 184 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张对IKK抑制剂和TNF的反应 223 140 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rozanov MMP14靶向 266 171 该途径中的所有SZGR 2.0基因
brocke凋亡由IL6逆转 144 98 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马纳洛缺氧 207 145 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HADDAD B淋巴细胞祖细胞 293 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1的Verhaak AML突变 183 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
卫生部对干扰素beta的反应 71 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏 487 303 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦克拉克兰牙科龋齿 253 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群P2 79 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向DN 292 189 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向由甲基化DN沉默 281 179 该途径中的所有SZGR 2.0基因
H3K27ME3 DN的Acevedo肝癌 228 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Izadpanah干细胞脂肪与骨头 126 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
等级结肠和直肠癌DN 101 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤D DN 78 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ruiz TNC目标 153 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对CSF2RB和IL4 DN的响应 315 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF的反应 418 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 408 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向DN 442 275 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由PML Rara Fusion绑定的Martens 456 287 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马顿人维甲酸的反应 857 456 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1不是通过AKT1 DN的目标 88 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1通过AKT1 DN目标 82 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bakker FOXO3靶向DN 187 109 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 516 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-136 583 589 M8 HSA-MIR-136 Acuccauuuuuuugaugaugaugga
mir-23 1995 2001 1a HSA-MIR-23A aucacauugccagggauucc
HSA-MIR-23B aucacauugccagggauuacc
mir-369-3p 2046 2052 M8 HSA-MIR-369-3P aauauacaugguugaucuuu
mir-9 2270 2276 M8 HSA-MIR-9SZ ucuuuguuaucuagcuguauga