基因页:UBR5
概括?
基因 | 51366 |
象征 | UBR5 |
同义词 | DD5 | EDD | EDD1 | HYD |
描述 | 泛素蛋白连接酶E3成分N-验证蛋白5 |
参考 | MIM:608413|HGNC:HGNC:16806|ENSEMBL:ENSG00000104517|HPRD:06436|Vega:Otthumg00000164755 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 8Q22 |
Pascal P值 | 0.047 |
Sherlock P值 | 0.419 |
TADA P值 | 0.03 |
胎儿β | 1.436 |
DMG | 2(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | COMPOSITESET Darnell FMRP目标 Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 2 |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 2 |
DNM:XU_2012 | 整个外显子组测序分析 | 在这项研究中,通过795个样品的外显子组测序鉴定了4个基因的从头突变 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
UBR5 | CHR8 | 103298653 | G | t | NM_015902 | p.1717a> d | 错过 | 精神分裂症 | DNM:XU_2012 |
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG14897263 | 8 | 103421231 | UBR5 | 1.906E-4 | -0.364 | 0.034 | DMG:Wockner_2014 |
CG19310740 | 8 | 103424477 | UBR5 | 3.04e-8 | -0.01 | 9.29e-6 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS1522707 | CHR8 | 104287844 | UBR5 | 51366 | 0.18 | 顺式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/UBR5_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG泛素介导的蛋白水解 | 138 | 98 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周炎性反应活DN | 384 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang LMO4靶向DN | 352 | 225 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan MLL签名2 DN | 281 | 186 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
UDayakumar Med1靶向 | 135 | 82 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Odonnell TFRC靶向 | 456 | 228 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MYC和TFRC的Odonnell目标 | 83 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jaatinen造血干细胞向上 | 316 | 190 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN | 805 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌变性DN | 537 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞DN | 485 | 334 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN | 855 | 609 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN | 483 | 336 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana BRCA2 PCC网络 | 423 | 265 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ferreira Ewings肉瘤不稳定与稳定 | 167 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Koyama Sema3b靶向DN | 411 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Oct4目标 | 290 | 172 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath SOX2目标 | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath NOS目标 | 179 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Amit EGF响应40 HELA | 42 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肯尼CTNNB1靶向DN | 52 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
外邦紫外线响应集群D9 | 28 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hedenfalk乳腺癌BRACX DN | 20 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mahajan对IL1A DN的反应 | 76 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MA垂体胎儿与成人DN | 19 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
大脑衰老 | 262 | 186 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dazard对UV NHEK DN的反应 | 318 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
dazard UV响应集群G6 | 153 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染12小时DN | 101 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
尼克对Proc处理DN的反应 | 27 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boyault肝癌子类G3 UP | 188 | 121 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
woo肝癌复发 | 105 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gabriely miR21靶标 | 289 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rao由Sall4绑定 | 227 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
山乳房干细胞DN | 146 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |