基因页面:CSAD
总结吗?
| GeneID | 51380年 |
| 象征 | CSAD |
| 同义词 | CSD | PCAP |
| 描述 | 半胱氨酸亚磺酸脱羧酶 |
| 参考 | MIM: 616569|HGNC: HGNC: 18966|运用:ENSG00000139631|HPRD: 16763|织女:OTTHUMG00000048076 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 12 q13.11-q14.3 |
| 帕斯卡假定值 | 0.268 |
| 夏洛克假定值 | 0.446 |
| 胎儿β | 0.545 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 硬膜基底神经节 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg02710461 | 12 | 53566978 | CSAD | 7.01 e-5 | 0.315 | 0.024 | DMG: Wockner_2014 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs11170324 | chr12 | 53290402 | CSAD | 51380年 | 0.04 | 独联体 | ||
| rs2716734 | chr2 | 39947720 | CSAD | 51380年 | 0 | 反式 | ||
| rs2716736 | chr2 | 39947946 | CSAD | 51380年 | 0 | 反式 | ||
| rs2597796 | chr4 | 17535859 | CSAD | 51380年 | 0.09 | 反式 | ||
| rs1587434 | chr6 | 66615354 | CSAD | 51380年 | 0.03 | 反式 | ||
| rs17165823 | chr7 | 93476735 | CSAD | 51380年 | 0.14 | 反式 | ||
| rs2294031 | chr8 | 1812077 | CSAD | 51380年 | 0.11 | 反式 | ||
| rs12255258 | chr10 | 106306927 | CSAD | 51380年 | 0.01 | 反式 | ||
| rs1241940 | chr14 | 84008851 | CSAD | 51380年 | 0.03 | 反式 | ||
| rs12895787 | chr14 | 84017913 | CSAD | 51380年 | 0.13 | 反式 | ||
| rs349973 | chr17 | 50642288 | CSAD | 51380年 | 0.13 | 反式 | ||
| rs11170398 | 12 | 53471839 | CSAD | ENSG00000139631.14 | 2.418 e-6 | 0.04 | 103296年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs11170400 | 12 | 53472002 | CSAD | ENSG00000139631.14 | 2.363 e-6 | 0.04 | 103133年 | gtex_brain_putamen_basal |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG牛磺酸,HYPOTAURINE新陈代谢 | 10 | 7 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME硫氨基酸代谢 | 24 | 17 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME氨基酸代谢和衍生品 | 200年 | 136年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CHARAFE乳腺癌细胞腔的VS间充质 | 450年 | 256年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MULLIGHAN MLL签名1 DN | 242年 | 165年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MULLIGHAN MLL签名2 DN | 281年 | 186年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 多德鼻咽癌DN | 1375年 | 806年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GAUSSMANN MLL AF4融合目标F | 185年 | 119年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 帕特森多烯紫杉醇耐 | 29日 | 20. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李肝癌DENA DN | 74年 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伊万诺娃长期造血干细胞 | 302年 | 191年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 翁肝脏运动目标 | 41 | 29日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 卡多佐伽马辐射和3 ab | 18 | 11 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 萧述三乳腺癌基本DN | 701年 | 446年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 王肿瘤侵袭性DN | 210年 | 128年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| YOSHIMURA MAPK8目标了 | 1305年 | 895年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李最近胸腺移民 | 227年 | 128年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 吴肝癌复发DN | 80年 | 54 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 开罗肝脏DN发展 | 222年 | 141年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 约翰斯通PARVB目标3 DN | 918年 | 550年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李BMP2目标了 | 745年 | 475年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 若林史江脂肪生成PPARG RXRA 8 d | 882年 | 506年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 若林史江脂肪生成PPARG RXRA绑定与H4K20ME1马克 | 145年 | 82年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN PEDRIOLI MIR31目标 | 418年 | 245年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ZWANG下降2 EGF的脉搏 | 293年 | 119年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |