基因页:EIF3L
概括?
基因 | 51386 |
象征 | EIF3L |
同义词 | EIF3EIP | EIF3S11 | EIF3S6IP | HSPC021 | HSPC025 | MSTP005 |
描述 | 真核翻译起始因子3亚基L |
参考 | HGNC:HGNC:18138|ENSEMBL:ENSG00000100129|HPRD:10932|Vega:Otthumg00000150671 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 22q |
Pascal P值 | 0.691 |
Sherlock P值 | 0.23 |
胎儿β | 1.702 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 小脑半球 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG15853374 | 22 | 38245447 | EIF3L | 1.89E-10 | -0.039 | 5.4e-7 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS760521 | CHR22 | 37247850 | EIF3L | 51386 | 0.18 | 顺式 | ||
RS10894158 | Chr11 | 129736156 | EIF3L | 51386 | 0.18 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/EIF3L_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 15231747|17353931 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006412 | 翻译 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0001650 | 纤维中心 | IEA | - | |
去:0005634 | 核 | 艾达 | 18029348 | |
去:0005654 | 核质 | IEA | - | |
去:0005730 | 核仁 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
中村肿瘤区周围与中央DN | 634 | 384 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken紫菜叶黑色素瘤DN | 526 | 357 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindgren膀胱癌群集1 | 121 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼肿瘤区分良好,而不是很差 | 236 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stark前额叶皮层22Q11删除DN | 517 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
霍林引用1个目标1 | 35 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gavin Foxp3目标集群T7 | 98 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kyng环境压力反应不是旧的4NQO | 13 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kyng环境压力反应不是伽玛在旧的 | 31 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kyng环境压力反应不是紫外线 | 25 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng DNA损伤DN | 195 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng环境压力反应 | 56 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西肾上腺皮质肿瘤DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha PGC | 420 | 269 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
小儿小儿所有疗法反应 | 53 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤上课 | 605 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kyng正常老化 | 19 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kyng Werner综合征 | 20 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄胚胎干细胞核心 | 335 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
双龙血清和雷帕霉素敏感基因 | 68 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向DN | 553 | 343 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Delacroix Rar Bound ES | 462 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
霍尔曼天冬酰胺酶抗性B | 26 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |