概括
基因 5140
象征 pde3b
同义词 HCGIP1 | CGIPDE1
描述 磷酸二酯酶3B
参考 MIM:602047|HGNC:HGNC:8779|ENSEMBL:ENSG00000152270|HPRD:03626|Vega:Otthumg00000165898
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11P15.1
Pascal P值 0.495
胎儿β 1.114
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DNM:Fromer_2014 整个外显子组测序分析 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:0.0078

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 CG46 特征 学习
pde3b Chr11 14854346 C t NM_000922 p.725r> c 错过 精神分裂症 DNM:Fromer_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS7370564 0 pde3b 5140 0.18 反式
RS2187675 CHR16 12628451 pde3b 5140 0.13 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
RASL10A 0.68 0.69
TTC9B 0.61 0.57
coro1a 0.61 0.69
yrdc 0.60 0.58
TWF2 0.59 0.62
KCNMB4 0.59 0.62
meis3p2 0.57 0.59
TMEM198 0.56 0.61
lass4 0.56 0.55
UBL7 0.56 0.52
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
NSBP1 -0.47 -0.56
AF347015.26 -0.46 -0.43
Rab13 -0.45 -0.53
Eya2 -0.44 -0.48
C9orf61 -0.44 -0.51
aldh7a1 -0.44 -0.46
PBXIP1 -0.43 -0.46
AL139819.3 -0.43 -0.49
ADSSL1 -0.43 -0.45
AF347015.18 -0.42 -0.47

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004119 CGMP抑制环核苷酸磷酸二酯酶活性 塔斯 8884271
GO:0016787 水解酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007165 信号转导 IEA -
去:0031018 内分泌胰腺发育 IEA -
GO:0042593 葡萄糖稳态 IEA -
去:0050796 胰岛素分泌的调节 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Kegg Purine代谢 159 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG胰岛素信号通路 137 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG孕酮介导的卵母细胞成熟 86 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta No1途径 33 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome胰岛素受体信号传导级联 87 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GPCR的反应组信号传导 920 449 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GPCR下游信号传导 805 368 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome G alpha的信号事件 121 82 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome CGMP效应 19 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组一氧化氮刺激鸟苷酸环化酶 25 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome血小板稳态 78 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome PKB介导的事件 29 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胰岛素受体的反应组信号传导 108 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组止血 466 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome PI3K级联 71 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Casorelli急性临时细胞白血病 177 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Huttmann B Cll生存不佳 276 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Scibetta KDM5B靶向DN 81 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vanharanta子宫肌瘤,带7Q缺失DN 36 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Teramoto OPN目标群集7 19 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN 584 395 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GC期DN的pasqualucci淋巴瘤 165 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ross AML与PML RARA FUSION 77 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
皮肤伤口dn的嗜中性粒细胞 225 163 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 412 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1突变DN的Verhaak AML 246 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kayo衰老的肌肉 244 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏DN 145 88 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群P3 160 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向由甲基化DN沉默 281 179 该途径中的所有SZGR 2.0基因
华莱士前列腺癌竞赛DN 88 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Marzec IL2信号传导DN 36 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fujii YBX1靶向DN 202 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mitsiades对aplidin的反应 439 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bonome卵巢癌的生存最佳逃亡 246 152 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Valk AML群集2 29 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jison Sickle细胞疾病DN 181 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARSON FOXP3目标DN 54 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stambolsky对维生素D3的反应 84 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ewsr1 fli1融合DN的TORCHIA目标 321 200 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2同工型的Pedersen转移7 403 240 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Durand Stroma ns 162 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-186 772 779 1A,M8 HSA-MIR-186 caaagaauuuugggcuu
mir-205 760 766 M8 HSA-MIR-205 uccuucauucccggagucug