基因页:pde3b
概括?
基因 | 5140 |
象征 | pde3b |
同义词 | HCGIP1 | CGIPDE1 |
描述 | 磷酸二酯酶3B |
参考 | MIM:602047|HGNC:HGNC:8779|ENSEMBL:ENSG00000152270|HPRD:03626|Vega:Otthumg00000165898 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 11P15.1 |
Pascal P值 | 0.495 |
胎儿β | 1.114 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DNM:Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。 | |
网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献:0.0078 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
pde3b | Chr11 | 14854346 | C | t | NM_000922 | p.725r> c | 错过 | 精神分裂症 | DNM:Fromer_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS7370564 | 0 | pde3b | 5140 | 0.18 | 反式 | |||
RS2187675 | CHR16 | 12628451 | pde3b | 5140 | 0.13 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PDE3B_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
RASL10A | 0.68 | 0.69 |
TTC9B | 0.61 | 0.57 |
coro1a | 0.61 | 0.69 |
yrdc | 0.60 | 0.58 |
TWF2 | 0.59 | 0.62 |
KCNMB4 | 0.59 | 0.62 |
meis3p2 | 0.57 | 0.59 |
TMEM198 | 0.56 | 0.61 |
lass4 | 0.56 | 0.55 |
UBL7 | 0.56 | 0.52 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
NSBP1 | -0.47 | -0.56 |
AF347015.26 | -0.46 | -0.43 |
Rab13 | -0.45 | -0.53 |
Eya2 | -0.44 | -0.48 |
C9orf61 | -0.44 | -0.51 |
aldh7a1 | -0.44 | -0.46 |
PBXIP1 | -0.43 | -0.46 |
AL139819.3 | -0.43 | -0.49 |
ADSSL1 | -0.43 | -0.45 |
AF347015.18 | -0.42 | -0.47 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004119 | CGMP抑制环核苷酸磷酸二酯酶活性 | 塔斯 | 8884271 | |
GO:0016787 | 水解酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007165 | 信号转导 | IEA | - | |
去:0031018 | 内分泌胰腺发育 | IEA | - | |
GO:0042593 | 葡萄糖稳态 | IEA | - | |
去:0050796 | 胰岛素分泌的调节 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kegg Purine代谢 | 159 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG胰岛素信号通路 | 137 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG孕酮介导的卵母细胞成熟 | 86 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta No1途径 | 33 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome胰岛素受体信号传导级联 | 87 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GPCR的反应组信号传导 | 920 | 449 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome GPCR下游信号传导 | 805 | 368 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome G alpha的信号事件 | 121 | 82 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome CGMP效应 | 19 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组一氧化氮刺激鸟苷酸环化酶 | 25 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome血小板稳态 | 78 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome PKB介导的事件 | 29 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
胰岛素受体的反应组信号传导 | 108 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组止血 | 466 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome PI3K级联 | 71 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Casorelli急性临时细胞白血病 | 177 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Huttmann B Cll生存不佳 | 276 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Scibetta KDM5B靶向DN | 81 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vanharanta子宫肌瘤,带7Q缺失DN | 36 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Teramoto OPN目标群集7 | 19 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN | 584 | 395 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GC期DN的pasqualucci淋巴瘤 | 165 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ross AML与PML RARA FUSION | 77 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
皮肤伤口dn的嗜中性粒细胞 | 225 | 163 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 | 412 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NPM1突变DN的Verhaak AML | 246 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kayo衰老的肌肉 | 244 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德韦尔老化的肾脏DN | 145 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gavin Foxp3目标集群P3 | 160 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向由甲基化DN沉默 | 281 | 179 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
华莱士前列腺癌竞赛DN | 88 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Marzec IL2信号传导DN | 36 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fujii YBX1靶向DN | 202 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mitsiades对aplidin的反应 | 439 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bonome卵巢癌的生存最佳逃亡 | 246 | 152 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Valk AML群集2 | 29 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jison Sickle细胞疾病DN | 181 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MARSON FOXP3目标DN | 54 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stambolsky对维生素D3的反应 | 84 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2靶向DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ewsr1 fli1融合DN的TORCHIA目标 | 321 | 200 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB2同工型的Pedersen转移7 | 403 | 240 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Durand Stroma ns | 162 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-186 | 772 | 779 | 1A,M8 | HSA-MIR-186 | caaagaauuuugggcuu |
mir-205 | 760 | 766 | M8 | HSA-MIR-205 | uccuucauucccggagucug |