基因页面:PPME1
总结吗?
| GeneID | 51400年 |
| 象征 | PPME1 |
| 同义词 | PME-1 |
| 描述 | 蛋白磷酸酶methylesterase 1 |
| 参考 | MIM: 611117|HGNC: HGNC: 30178|运用:ENSG00000214517|HPRD: 17864|织女:OTTHUMG00000168115 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 11 q13.4 |
| 帕斯卡假定值 | 0.001 |
| 夏洛克假定值 | 0.15 |
| 胎儿β | -0.807 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了DNA的甲基化概要首发精神分裂症患者外周血细胞从18岁(FESZ)和15名正常对照组。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg15302567 | 11 | 73560416 | PPME1 | -0.029 | 0.25 | DMG: Nishioka_2013 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs1578978 | chr8 | 118196802 | PPME1 | 51400年 | 0.07 | 反式 | ||
| rs10409262 | chr19 | 58154954 | PPME1 | 51400年 | 0.12 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 唐克斯的目标RUNX1 RUNX1T1单核细胞融合 | 204年 | 140年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| LASTOWSKA神经母细胞瘤拷贝数DN | 800年 | 473年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH MYC最大目标 | 775年 | 494年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NIKOLSKY乳腺癌11 q12 Q14扩增子 | 158年 | 93年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 江缺氧癌症 | 83年 | 52 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KYNG DNA损伤射线和紫外线辐射 | 88年 | 65年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KYNG DNA损伤了 | 226年 | 164年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 汉SATB1目标了 | 395年 | 249年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 汉SATB1 DN的目标 | 442年 | 275年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 若林史江脂肪生成PPARG 8 d | 658年 | 397年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PEDRIOLI MIR31目标了 | 221年 | 120年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 不是通过P38冯氏TNF响应 | 337年 | 236年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| RAO受SALL4同种型 | 182年 | 108年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |