基因页面:PDE4A

总结吗?
GeneID 5141年
象征 PDE4A
同义词 DPDE2 | PDE4 | PDE46
描述 磷酸二酯酶4
参考 MIM: 600126|HGNC: HGNC: 8780|运用:ENSG00000065989|HPRD: 02527|织女:OTTHUMG00000180411
基因型 蛋白质编码
地图上的位置 19 p13.2
帕斯卡假定值 0.612
夏洛克假定值 0.978
胎儿β -1.803
DMG 1(#研究)
eGene 迈尔斯的顺式和反式

基因数据来源
基因集名称 基因的方法设置 描述 信息
简历:PGCnp 全基因组关联研究 GWAS
DMG: Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 2
PMID: cooccur 高通量文献检索 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。
文学 高通量文献检索 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 点击显示详细信息

部分即遗传学和表观遗传学注释

@不同甲基化基因

探针 染色体 位置 最近的基因 P (dis) β(dis) 罗斯福(dis) 研究
cg19355182 19 10543010 PDE4A 8.41 e-5 -0.571 0.026 DMG: Wockner_2014
cg14536784 19 10542623 PDE4A 4.132的军医 -0.32 0.044 DMG: Wockner_2014

@eQTL注释

SNP ID 染色体 位置 eGene 基因Entrez ID pvalue qvalue TSS距离 eQTL类型
rs6924957 chr6 96853578 PDE4A 5141年 0.15 反式
rs6568383 0 PDE4A 5141年 0.19 反式

第二部分。转录组注释

通用基因表达(GTEx)

不可用

基因表达在发展脉络(BrainCloud)

补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。

基因表达的时空变化(BrainSpan)

补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。

中的基因在大脑区域

前10名中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
AC134043.1 0.93 0.12
EBF1 0.93 0.28
RARB 0.91 0.62
PBX3 0.89 0.35
IKZF1 0.84 0.37
GPR149 0.84 0.58
C10orf41 0.81 0.59
DLX6 0.78 0.55
ZNF521 0.75 0.51
DACH1 0.75 0.50
十大负面中的基因
基因 皮尔森的相关性 斯皮尔曼的相关性
CDADC1 -0.23 0.23
EMID1 -0.18 -0.20
CCDC90A -0.18 -0.15
GTDC1 -0.17 0.16
IGSF21 -0.17 0.01
RHCG -0.17 -0.02
GARNL3 -0.17 0.05
CHPT1 -0.17 0.09
SLC26A4 -0.17 0.20
NXPH3 -0.16 -0.05

第三部分。基因本体论注释

分子功能 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0004115 3 ',5 '环腺苷酸磷酸二酯酶的活动 NAS 8413254
去:0004115 3 ',5 '环腺苷酸磷酸二酯酶的活动 助教 9677330
去:0016787 水解酶活性 国际能源机构 - - - - - -
生物过程 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0007165 信号转导 助教 8940140
去:0009187 环核苷酸代谢过程 NAS - - - - - -
蜂窝组件 去的术语 证据 神经的关键词 PubMed ID
去:0005575 cellular_component ND - - - - - -
去:0005624 膜分数 助教 9677330
去:0005625 可溶部分 助教 8940140
去:0016020 膜 国际能源机构 - - - - - -

部分诉通路注释

路径名称 通道尺寸 # SZGR 2.0基因通路 信息
KEGG嘌呤代谢 159年 96年 所有SZGR 2.0基因通路
父母MTOR信号了 567年 375年 所有SZGR 2.0基因通路
刘前列腺癌DN 481年 290年 所有SZGR 2.0基因通路
ONKEN葡萄膜黑色素瘤了 783年 507年 所有SZGR 2.0基因通路
GAZDA钻石BLACKFAN贫血骨髓 30. 19 所有SZGR 2.0基因通路
周炎症反应生活的DN 384年 220年 所有SZGR 2.0基因通路
CHARAFE乳腺癌细胞腔的VS间充质DN 460年 312年 所有SZGR 2.0基因通路
唐克斯的目标RUNX1 RUNX1T1单核细胞融合DN 54 38 所有SZGR 2.0基因通路
罗德里格斯甲状腺未分化癌DN 537年 339年 所有SZGR 2.0基因通路
KERLEY对顺铂 44 30. 所有SZGR 2.0基因通路
MYLLYKANGAS放大热点17 25 12 所有SZGR 2.0基因通路
DN NUYTTEN NIPP1目标 848年 527年 所有SZGR 2.0基因通路
费雷拉尤因肉瘤不稳定和稳定 167年 92年 所有SZGR 2.0基因通路
挞挞VS PLASMABLAST浆细胞 398年 262年 所有SZGR 2.0基因通路
布朗感染血巨细胞病毒20小时 240年 152年 所有SZGR 2.0基因通路
道格拉斯BMI1目标了 566年 371年 所有SZGR 2.0基因通路
KRIGE TOSEDOSTAT反应6小时DN 911年 527年 所有SZGR 2.0基因通路
KRIGE应对TOSEDOSTAT 24小时DN 1011年 592年 所有SZGR 2.0基因通路
MARZEC IL2信号了 115年 80年 所有SZGR 2.0基因通路
MITSIADES APLIDIN反应 439年 257年 所有SZGR 2.0基因通路
BONOME卵巢癌生存非最优减积 510年 309年 所有SZGR 2.0基因通路
钟泡细胞毒性高 134年 84年 所有SZGR 2.0基因通路
布卢姆应对SALIRASIB DN 342年 220年 所有SZGR 2.0基因通路
YOSHIMURA MAPK8目标了 1305年 895年 所有SZGR 2.0基因通路
迈斯纳人大HCP H3K4ME3和H3K27ME3 142年 103年 所有SZGR 2.0基因通路
迈斯纳大脑HCP H3K4ME3和H3K27ME3 1069年 729年 所有SZGR 2.0基因通路
米凯尔森IPS H3K4ME3连结控制协定 174年 One hundred. 所有SZGR 2.0基因通路
DN CHYLA CBFA2T3目标 242年 146年 所有SZGR 2.0基因通路
不是通过P38冯氏TNF响应 337年 236年 所有SZGR 2.0基因通路
ZWANG仅由二EGF脉冲瞬变 1725年 838年 所有SZGR 2.0基因通路

部分VI. microRNA注释

microrna的家庭 目标位置 microrna的ID microrna的seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir - 101 1368年 1375年 1、m8 hsa - mir - 101 UACAGUACUGUGAUAACUGAAG
mir - 124.1 907年 914年 1、m8 hsa - mir - 124 a UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
miR-124/506 907年 913年 1 hsa - mir - 506 UAAGGCACCCUUCUGAGUAGA
hsa - mir - 124大脑 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir - 135 1245年 1251年 m8 hsa - mir - 135 a UAUGGCUUUUUAUUCCUAUGUGA
hsa - mir - 135 b UAUGGCUUUUCAUUCCUAUGUG
mir - 137 1083年 1090年 1、m8 hsa - mir - 137 UAUUGCUUAAGAAUACGCGUAG
hsa - mir - 137 UAUUGCUUAAGAAUACGCGUAG
mir - 139 314年 321年 1、m8 hsa - mir - 139大脑 UCUACAGUGCACGUGUCU
hsa - mir - 139大脑 UCUACAGUGCACGUGUCU
mir - 144 1369年 1375年 1 hsa - mir - 144 UACAGUAUAGAUGAUGUACUAG
mir - 188 230年 236年 m8 hsa - mir - 188 CAUCCCUUGCAUGGUGGAGGGU
miR-7 612年 618年 m8 hsa-miR-7深圳 UGGAAGACUAGUGAUUUUGUUG