概括
基因 5142
象征 PDE4B
同义词 dpde4 | pdeivb
描述 磷酸二酯酶4B
参考 MIM:600127|HGNC:HGNC:8781|ENSEMBL:ENSG00000184588|HPRD:02528|Vega:Otthumg00000009088
基因类型 蛋白质编码
地图位置 131
Pascal P值 1.456E-4
胎儿β -0.401
主持人 下丘脑
迈尔斯的顺式和跨性别
支持 g2cdb.humanpsd
G2CDB.HUMANPSP
COMPOSITESET
Darnell FMRP目标
潜在的突触基因

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
协会 组合的优势比方法(Sun等。2008),协会研究 1 链接到Szgene
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.02692
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:0.1444

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS1218887 CHR13 28097566 PDE4B 5142 0.19 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SYT9 0.57 0.47
tanc1 0.56 0.46
NTNG1 0.56 0.33
b3galtl 0.55 0.42
NKD1 0.55 0.38
STEAP3 0.54 0.43
RGS3 0.54 0.31
SLC17A6 0.53 0.22
TTC39A 0.53 0.35
PLA2R1 0.53 0.44
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
SLC26A4 -0.27 -0.26
IER5L -0.25 -0.23
EMX1 -0.25 -0.24
ID2 -0.25 -0.27
GPR22 -0.24 -0.20
RPL41 -0.22 -0.30
sigirr -0.22 -0.26
Bcl11a -0.22 -0.17
NRL -0.21 -0.19
TTC9B -0.21 -0.20

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004115 3',5'-循环 - AMP磷酸二酯酶活性 塔斯 9371714
GO:0016787 水解酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007165 信号转导 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005794 高尔基体 艾达 18029348
去:0005625 可溶性部分 塔斯 9371714
去:0005626 不溶性分数 塔斯 9371714
去:0005737 细胞质 艾达 18029348

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Kegg Purine代谢 159 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GPCR的反应组信号传导 920 449 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome阿片类药物信号传导 78 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome darpp 32事件 25 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GPCR下游信号传导 805 368 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome G alpha的信号事件 121 82 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西部肾上腺皮质肿瘤标记 21 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村肿瘤区周围与中央DN 634 384 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过CD40 DN的Hollmann凋亡 267 178 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken紫菜叶黑色素瘤DN 526 357 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Deurig t细胞促进性白血病DN 320 184 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Doane对雄激素DN的反应 241 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胶原蛋白凝胶中的Oswald造血干细胞 233 161 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan NPM1签名3 DN 162 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
runx1 runx1t1融合HSC的TONKS目标UP 185 126 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Odonnell TFRC靶向 456 228 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MYC和TFRC的Odonnell目标 83 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向 501 327 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应表皮DN 508 354 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向DN 90 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rashi对电离辐射2的响应2 127 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向胎儿肝 227 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲2FC DN 21 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN 584 395 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shipp DLBCL治愈与致命DN 45 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
斯托西对雌二醇的反应 50 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1突变DN的Verhaak AML 246 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chen LVAD支持失败的心脏DN 42 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kaab心脏中心与心室 249 170 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦卡因可卡因奖励5D 79 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kayo衰老的肌肉 244 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delaserna Myod目标DN 57 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染20小时DN 101 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血干细胞 254 164 该途径中的所有SZGR 2.0基因
韦斯顿Vegfa目标 108 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦紫外线响应集群D2 41 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
外邦紫外线高剂量DN 312 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
贝尔德糖尿病性肾病DN 434 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
韦斯顿·维加法(Weston Vegfa)目标3小时 74 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng由Foxp3绑定 491 310 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng Foxp3目标胸腺 196 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
促进耐受巨噬细胞DN 409 268 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先DN 191 123 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西部肾上腺皮质肿瘤 294 199 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tacker吉西他滨抵抗 79 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura MAPK8目标DN 366 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向 395 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向DN 442 275 该途径中的所有SZGR 2.0基因
flt3 itd的valk aml 40 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
钱德兰转移DN 306 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 445 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染4小时DN 254 158 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stambolsky对维生素D3的反应 84 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hirsch细胞转换签名 242 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ewsr1 fli1融合DN的TORCHIA目标 321 200 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smirnov对IR 6小时的回应 166 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-103/107 903 909 M8 HSA-MIR-103 agcagcauuguacggcuauga
HSA-MIR-107 agcagcauuguacgggcuauca
mir-124/506 398 404 M8 HSA-MIR-506 uaaggcacccuucugugaguaga
HSA-MIR-124 UAAGGCACGCGGUGAAUGCC
mir-142-3p 1432 1439 1A,M8 HSA-MIR-142-3P uguaguuuccuacuuuaugga
mir-23 1608 1615年 1A,M8 HSA-MIR-23A aucacauugccagggauucc
HSA-MIR-23B aucacauugccagggauuacc
HSA-MIR-23A aucacauugccagggauucc
HSA-MIR-23B aucacauugccagggauuacc
HSA-MIR-23A aucacauugccagggauucc
HSA-MIR-23B aucacauugccagggauuacc
mir-323 1608 1614年 1a HSA-MIR-323 gcacauuacggucgaccucu
HSA-MIR-323 gcacauuacggucgaccucu
HSA-MIR-323 gcacauuacggucgaccucu
mir-34b 1067 1073 1a HSA-MIR-34B uaggcagugucauagcugauug
mir-361 1622 1629年 1A,M8 HSA-MIR-361 uuaucagaaucuccagggguac
mir-369-3p 1110 1117 1A,M8 HSA-MIR-369-3P aauauacaugguugaucuuu
mir-374 1111 1117 M8 HSA-MIR-374 uuauaauacaAccugauaagug
HSA-MIR-374 uuauaauacaAccugauaagug
mir-409-3p 23 29 M8 HSA-MIR-409-3P cgauauguugcucggugaaccccu
mir-410 1014 1020 1a HSA-MIR-410 aauauaacacagauggcugu
HSA-MIR-410 aauauaacacagauggcugu
HSA-MIR-410 aauauaacacagauggcugu
mir-505 438 444 1a HSA-MIR-505 gucaacuugcugguuccuc
mir-539 1799年 1805年 1a HSA-MIR-539 ggagaauuauccuuggugugu