基因页:PDE4B
概括?
基因 | 5142 |
象征 | PDE4B |
同义词 | dpde4 | pdeivb |
描述 | 磷酸二酯酶4B |
参考 | MIM:600127|HGNC:HGNC:8781|ENSEMBL:ENSG00000184588|HPRD:02528|Vega:Otthumg00000009088 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 131 |
Pascal P值 | 1.456E-4 |
胎儿β | -0.401 |
主持人 | 下丘脑 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP COMPOSITESET Darnell FMRP目标 潜在的突触基因 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
协会 | 组合的优势比方法(Sun等。2008),协会研究 | 1 | 链接到Szgene |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | PSR:0.02692 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献:0.1444 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS1218887 | CHR13 | 28097566 | PDE4B | 5142 | 0.19 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PDE4B_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
SYT9 | 0.57 | 0.47 |
tanc1 | 0.56 | 0.46 |
NTNG1 | 0.56 | 0.33 |
b3galtl | 0.55 | 0.42 |
NKD1 | 0.55 | 0.38 |
STEAP3 | 0.54 | 0.43 |
RGS3 | 0.54 | 0.31 |
SLC17A6 | 0.53 | 0.22 |
TTC39A | 0.53 | 0.35 |
PLA2R1 | 0.53 | 0.44 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
SLC26A4 | -0.27 | -0.26 |
IER5L | -0.25 | -0.23 |
EMX1 | -0.25 | -0.24 |
ID2 | -0.25 | -0.27 |
GPR22 | -0.24 | -0.20 |
RPL41 | -0.22 | -0.30 |
sigirr | -0.22 | -0.26 |
Bcl11a | -0.22 | -0.17 |
NRL | -0.21 | -0.19 |
TTC9B | -0.21 | -0.20 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0004115 | 3',5'-循环 - AMP磷酸二酯酶活性 | 塔斯 | 9371714 | |
GO:0016787 | 水解酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007165 | 信号转导 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005794 | 高尔基体 | 艾达 | 18029348 | |
去:0005625 | 可溶性部分 | 塔斯 | 9371714 | |
去:0005626 | 不溶性分数 | 塔斯 | 9371714 | |
去:0005737 | 细胞质 | 艾达 | 18029348 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kegg Purine代谢 | 159 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GPCR的反应组信号传导 | 920 | 449 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome阿片类药物信号传导 | 78 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome darpp 32事件 | 25 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome GPCR下游信号传导 | 805 | 368 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome G alpha的信号事件 | 121 | 82 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西部肾上腺皮质肿瘤标记 | 21 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
中村肿瘤区周围与中央DN | 634 | 384 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过CD40 DN的Hollmann凋亡 | 267 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken紫菜叶黑色素瘤DN | 526 | 357 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Deurig t细胞促进性白血病DN | 320 | 184 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Doane对雄激素DN的反应 | 241 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
胶原蛋白凝胶中的Oswald造血干细胞 | 233 | 161 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan NPM1签名3 DN | 162 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
runx1 runx1t1融合HSC的TONKS目标UP | 185 | 126 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Odonnell TFRC靶向 | 456 | 228 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MYC和TFRC的Odonnell目标 | 83 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Senese HDAC3靶向 | 501 | 327 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应表皮DN | 508 | 354 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合靶向DN | 90 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rashi对电离辐射2的响应2 | 127 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martoriati MDM4靶向胎儿肝 | 227 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲2FC DN | 21 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN | 584 | 395 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shipp DLBCL治愈与致命DN | 45 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
斯托西对雌二醇的反应 | 50 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NPM1突变DN的Verhaak AML | 246 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chen LVAD支持失败的心脏DN | 42 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kaab心脏中心与心室 | 249 | 170 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
麦卡因可卡因奖励5D | 79 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kayo衰老的肌肉 | 244 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Delaserna Myod目标DN | 57 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染20小时DN | 101 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血干细胞 | 254 | 164 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
韦斯顿Vegfa目标 | 108 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
外邦紫外线响应集群D2 | 41 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
外邦紫外线高剂量DN | 312 | 203 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
贝尔德糖尿病性肾病DN | 434 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
韦斯顿·维加法(Weston Vegfa)目标3小时 | 74 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng由Foxp3绑定 | 491 | 310 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng Foxp3目标胸腺 | 196 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
促进耐受巨噬细胞DN | 409 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riggi ewing肉瘤祖先DN | 191 | 123 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西部肾上腺皮质肿瘤 | 294 | 199 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Tacker吉西他滨抵抗 | 79 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura MAPK8目标DN | 366 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Han Satb1靶向 | 395 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Han Satb1靶向DN | 442 | 275 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
flt3 itd的valk aml | 40 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
钱德兰转移DN | 306 | 191 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 | 445 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染4小时DN | 254 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stambolsky对维生素D3的反应 | 84 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hirsch细胞转换签名 | 242 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ewsr1 fli1融合DN的TORCHIA目标 | 321 | 200 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smirnov对IR 6小时的回应 | 166 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-103/107 | 903 | 909 | M8 | HSA-MIR-103脑 | agcagcauuguacggcuauga |
HSA-MIR-107脑 | agcagcauuguacgggcuauca | ||||
mir-124/506 | 398 | 404 | M8 | HSA-MIR-506 | uaaggcacccuucugugaguaga |
HSA-MIR-124脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
mir-142-3p | 1432 | 1439 | 1A,M8 | HSA-MIR-142-3P | uguaguuuccuacuuuaugga |
mir-23 | 1608 | 1615年 | 1A,M8 | HSA-MIR-23A脑 | aucacauugccagggauucc |
HSA-MIR-23B脑 | aucacauugccagggauuacc | ||||
HSA-MIR-23A脑 | aucacauugccagggauucc | ||||
HSA-MIR-23B脑 | aucacauugccagggauuacc | ||||
HSA-MIR-23A脑 | aucacauugccagggauucc | ||||
HSA-MIR-23B脑 | aucacauugccagggauuacc | ||||
mir-323 | 1608 | 1614年 | 1a | HSA-MIR-323脑 | gcacauuacggucgaccucu |
HSA-MIR-323脑 | gcacauuacggucgaccucu | ||||
HSA-MIR-323脑 | gcacauuacggucgaccucu | ||||
mir-34b | 1067 | 1073 | 1a | HSA-MIR-34B | uaggcagugucauagcugauug |
mir-361 | 1622 | 1629年 | 1A,M8 | HSA-MIR-361脑 | uuaucagaaucuccagggguac |
mir-369-3p | 1110 | 1117 | 1A,M8 | HSA-MIR-369-3P | aauauacaugguugaucuuu |
mir-374 | 1111 | 1117 | M8 | HSA-MIR-374 | uuauaauacaAccugauaagug |
HSA-MIR-374 | uuauaauacaAccugauaagug | ||||
mir-409-3p | 23 | 29 | M8 | HSA-MIR-409-3P | cgauauguugcucggugaaccccu |
mir-410 | 1014 | 1020 | 1a | HSA-MIR-410 | aauauaacacagauggcugu |
HSA-MIR-410 | aauauaacacagauggcugu | ||||
HSA-MIR-410 | aauauaacacagauggcugu | ||||
mir-505 | 438 | 444 | 1a | HSA-MIR-505 | gucaacuugcugguuccuc |
mir-539 | 1799年 | 1805年 | 1a | HSA-MIR-539 | ggagaauuauccuuggugugu |