基因页面:PDE4D
总结吗?
| GeneID | 5144年 |
| 象征 | PDE4D |
| 同义词 | ACRDYS2 | DPDE3 | HSPDE4D | PDE43 | PDE4DN2 | STRK1 |
| 描述 | 磷酸二酯酶4 d |
| 参考 | MIM: 600129|HGNC: HGNC: 8783|运用:ENSG00000113448|HPRD: 02530|织女:OTTHUMG00000162218 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 5 12 |
| 胎儿β | 1.598 |
| 支持 | G2Cdb.humanPSD G2Cdb.humanPSP |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:GWAScat | 全基因组关联研究 | 这个数据集包含560个snp与精神分裂症有关。总共有486个基因映射到这些snp在50 kb。 | |
| 简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| 简历:PheWAS | Phenome-wide协会研究(PheWAS) | 157个snp与精神分裂症有关 | 1 |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
简历:PheWAS
简历:PheWAS| SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | P | 函数 | 基因 | 上/下距离 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs1823068 | 5 | 58676049 | 零 | 1.551 | PDE4D | 零 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| KRT5 | 0.78 | 0.78 |
| TUBA1 | 0.78 | 0.84 |
| CHN1 | 0.77 | 0.83 |
| FAM131A | 0.76 | 0.75 |
| ALDOA | 0.76 | 0.83 |
| GOT1 | 0.76 | 0.77 |
| C8orf46 | 0.76 | 0.81 |
| RUNDC3A | 0.75 | 0.76 |
| ATP6V1E1 | 0.75 | 0.71 |
| MDH1 | 0.75 | 0.75 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| KIAA1949 | -0.54 | -0.56 |
| TUBB2B | -0.53 | -0.64 |
| SH3BP2 | -0.53 | -0.67 |
| PDE9A | -0.53 | -0.65 |
| SH2D2A | -0.52 | -0.65 |
| UPF3A | -0.52 | -0.66 |
| ZNF311 | -0.51 | -0.50 |
| FADS2 | -0.51 | -0.56 |
| CARHSP1 | -0.51 | -0.66 |
| SH2B2 | -0.51 | -0.63 |
第四部分,注释蛋白质间交互作用
| 扶少团团员 | 别名B | 官方全名B | 实验 | 源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| ABL1 | ABL | JTK7 | bcr / ABL | c-ABL | p150 | v-abl | c-abl致癌基因1受体酪氨酸激酶 | Abl PDE4D4交互。这种交互是仿照人类PDE4D4之间的交互和abl从一个未指明的物种。 | 绑定 | 10571082 |
| AKAP6 | ADAP100 | ADAP6 | AKAP100 | KIAA0311 | MGC165020 | PRKA6 | mAKAP | 一个激酶(PRKA)锚蛋白6 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11296225 |
| ARRB1 | ARB1 | ARR1 | arrestin,β1 | 的氨基酸PDE4D5与Beta-Arrestin 1。 | 绑定 | 14500724 |
| ARRB2 | ARB2 | ARR2 | BARR2 | DKFZp686L0365 | arrestin,β2 | PDE4D5与Beta-Arrestin 2。 | 绑定 | 14500724 |
| 菲英岛 | MGC45350 |背景下| SYN | 菲英岛相关癌基因SRC, FGR,是的 | PDE4D4与菲英岛SH3域。 | 绑定 | 10571082 |
| GNB2L1 | Gnb2-rs1 | H12.3 | HLC-7 | PIG21 | RACK1 | 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白(G蛋白),β多肽2 1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10329691 |
| GNB2L1 | Gnb2-rs1 | H12.3 | HLC-7 | PIG21 | RACK1 | 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白(G蛋白),β多肽2 1 | RACK1与PDE4D5交互。 | 绑定 | 10329691|11516626 |12193273 |
| GRB2 | 灰| EGFRBP-GRB2 | Grb3-3 | MST084 | MSTP084 | 生长因子receptor-bound蛋白2 | PDE4D4与Grb2交互。这种交互是仿照人类PDE4D4之间的交互和Grb2从一个未指明的物种。 | 绑定 | 10571082 |
| 林恩 | FLJ26625 | JTK8 | v-yes-1山口肉瘤病毒致癌基因同族体有关 | PDE4D4与林恩SH3域。 | 绑定 | 10571082 |
| PDE4D | DPDE3 | HSPDE4D | PDE4DN2 | STRK1 | 磷酸二酯酶4 d, cAMP-specific(磷酸二酯酶E3傻瓜同族体,果蝇) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 12387865 |
| PDE4DIP | CMYA2 | DKFZp781J054 | MGC75440 | MMGL | 磷酸二酯酶4 d相互作用的蛋白质 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 11134006 |
| PIK3CG | PI3CG | PI3K | PI3Kgamma | PIK3 | phosphoinositide-3-kinase、催化、伽马多肽 | PDE4D4与PI3K交互。这种交互是模仿了人类PDE4D4和PI3K从一个未指明的物种之间的相互作用。 | 绑定 | 10571082 |
| SPTAN1 | (α)II-SPECTRIN | FLJ44613 |近地小行星 | 血影蛋白、αnon-erythrocytic 1 (alpha-fodrin) | PDE4D4与Fodrin交互。这种交互是仿照人类PDE4D4之间的交互和Fodrin从一个未指明的物种。 | 绑定 | 10571082 |
| SRC | c - src ASV | SRC1 | | p60-Src | v - src肉瘤(Schmidt-Ruppin a)病毒致癌基因相同器官(禽流感) | PDE4D4与Src SH3域。 | 绑定 | 10571082 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KEGG嘌呤代谢 | 159年 | 96年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME GPCR信号的 | 920年 | 449年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME阿片类信号 | 78年 | 56 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME DARPP 32事件 | 25 | 20. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 下游REACTOME GPCR信号 | 805年 | 368年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME Gα信号事件 | 121年 | 82年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 中村肿瘤区周边与中央DN | 634年 | 384年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PICCALUGA ANGIOIMMUNOBLASTIC淋巴瘤DN | 136年 | 86年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ONKEN葡萄膜黑色素瘤DN | 526年 | 357年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DAVICIONI PAX FOXO1融合DN的目标 | 68年 | 49 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MULLIGHAN NPM1突变签名1 DN | 126年 | 86年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MULLIGHAN NPM1签名3 DN | 162年 | 116年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SENESE HDAC1和HDAC2目标 | 238年 | 144年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 萨瓦特结直肠腺瘤大小DN | 14 | 8 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PROVENZANI转移DN | 136年 | 94年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 林格伦膀胱癌集群3 DN | 229年 | 142年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| ROPERO HDAC2目标 | 114年 | 71年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 康被叔DN | 102年 | 67年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染血巨细胞病毒16人力资源 | 225年 | 139年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DEBIASI由呼肠孤病毒感染细胞凋亡 | 314年 | 201年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 陆衰老的大脑DN | 153年 | 120年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿尔茨海默病DN布莱洛克的 | 1237年 | 837年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 陈使用支持心脏衰竭的DN | 42 | 32 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 崔TCF21目标2 DN | 830年 | 547年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿尔茨海默病了布莱洛克的 | 1691年 | 1088年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KRIGE TOSEDOSTAT反应6小时 | 953年 | 554年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KRIGE TOSEDOSTAT反应24小时 | 783年 | 442年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 海勒HDAC DN的目标 | 292年 | 189年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 海勒HDAC目标被甲基化DN | 281年 | 179年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MASSARWEH他莫昔芬耐了 | 578年 | 341年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MATZUK排卵 | 14 | 10 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BOYLAN多发性骨髓瘤C DN | 59 | 39 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| YOSHIMURA MAPK8目标了 | 1305年 | 895年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李SP4胸腺细胞 | 14 | 11 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 李最近胸腺移民 | 227年 | 128年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 汉SATB1 DN的目标 | 442年 | 275年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 罗马胰岛素在肌肉的目标 | 442年 | 263年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 中村脂肪形成早期起 | 66年 | 44 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染血巨细胞病毒4人力资源 | 55 | 41 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GOBERT少突细胞分化DN | 1080年 | 713年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| FORTSCHEGGER PHF8目标了 | 279年 | 155年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PEDRIOLI MIR31目标了 | 221年 | 120年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 杜兰基质年代了 | 297年 | 194年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由1日EGF ZWANG瞬变脉冲 | 1839年 | 928年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |