基因页面:HPCAL4
总结吗?
| GeneID | 51440年 |
| 象征 | HPCAL4 |
| 同义词 | HLP4 |
| 描述 | hippocalcin 4 |
| 参考 | HGNC: HGNC: 18212|运用:ENSG00000116983|HPRD: 17113|织女:OTTHUMG00000009246 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 1 p34.2 |
| 帕斯卡假定值 | 0.197 |
| 夏洛克假定值 | 0.622 |
| 胎儿β | -2.453 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 尾状基底神经节 |
| 支持 | 细胞内信号转导 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 1 |
| GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg22827640 | 1 | 40157125 | HPCAL4 | 1.98 e-8 | -0.01 | 6.9 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005509 | 钙离子结合 | 助教 | 10520747 | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0007417 | 中枢神经系统开发 | 助教 | 大脑(术语层面:6) | 10520747 |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005622 | 细胞内的 | 艾达 | 11256614 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| LASTOWSKA神经母细胞瘤拷贝数DN | 800年 | 473年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金正日MYCL1放大目标 | 13 | 11 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH SUZ12目标 | 1038年 | 678年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH速度的目标 | 1062年 | 725年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH ES与H3K27ME3 | 1118年 | 744年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH PRC2目标 | 652年 | 441年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL反式 | 882年 | 572年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MOREAUX TACI了多发性骨髓瘤 | 412年 | 249年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿尔茨海默病DN布莱洛克的 | 1237年 | 837年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| LEIN本地化的远端和近端树突 | 17 | 12 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| YOSHIMURA MAPK8目标了 | 1305年 | 895年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森人大HCP H3K27ME3 | 341年 | 243年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| VERHAAK胶质母细胞瘤神经 | 129年 | 85年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir - 151 | 1557年 | 1563年 | m8 | hsa - mir - 151大脑 | ACUAGACUGAAGCUCCUUGAGG |
| miR-22 | 2502年 | 2508年 | m8 | hsa-miR-22大脑 | AAGCUGCCAGUUGAAGAACUGU |
| miR-29 | 530年 | 537年 | 1、m8 | hsa-miR-29a深圳 | UAGCACCAUCUGAAAUCGGUU |
| hsa-miR-29b深圳 | UAGCACCAUUUGAAAUCAGUGUU | ||||
| hsa-miR-29c深圳 | UAGCACCAUUUGAAAUCGGU | ||||
| mir - 335 | 1535年 | 1541年 | 1 | hsa - mir - 335大脑 | UCAAGAGCAAUAACGAAAAAUGU |
| miR-7 | 2435年 | 2442年 | 1、m8 | hsa-miR-7深圳 | UGGAAGACUAGUGAUUUUGUUG |