基因页：PDE6A
概括？
| 基因 | 5145 |
| 象征 | PDE6A |
| 同义词 | CGPR-A | PDEA | RP43 |
| 描述 | 磷酸二酯酶6A |
| 参考 | MIM：180071|HGNC：HGNC：8785|ENSEMBL：ENSG00000132915|HPRD：01570|Vega：Otthumg00000130047 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 5Q31.2-Q34 |
| Pascal P值 | 0.018 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.0032 | |
| gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） | PSR：0.01718 | |
| GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析（所有样品） | PSR：0.00459 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS4864466 | CHR4 | 54403975 | PDE6A | 5145 | 0.12 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| GO：0016787 | 水解酶活性 | IEA | - | |
| GO：0047555 | 3'，5'-循环GMP磷酸二酯酶活性 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007165 | 信号转导 | IEA | - | |
| 去：0007601 | 视觉感知 | 塔斯 | 7493036 | |
| GO：0050896 | 对刺激的反应 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005886 | 质膜 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Kegg Purine代谢 | 159 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| St Wnt Ca2环状GMP途径 | 20 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID Rhodopsin途径 | 24 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome CGMP效应 | 19 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组一氧化氮刺激鸟苷酸环化酶 | 25 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome血小板稳态 | 78 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组止血 | 466 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 剑麻结肠直肠腺瘤DN | 291 | 176 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 奥多内尔转移 | 82 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shen Smarca2靶向DN | 357 | 212 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nguyen Notch1靶向DN | 86 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hoegerkorp CD44靶向直接 | 27 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Jazaeri乳腺癌BRCA1 vs BRCA2 DN | 43 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ramaswamy转移DN | 61 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 寄养KDM1A靶向 | 266 | 142 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |