基因页面:LCMT1
总结吗?
GeneID | 51451年 |
象征 | LCMT1 |
同义词 | cgi - 68 | LCMT | PPMT1 |
描述 | 白氨酸羧基甲基转移酶1 |
参考 | MIM: 610286|HGNC: HGNC: 17557|运用:ENSG00000205629|HPRD: 17266|织女:OTTHUMG00000177182 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 16 p12.1 |
帕斯卡假定值 | 0.823 |
夏洛克假定值 | 0.73 |
胎儿β | -0.497 |
DMG | 2(#研究) |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 2 |
DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 2 |
GSMA_IIE | 基因组扫描荟萃分析(欧洲血统的样品) | Psr: 0.01775 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg03437924 | 16 | 25123326 | LCMT1 | 3.07 e-5 | -0.336 | 0.019 | DMG: Wockner_2014 |
cg16611736 | 16 | 25123254 | LCMT1 | 9.21 e-9 | -0.015 | 4.15 e-6 | DMG: Jaffe_2016 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/LCMT1_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003880 | 蛋白c端羧基甲基转移酶的活动 | 艾达 | 10600115 | |
去:0005515 | 蛋白结合 | 新闻学会 | 16189514 | |
去:0016740 | 转移酶的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0008757 | S-adenosylmethionine-dependent甲基转移酶活性 | 助教 | 10600115 | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0006464 | 蛋白质改性过程 | 助教 | 10600115 | |
去:0006481 | c端蛋白质氨基酸甲基化 | 艾达 | 10600115 |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG组氨酸代谢 | 29日 | 19 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KEGG酪氨酸代谢 | 42 | 30. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
KEGG SELENOAMINO酸代谢 | 26 | 18 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
TIEN肠道益生菌6小时DN | 167年 | One hundred. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
由阿霉素GRAESSMANN细胞凋亡 | 1142年 | 669年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
HUMMERICH皮肤癌症恶化DN | One hundred. | 64年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
伊万诺娃早期造血祖 | 532年 | 309年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
程印的雌二醇 | 110年 | 68年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
钟泡细胞毒性高 | 134年 | 84年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SHEDDEN肺癌A5生存良好 | 70年 | 32 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
吉冈肝癌早期复发 | 40 | 23 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
棕熊短波紫外线反应迟 | 1137年 | 655年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |