概括
基因 51528
象征 jkamp
同义词 C14orf100 | CDA06 | HSPC213 | HSPC327 | JAMP
描述 JNK1/MAPK8相关的膜蛋白
参考 MIM:611176|HGNC:HGNC:20184|Ensembl:ENSG00000050130|HPRD:12623|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 14Q23.1
Pascal P值 0.005
Sherlock P值 8.849e-5
胎儿β 0.39
主持人 海马
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS1253165 CHR14 59883137 jkamp 51528 0.01 顺式
RS1271183 CHR14 59891790 jkamp 51528 0.01 顺式
RS17834074 CHR14 59891982 jkamp 51528 0.04 顺式
RS1253170 CHR14 59893646 jkamp 51528 0.01 顺式
RS1273156 CHR14 59899933 jkamp 51528 0.01 顺式
RS2774052 CHR14 59900019 jkamp 51528 0.01 顺式
RS1262135 CHR14 59909767 jkamp 51528 0.01 顺式
RS10136708 CHR14 59927375 jkamp 51528 2.522E-6 顺式
RS8660 CHR14 59939726 jkamp 51528 4.243E-4 顺式
RS1253103 CHR14 59949447 jkamp 51528 7.45e-7 顺式
RS7151295 CHR14 59978071 jkamp 51528 2.338e-5 顺式
RS6573270 CHR14 60029166 jkamp 51528 3.51E-4 顺式
RS4901941 CHR14 60031644 jkamp 51528 1.683E-6 顺式
RS17255933 CHR14 60042938 jkamp 51528 0 顺式
RS7143940 CHR14 60047544 jkamp 51528 0 顺式
RS11158264 CHR14 60050255 jkamp 51528 0.03 顺式
RS7157903 CHR14 60051459 jkamp 51528 0 顺式
RS10139045 CHR14 60060572 jkamp 51528 0.01 顺式
RS473689 Chr11 103740691 jkamp 51528 0.07 反式
RS10136708 CHR14 59927375 jkamp 51528 4.347E-4 反式
RS8660 CHR14 59939726 jkamp 51528 0.03 反式
RS1253103 CHR14 59949447 jkamp 51528 1.423E-4 反式
RS7151295 CHR14 59978071 jkamp 51528 0 反式
RS6573270 CHR14 60029166 jkamp 51528 0.03 反式
RS4901941 CHR14 60031644 jkamp 51528 3.065e-4 反式
RS17255933 CHR14 60042938 jkamp 51528 0.17 反式
RS7143940 CHR14 60047544 jkamp 51528 0.14 反式
RS7157903 CHR14 60051459 jkamp 51528 0.18 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -
去:0005886 质膜 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
liang造血细胞数量大与微小 44 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
带有E盒的WEI MYCN目标 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除DN 517 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
郭十六进制靶向DN 65 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向DN 314 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stearman肺癌早期与晚期 125 89 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Massarweh tamoxifen抗性 578 341 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CCND1和CDK4 DN的Molenaar靶标 58 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足型haptotaxis dn 668 419 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由SALL4同工型绑定的RAO A 182 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-182 17 23 1a HSA-MIR-182 uuuggcaaugguagaacucaca
mir-410 541 547 1a HSA-MIR-410 aauauaacacagauggcugu
mir-96 17 23 1a HSA-MIR-96 uuuggcacuagcacauuuuugc