基因页:jkamp
概括?
基因 | 51528 |
象征 | jkamp |
同义词 | C14orf100 | CDA06 | HSPC213 | HSPC327 | JAMP |
描述 | JNK1/MAPK8相关的膜蛋白 |
参考 | MIM:611176|HGNC:HGNC:20184|Ensembl:ENSG00000050130|HPRD:12623| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 14Q23.1 |
Pascal P值 | 0.005 |
Sherlock P值 | 8.849e-5 |
胎儿β | 0.39 |
主持人 | 海马 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS1253165 | CHR14 | 59883137 | jkamp | 51528 | 0.01 | 顺式 | ||
RS1271183 | CHR14 | 59891790 | jkamp | 51528 | 0.01 | 顺式 | ||
RS17834074 | CHR14 | 59891982 | jkamp | 51528 | 0.04 | 顺式 | ||
RS1253170 | CHR14 | 59893646 | jkamp | 51528 | 0.01 | 顺式 | ||
RS1273156 | CHR14 | 59899933 | jkamp | 51528 | 0.01 | 顺式 | ||
RS2774052 | CHR14 | 59900019 | jkamp | 51528 | 0.01 | 顺式 | ||
RS1262135 | CHR14 | 59909767 | jkamp | 51528 | 0.01 | 顺式 | ||
RS10136708 | CHR14 | 59927375 | jkamp | 51528 | 2.522E-6 | 顺式 | ||
RS8660 | CHR14 | 59939726 | jkamp | 51528 | 4.243E-4 | 顺式 | ||
RS1253103 | CHR14 | 59949447 | jkamp | 51528 | 7.45e-7 | 顺式 | ||
RS7151295 | CHR14 | 59978071 | jkamp | 51528 | 2.338e-5 | 顺式 | ||
RS6573270 | CHR14 | 60029166 | jkamp | 51528 | 3.51E-4 | 顺式 | ||
RS4901941 | CHR14 | 60031644 | jkamp | 51528 | 1.683E-6 | 顺式 | ||
RS17255933 | CHR14 | 60042938 | jkamp | 51528 | 0 | 顺式 | ||
RS7143940 | CHR14 | 60047544 | jkamp | 51528 | 0 | 顺式 | ||
RS11158264 | CHR14 | 60050255 | jkamp | 51528 | 0.03 | 顺式 | ||
RS7157903 | CHR14 | 60051459 | jkamp | 51528 | 0 | 顺式 | ||
RS10139045 | CHR14 | 60060572 | jkamp | 51528 | 0.01 | 顺式 | ||
RS473689 | Chr11 | 103740691 | jkamp | 51528 | 0.07 | 反式 | ||
RS10136708 | CHR14 | 59927375 | jkamp | 51528 | 4.347E-4 | 反式 | ||
RS8660 | CHR14 | 59939726 | jkamp | 51528 | 0.03 | 反式 | ||
RS1253103 | CHR14 | 59949447 | jkamp | 51528 | 1.423E-4 | 反式 | ||
RS7151295 | CHR14 | 59978071 | jkamp | 51528 | 0 | 反式 | ||
RS6573270 | CHR14 | 60029166 | jkamp | 51528 | 0.03 | 反式 | ||
RS4901941 | CHR14 | 60031644 | jkamp | 51528 | 3.065e-4 | 反式 | ||
RS17255933 | CHR14 | 60042938 | jkamp | 51528 | 0.17 | 反式 | ||
RS7143940 | CHR14 | 60047544 | jkamp | 51528 | 0.14 | 反式 | ||
RS7157903 | CHR14 | 60051459 | jkamp | 51528 | 0.18 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/JKAMP_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
去:0005886 | 质膜 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
liang造血细胞数量大与微小 | 44 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
带有E盒的WEI MYCN目标 | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stark前额叶皮层22Q11删除DN | 517 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
郭十六进制靶向DN | 65 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
道格拉斯BMI1靶向DN | 314 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stearman肺癌早期与晚期 | 125 | 89 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Massarweh tamoxifen抗性 | 578 | 341 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CCND1和CDK4 DN的Molenaar靶标 | 58 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足型haptotaxis dn | 668 | 419 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向 | 682 | 433 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由SALL4同工型绑定的RAO A | 182 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-182 | 17 | 23 | 1a | HSA-MIR-182 | uuuggcaaugguagaacucaca |
mir-410 | 541 | 547 | 1a | HSA-MIR-410 | aauauaacacagauggcugu |
mir-96 | 17 | 23 | 1a | HSA-MIR-96脑 | uuuggcacuagcacauuuuugc |