基因页：PDGFRA
概括?
| 基因ID | 5156 |
| Symbol | PDGFRA |
| 同义词 | CD140A|GAS9|PDGFR-2|PDGFR2|RHEPDGFRA |
| 描述 | 血小板衍生的生长因子受体α |
| 参考 | MIM：173490|HGNC：HGNC：8803|Ensembl:ENSG00000134853|HPRD：01429|Vega:OTTHUMG00000128699 |
| 基因type | protein-coding |
| 地图位置 | 4q12 |
| Pascal P值 | 0.007 |
| Sherlock P值 | 0.666 |
| Fetal beta | -0.927 |
| DMG | 1（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因set name | 基因组方法 | 描述 | Info |
|---|---|---|---|
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | gwasdbrecords for schizophrenia | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| CV:PheWAS | 全球整个关联研究（PHEWAS） | 157个与精神分裂症相关的SNP | 1 |
| DMG:Jaffe_2016 | Genome-wide DNA methylation analysis | This dataset includes 2,104 probes/CpGs associated with SZ patients (n=108) compared to 136 controls at Bonferroni-adjusted P < 0.05. | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
CV:PheWAS
CV:PheWAS| SNP ID | Chromosome | Position | 等位基因 | P | Function | 基因 | Up/Down Distance |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs7677751 | 4 | 0 | null | 1.611 | PDGFRA | null |
差异甲基化基因
| 探测 | Chromosome | Position | 最近的基因 | P (dis) | beta（dis） | FDR (dis) | Study |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG05340395 | 4 | 54930748 | PDGFRA | 7.5e-11 | -0.017 | 4.34E-7 | DMG:Jaffe_2016 |
Section II. Transcriptome annotation
基因ral gene expression (GTEx)
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.
Top co-expressed genes in brain regions
| Top 10 positively co-expressed genes | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | Spearman's Correlation |
| KLHDC3 | 0.87 | 0.86 |
| SCG5 | 0.86 | 0.84 |
| SLC25A4 | 0.85 | 0.86 |
| PGK1 | 0.84 | 0.85 |
| TMEM111 | 0.84 | 0.82 |
| FLOT1 | 0.84 | 0.81 |
| ACTR1B | 0.83 | 0.86 |
| TRUB2 | 0.82 | 0.77 |
| SH3GLB2 | 0.82 | 0.81 |
| FOXRED1 | 0.82 | 0.77 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | Spearman's Correlation |
| AF347015.18 | -0.52 | -0.34 |
| AC010300.1 | -0.47 | -0.49 |
| NSBP1 | -0.44 | -0.42 |
| AL139819.3 | -0.43 | -0.36 |
| AF347015.26 | -0.43 | -0.25 |
| C10orf108 | -0.43 | -0.40 |
| AC100783.1 | -0.42 | -0.35 |
| MT-ATP8 | -0.41 | -0.22 |
| AF347015.8 | -0.40 | -0.24 |
| AF347015.21 | -0.40 | -0.20 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| Interactors | Aliases B | Official full name B | Experimental | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| CAV1 | CAV | MSTP085 | VIP21 | caveolin 1, caveolae protein, 22kDa | Affinity Capture-Western Co-fractionation Reconstituted Complex |
BioGRID | 10066366 |
| cav3 | LGMD1C | LQT9 | MGC126100 | MGC126101 | MGC126129 | VIP-21 | VIP21 | 小窝林3 | Reconstituted Complex | BioGRID | 10066366 |
| CBL | C-CBL |CBL2 |RNF55 | Cas-Br-M (murine) ecotropic retroviral transforming sequence | Affinity Capture-Western Reconstituted Complex |
BioGRID | 9234717 |
| CRK | CRKII | V-CRK肉瘤病毒CT10 ONCOGENE同源物（Avian） | - | HPRD，Biogrid | 9546424|10733900 |
| CRKL | - | V-CRK肉瘤病毒CT10癌基因同源物（Avian）类似 | - | HPRD，Biogrid | 9546424 |
| GRB14 | - | 生长因子受体结合蛋白14 | - | HPRD | 8647858 |
| GRB2 | ASH | EGFRBP-GRB2 | Grb3-3 | MST084 | MSTP084 | growth factor receptor-bound protein 2 | Affinity Capture-Western | BioGRID | 8943348 |
| ITGAV | CD51 |DKFZP686A08142 |MSK8 |vnra | integrin, alpha V (vitronectin receptor, alpha polypeptide, antigen CD51) | - | HPRD | 11953315 |
| ITGB3 | CD61 |gp3a |GPIIIA | integrin, beta 3 (platelet glycoprotein IIIa, antigen CD61) | Affinity Capture-Western | BioGRID | 11953315 |
| PDGFA | PDGF-A | PDGF1 | 血小板衍生的生长因子α多肽 | Reconstituted Complex | BioGRID | 2544881 |
| PDGFB | FLJ12858 | PDGF2 | SIS | SSV | c-sis | 血小板衍生的生长因子β多肽（Simian肉瘤病毒（V-SIS）癌基因同源物） | - | HPRD，Biogrid | 2544881 |
| PDGFC | FALLOTEIN | SCDGF | 血小板衍生的生长因子C | - | HPRD | 11342471 |
| PDGFC | FALLOTEIN | SCDGF | 血小板衍生的生长因子C | - | HPRD，Biogrid | 10806482|11297552 |
| PDGFRA | CD140A | MGC74795 | PDGFR2 | Rhe-PDGFRA | 血小板衍生的生长因子受体，α多肽 | Affinity Capture-Western Biochemical Activity 远西方 |
BioGRID | 7523122|7535778 |11046132 |
| PDGFRB | CD140B |JTK12 |PDGF-R-BETA |PDGFR |PDGFR1 | 血小板衍生的生长因子受体，β多肽 | Affinity Capture-Western Reconstituted Complex |
BioGRID | 2542288|7523122 |
| PLCG1 | PLC-II | PLC1 | PLC148 | PLCgamma1 | phospholipase C, gamma 1 | - | HPRD，Biogrid | 7535778 |
| RAPGEF1 | C3G | DKFZp781P1719 | GRF2 | RAP鸟嘌呤核苷酸交换因子（GEF）1 | - | HPRD | 9546424 |
| SHB | RP11-3J10.8 |BA3J10.2 | Src homology 2 domain containing adaptor protein B | - | HPRD | 10837138 |
| SLC9A3R1 | EBP50 |nherf |nherf1 |nphlop2 | 溶质载体家族9（钠/氢交换器），成员3调节器1 | - | HPRD，Biogrid | 11046132|11882663 |
| SNX2 | MGC5204 | TRG-9 | sorting nexin 2 | - | HPRD，Biogrid | 9819414 |
| SNX4 | - | sorting nexin 4 | - | HPRD，Biogrid | 9819414 |
| SNX6 | MGC3157 | MSTP010 | TFAF2 | sorting nexin 6 | - | HPRD，Biogrid | 11279102 |
V.途径注释
| Pathway name | Pathway size | ＃szgr 2.0基因 | Info |
|---|---|---|---|
| KEGG MAPK SIGNALING PATHWAY | 267 | 205 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG CALCIUM SIGNALING PATHWAY | 178 | 134 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG细胞因子细胞因子受体相互作用 | 267 | 161 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG ENDOCYTOSIS | 183 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG FOCAL ADHESION | 201 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg间隙交界处 | 90 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG REGULATION OF ACTIN CYTOSKELETON | 216 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG PATHWAYS IN CANCER | 328 | 259 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG GLIOMA | 65 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG PROSTATE CANCER | 89 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kegg黑色素瘤 | 71 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BIOCARTA CBL PATHWAY | 13 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta ERK途径 | 28 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BIOCARTA PDGF PATHWAY | 32 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BIOCARTA EDG1 PATHWAY | 27 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BIOCARTA RAC1 PATHWAY | 23 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BIOCARTA CDC42RAC PATHWAY | 16 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID ATF2途径 | 59 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID PDGFRA PATHWAY | 22 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PDGF的Reactome信号传导 | 122 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome下游信号转导 | 95 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 西肾上腺皮质标记DN | 20 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Piccaluga血管免疫细胞淋巴瘤 | 205 | 140 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SCHUETZ BREAST CANCER DUCTAL INVASIVE UP | 351 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LEE NEURAL CREST STEM CELL UP | 146 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim WT1靶向 | 214 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KIM WT1 TARGETS 12HR UP | 162 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Morosetti facioscapulohumeral肌肉分散 | 20 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KOKKINAKIS METHIONINE DEPRIVATION 48HR UP | 128 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kokkinakis甲硫氨酸剥夺96小时 | 117 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CHEBOTAEV GR TARGETS UP | 77 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MARKEY RB1 CHRONIC LOF UP | 115 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CONCANNON APOPTOSIS BY EPOXOMICIN DN | 172 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN DN | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GRAESSMANN RESPONSE TO MC AND DOXORUBICIN DN | 770 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GAUSSMANN MLL AF4 FUSION TARGETS E UP | 97 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BERENJENO TRANSFORMED BY RHOA FOREVER UP | 19 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BERENJENO TRANSFORMED BY RHOA DN | 394 | 258 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| JOHANSSON GLIOMAGENESIS BY PDGFB UP | 58 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ZIRN Tretinoin响应WT1 UP | 23 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KAN对砷三氧化物的反应 | 123 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WONG ENDMETRIUM CANCER DN | 82 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HUMMERICH SKIN CANCER PROGRESSION DN | 100 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lindgren膀胱癌簇2B | 392 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HERNANDEZ MITOTIC ARREST BY DOCETAXEL 1 DN | 38 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hernandez异常有丝分裂由DOCETACEL 2NM DN | 25 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kang lith pdgfra up | 50 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martoriati MDM4靶向神经上皮DN | 164 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MARTORIATI MDM4 TARGETS FETAL LIVER DN | 514 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 霍林青春期乳腺 | 69 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 留置权乳腺癌变质 | 35 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten EZH2靶向DN | 1024 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WEI MIR34A TARGETS | 148 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath PRC2目标 | 652 | 441 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TCGA GLIOBLASTOMA COPY NUMBER UP | 75 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 丁肺癌显着突变 | 26 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Jechlinger上皮到间充质转变 | 71 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NING CHRONIC OBSTRUCTIVE PULMONARY DISEASE DN | 121 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BROCKE APOPTOSIS REVERSED BY IL6 | 144 | 98 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| IIZUKA LIVER CANCER EARLY RECURRENCE | 11 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Coller MYC目标DN | 9 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| AFFAR YY1 TARGETS DN | 234 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 牙肺纹状横纹肌肉瘤DN | 408 | 274 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染14小时DN | 298 | 200 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| JIANG VHL TARGETS | 138 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 王顺铂反应和XPC DN | 228 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zhu CMV 24小时DN | 91 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GENTILE UV RESPONSE CLUSTER D6 | 37 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 外邦紫外线高剂量DN | 312 | 203 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zhu CMV全部DN | 128 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HEDENFALK BREAST CANCER BRCA1 VS BRCA2 | 163 | 113 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BURTON ADIPOGENESIS PEAK AT 0HR | 63 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DASU IL6信号疤痕DN | 16 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Browne HCMV感染12小时DN | 101 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MAHAJAN RESPONSE TO IL1A UP | 81 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MASSARWEH TAMOXIFEN RESISTANCE UP | 578 | 341 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 麦凯布（McCabe）由HOXC6绑定 | 469 | 239 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| RIGGI EWING SARCOMA PROGENITOR DN | 191 | 123 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MCCABE HOXC6 TARGETS DN | 21 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MCCABE HOXC6 TARGETS CANCER UP | 31 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 乳腺癌萧述三腔的DN | 564 | 326 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SMID BREAST CANCER NORMAL LIKE UP | 476 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SMID BREAST CANCER BASAL UP | 648 | 398 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BONOME OVARIAN CANCER SURVIVAL SUBOPTIMAL DEBULKING | 510 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ZHENG GLIOBLASTOMA PLASTICITY UP | 250 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BOQUEST STEM CELL UP | 260 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LABBE TGFB1 TARGETS UP | 102 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WEST ADRENOCORTICAL TUMOR DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| QI PLASMACYTOMA DN | 100 | 63 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿隆索转移神经 | 18 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WANG TUMOR INVASIVENESS DN | 210 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GRESHOCK CANCER COPY NUMBER UP | 323 | 240 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| VART KSHV感染血管生成标记 | 165 | 118 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| VART KSHV INFECTION ANGIOGENIC MARKERS DN | 138 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YOSHIMURA MAPK8 TARGETS DN | 366 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| RUIZ TNC TARGETS UP | 153 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SWEET LUNG CANCER KRAS DN | 435 | 289 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MEISSNER BRAIN HCP WITH H3K4ME3 AND H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TAVAZOIE METASTASIS | 108 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MILI PSEUDOPODIA CHEMOTAXIS DN | 457 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DING LUNG CANCER BY MUTATION RATE | 20 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 开罗肝脏开发 | 166 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DANG REGULATED BY MYC DN | 253 | 192 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Karlsson TGFB1靶向DN | 207 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hoelzel NF1靶向DN | 115 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BRUINS UVC RESPONSE VIA TP53 GROUP B | 549 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KIM GLIS2 TARGETS UP | 84 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Katsanou Elavl1靶向DN | 148 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D | 882 | 506 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Plasari TGFB1目标10小时DN | 244 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| plasari nfic目标基础DN | 18 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Plasari TGFB1通过NFIC 1小时信号传导 | 33 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Plasari TGFB1通过NFIC 10HR DN信号传导 | 30 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YU BAP1 TARGETS | 29 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Durand Stroma S向上 | 297 | 194 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |