概括
基因 5157
象征 PDGFRL
同义词 pdgrl | prlts
描述 血小板衍生的生长因子受体像
参考 MIM:604584|HGNC:HGNC:8805|ENSEMBL:ENSG00000104213|HPRD:05206|Vega:Otthumg00000130818
基因类型 蛋白质编码
地图位置 8p22-p21.3
Pascal P值 0.071
胎儿β -0.349
DMG 1(#研究)
主持人 小脑
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.031
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) PSR:0.00057
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.03086

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG10501177 8 17435088 PDGFRL 2.3e-8 -0.014 7.61E-6 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17131472 CHR1 91962966 PDGFRL 5157 0.07 反式
RS2976809 CHR3 125451738 PDGFRL 5157 0.01 反式
RS16889842 CHR4 9872012 PDGFRL 5157 0.01 反式
RS12647883 CHR4 9878463 PDGFRL 5157 0.14 反式
RS4033102 CHR4 111784204 PDGFRL 5157 0.16 反式
RS509952 CHR4 111788169 PDGFRL 5157 0.16 反式
RS313946 CHR4 113975904 PDGFRL 5157 0 反式
RS657141 CHR4 113981041 PDGFRL 5157 0.12 反式
RS778995 0 PDGFRL 5157 0.2 反式
RS17056435 CHR5 158453782 PDGFRL 5157 0.04 反式
RS6920042 CHR6 67907570 PDGFRL 5157 0.02 反式
RS6455226 CHR6 67930295 PDGFRL 5157 0.17 反式
RS9451867 CHR6 92659609 PDGFRL 5157 8.474e-4 反式
RS10958892 Chr9 10125117 PDGFRL 5157 0.07 反式
RS10958896 Chr9 10126894 PDGFRL 5157 0.08 反式
RS10958899 Chr9 10128700 PDGFRL 5157 0.09 反式
RS10958907 Chr9 10131580 PDGFRL 5157 0.08 反式
RS10958910 Chr9 10134759 PDGFRL 5157 0.17 反式
RS998410 Chr9 117622673 PDGFRL 5157 0.05 反式
RS9423711 Chr10 2574802 PDGFRL 5157 0.07 反式
RS10747972 0 PDGFRL 5157 0.04 反式
RS11112163 CHR12 105072508 PDGFRL 5157 0.07 反式
RS9551590 CHR13 29589464 PDGFRL 5157 0 反式
RS10142086 CHR14 35135892 PDGFRL 5157 0.18 反式
RS2093759 CHR14 97171024 PDGFRL 5157 0.03 反式
RS17244419 CHR14 97171074 PDGFRL 5157 4.64E-4 反式
RS7177212 CHR15 34425413 PDGFRL 5157 0.03 反式
RS13380712 CHR16 25601181 PDGFRL 5157 0.2 反式
RS16961159 CHR16 59561686 PDGFRL 5157 0.19 反式
RS17841422 CHR17 20969134 PDGFRL 5157 0.05 反式
RS16977927 CHR17 72154232 PDGFRL 5157 0.02 反式
RS7236104 CHR18 14032818 PDGFRL 5157 0.03 反式
RS11873703 CHR18 61448702 PDGFRL 5157 0.1 反式
RS6095741 CHR20 48666589 PDGFRL 5157 1.51E-4 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Med23 0.92 0.94
TTC17 0.92 0.93
C21orf66 0.92 0.93
Fignl1 0.92 0.93
ZC3H7A 0.92 0.94
hars2 0.91 0.91
ZNF211 0.91 0.91
palb2 0.91 0.94
CCDC82 0.90 0.92
ZNF23 0.90 0.91
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.31 -0.77 -0.86
MT-CO2 -0.77 -0.86
ifi27 -0.75 -0.85
AF347015.27 -0.74 -0.82
mt-cyb -0.74 -0.83
AF347015.8 -0.73 -0.85
AF347015.33 -0.73 -0.81
higd1b -0.72 -0.85
AIFM3 -0.72 -0.76
FXYD1 -0.71 -0.82

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005019 血小板衍生的生长因子β受体活性 塔斯 7898930
去:0004992 血小板激活因子受体活性 塔斯 7898930
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0008150 生物_Process nd -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005576 细胞外区域 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Davicioni分子臂与ERMS DN 182 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN 463 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Corre多发性骨髓瘤 74 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1和HDAC2靶向DN 232 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
埃尔维奇缺氧 171 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇1 DN 378 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因
下巴乳腺癌拷贝编号DN 16 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
环氧素DN的浓凋亡 172 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向E 97 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
哈马凋亡通过Trail Up 584 356 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lindgren膀胱癌簇2B 392 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dacosta ercc3等位基因XPCS vs TTD DN 36 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onder CDH1目标2向上 256 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rozanov MMP14靶向 266 171 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染48小时DN 504 323 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损坏4NQO 38 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng DNA损伤DN 195 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向 317 208 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 461 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ambrosini Flavopiridol处理TP53 109 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞向上 260 174 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞培养与新鲜DN 31 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
克莱门特乳腺癌拷贝编号DN 8 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向DN 442 275 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤上课 605 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1目标汇合 567 365 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim Glis2靶向 84 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
wakabayashi脂肪生成PPARG RXRA绑定8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因