基因页:PDGFRB
概括?
基因ID | 5159 |
Symbol | PDGFRB |
同义词 | CD140B | IBGC4 | IMF1 | JTK12 | KOGS | PDGFR | PDGFR-1 | PDGFR1 | PENTT |
描述 | 血小板衍生的生长因子受体β |
参考 | MIM:173410|HGNC:HGNC:8804|Ensembl:ENSG00000113721|HPRD:01423|Vega:Otthumg00000130053 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 5q33.1 |
Pascal P值 | 0.384 |
Sherlock P值 | 0.138 |
胎儿β | -0.07 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | Genome-wide Association Study | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.0032 | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | PSR:0.00459 | |
gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) | PSR:0.01718 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
eQTL annotation
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | pvalue | QVALUE | TSS距离 | eQTL type |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS4501739 | Chrx | 35960848 | PDGFRB | 5159 | 0.16 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![Not available](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PDGFRB_DE_GTEx.png)
基因expression during devlopment (BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
Top 10 positively co-expressed genes | ||
基因 | Pearson's Correlation | Spearman's Correlation |
PRDX3 | 0.79 | 0.78 |
POP4 | 0.78 | 0.75 |
TMEM111 | 0.78 | 0.76 |
glo1 | 0.78 | 0.78 |
MOCS2 | 0.77 | 0.79 |
PEX19 | 0.76 | 0.75 |
SNX17 | 0.76 | 0.77 |
OCIAD1 | 0.76 | 0.74 |
CISD1 | 0.75 | 0.75 |
TMX2 | 0.75 | 0.73 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | Pearson's Correlation | Spearman's Correlation |
AC010300.1 | -0.44 | -0.45 |
AF347015.18 | -0.43 | -0.23 |
HSP90AB4P | -0.43 | -0.44 |
C10orf108 | -0.41 | -0.37 |
AC005921.3 | -0.40 | -0.48 |
AC100783.1 | -0.40 | -0.33 |
FAM159B | -0.37 | -0.33 |
AL031587.2 | -0.37 | -0.30 |
AC135724.1 | -0.37 | -0.40 |
ZNF814 | -0.35 | -0.39 |
第三节。基因本体论注释
Molecular function | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
GO:0005021 | 血管内皮生长因子受体活性 | IEA | - | |
GO:0005019 | 血小板衍生的生长因子β受体活性 | IDA | 2536956 | |
去:0004872 | receptor activity | IEA | - | |
GO:0005161 | platelet-derived growth factor receptor binding | IPI | 2542288 | |
去:0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
去:0004992 | platelet activating factor receptor activity | 塔斯 | 2536956 | |
GO:0016740 | 反式ferase activity | IEA | - | |
GO:0048407 | 血小板衍生的生长因子结合 | IPI | 2536956 | |
Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007165 | signal transduction | 塔斯 | 2536956|10821867 | |
去:0008284 | positive regulation of cell proliferation | IDA | 17470632 | |
GO:0048008 | 血小板来源的生长因子受体信号通路 | IDA | 2536956 | |
GO:0030335 | 细胞迁移的阳性调节 | IDA | 17470632 | |
去:0050730 | 调节肽基 - 酪氨酸磷酸化 | IEA | - | |
GO:0046777 | 蛋白氨基酸自磷酸化 | IDA | 2536956 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0016020 | 膜 | IEA | - | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
Interactors | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
Bag1 | Rap46 | BCl2相关的雅典纪 | - | HPRD | 8947043 |
CAV1 | cav |MSTP085 |VIP21 | 小窝蛋白1,小窝蛋白,22KDA | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Co-fractionation 重构的复合物 |
Biogrid | 10066366 |
cav3 | lgmd1c |LQT9 |MGC126100 |MGC126101 |MGC126129 |VIP-21 |VIP21 | 小窝林3 | 重构的复合物 | Biogrid | 10066366 |
CBL | C-CBL | CBL2 | RNF55 | Cas-Br-M (murine) ecotropic retroviral transforming sequence | c-Cbl interacts with and ubiquitinates PDGF-R-beta. This interaction was modeled on a demonstrated interaction between human c-Cbl and PDGF-R-beta from an unspecified species. | 绑定 | 10514377 |
杯 | FLJ26320 |hep-cop | 涂层蛋白复合物,亚基α | - | HPRD,Biogrid | 9207175 |
COPB1 | COPB |DKFZP761K102 |FLJ10341 | 涂层蛋白复合物,亚基β1 | - | HPRD | 9207175 |
CRK | crkii | v-crk sarcoma virus CT10 oncogene homolog (avian) | PDGFR interacts with Crk. This interaction was modelled on a demonstrated interaction between rat PDGFR and Crk from an unknown species. | 绑定 | 2173144 |
CRK | crkii | v-crk sarcoma virus CT10 oncogene homolog (avian) | - | HPRD,Biogrid | 10733900 |
egfr | ERBB |ERBB1 |her1 |PIG61 |梅纳 | 表皮生长因子受体(红细胞性白血病病毒(V-ERB-B)癌基因同源物,鸟类) | - | HPRD,Biogrid | 9506992 |
EIF2AK2 | EIF2AK1 |MGC126524 |PKR |prkr | 真核翻译起始因子2-α激酶2 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 11350938 |
EPHB1 | ELK | EPHT2 | FLJ37986 | Hek6 | NET | EPH受体B1 | Elk phosphorylates PDGFR. This interaction was modelled on a demonstrated interaction between Elk from an unknown species and human PDGFR. | 绑定 | 7689724 |
FYN | MGC45350 |SLK |syn | Fyn Oncogene与SRC,FGR,是的 | - | HPRD | 1696179 |
GRB10 | grb-ir |GRB-10 |IRBP |KIAA0207 |MEG1 |RSS | 生长因子受体结合蛋白10 | - | HPRD | 9006901 |
GRB14 | - | 生长因子受体结合蛋白14 | - | HPRD,Biogrid | 8647858 |
GRB2 | 灰烬|EGFRBP-GRB2 |Grb3-3 |MST084 |MSTP084 | growth factor receptor-bound protein 2 | - | HPRD,Biogrid | 7935391 |
ITGB3 | CD61 |gp3a |GPIIIA | 整合素,β3(血小板糖蛋白IIIA,抗原CD61) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 10964931 |
KRTAP4-12 | kap4.12 |KRTAP4.12 | 角蛋白相关蛋白4-12 | 两个杂交 | Biogrid | 16189514 |
NCK1 | MGC12668 |NCK |nckalpha | NCK适配器蛋白1 | Autophosphorylated PDGFR interacts with Nck. This interaction was modelled on a demonstrated interaction between human PDGFR and Nck from an unspecified species. | 绑定 | 8890167 |
NCK1 | MGC12668 |NCK |nckalpha | NCK适配器蛋白1 | - | HPRD | 9362449 |
NCK1 | MGC12668 |NCK |nckalpha | NCK适配器蛋白1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 1333047|10026169 |
NCK2 | grb4 |NCKBETA | NCK适配器蛋白2 | - | HPRD,Biogrid | 11027258 |
PDAP1 | HASPP28 |PAP |Pap1 | PDGFA相关蛋白1 | - | HPRD | 11331882 |
PDGFB | FLJ12858 |PDGF2 |sis |SSV |c-sis | 血小板衍生的生长因子β多肽(Simian肉瘤病毒(V-SIS)癌基因同源物) | - | HPRD | 11903042 |
PDGFD | IEGF |MGC26867 |MSTP036 |SCDGF-B | 血小板衍生的生长因子D | - | HPRD | 14514732 |
PDGFRA | CD140A |MGC74795 |PDGFR2 |Rhe-pdgfra | 血小板衍生的生长因子受体,α多肽 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 2542288|7523122 |
PDGFRB | CD140B |JTK12 |PDGF-R-BETA |PDGFR |PDGFR1 | 血小板衍生的生长因子受体,β多肽 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 远西方 |
Biogrid | 7523122|11046132 |
PDGFRB | CD140B |JTK12 |PDGF-R-BETA |PDGFR |PDGFR1 | 血小板衍生的生长因子受体,β多肽 | PDGFRB同构二聚体和交叉磷酸化。 | 绑定 | 15889147 |
PIK3R1 | grb1 |P85 |p85-alpha | 磷酸肌醇3-激酶,调节亚基1(alpha) | 体内 | Biogrid | 10697503 |
PIK3R1 | grb1 |P85 |p85-alpha | 磷酸肌醇3-激酶,调节亚基1(alpha) | Beta-PDGFR interacts with p85. This interaction was modeled on a demonstrated interaction between human beta-PDGFR and rat or bovine p85. | 绑定 | 1372092|7689724 |7876130 |
PIK3R1 | grb1 |P85 |p85-alpha | 磷酸肌醇3-激酶,调节亚基1(alpha) | 磷酸化的β-PDGFR与p85-Alpha相互作用。这种相互作用是在人β-PDGFR和牛P85-Alpha之间的相互作用上建模的。 | 绑定 | 8388538 |
PIK3R2 | P85B |P85 |p85-beta | phosphoinositide-3-kinase, regulatory subunit 2 (beta) | PDGFR与p85-alpha相互作用。这种相互作用是基于未知物种的人类PDGFR和p85-Alpha之间的相互作用进行建模的。 | 绑定 | 11172806 |
PIK3R3 | DKFZP686P05226 |FLJ41892 |p55 |p55-gamma | 磷酸肌醇3-激酶,调节亚基3(伽马) | PDGFR与p55-gamma相互作用。这种相互作用是根据未知物种的人类PDGFR和p55-gamma之间的相互作用进行建模的。 | 绑定 | 11172806 |
plaur | CD87 | UPAR | URKR | 纤溶酶原激活剂,尿激酶受体 | Plaur(UPAR)的未指定同工型与PDGFRB相互作用。 | 绑定 | 15889147 |
PLCG1 | PLC-II | PLC1 | PLC148 | PLCgamma1 | phospholipase C, gamma 1 | - | HPRD,Biogrid | 8443409 |
PLCG1 | PLC-II | PLC1 | PLC148 | PLCgamma1 | phospholipase C, gamma 1 | Autophosphorylated PDGFR interacts with PLC-gamma. This interaction was modelled on a demonstrated interaction between human PDGFR and PLC-gamma from an unspecified species. | 绑定 | 8890167 |
PLCG1 | PLC-II | PLC1 | PLC148 | PLCgamma1 | phospholipase C, gamma 1 | 磷酸化的β-PDGFR与PLC-GAMMA相互作用。这种相互作用是建立在人β-PDGFR和牛PLC-gamma之间的相互作用的模型。 | 绑定 | 8388538 |
PLCG1 | PLC-II | PLC1 | PLC148 | PLCgamma1 | phospholipase C, gamma 1 | Beta-PDGFR interacts with PLC-gamma 1. This interaction was modeled on a demonstrated interaction between human beta-PDGFR and PLC-gamma from bovine and unspecified sources. | 绑定 | 2173144|7592796 |7689724|7876130 |
PTK2 | FADK | FAK | FAK1 | pp125FAK | PTK2蛋白酪氨酸激酶2 | - | HPRD | 10806474 |
PTPN11 | BPTP3 | CFC | MGC14433 | NS1 | PTP-1D | PTP2C | SH-PTP2 | SH-PTP3 | SHP2 | 蛋白质酪氨酸磷酸酶,非受体11型 | 重构的复合物 两个杂交 |
Biogrid | 7691811|11266449 |
PTPN11 | BPTP3 | CFC | MGC14433 | NS1 | PTP-1D | PTP2C | SH-PTP2 | SH-PTP3 | SHP2 | 蛋白质酪氨酸磷酸酶,非受体11型 | PDGFR与SYP相互作用。 | 绑定 | 7688466 |
PTPN11 | BPTP3 | CFC | MGC14433 | NS1 | PTP-1D | PTP2C | SH-PTP2 | SH-PTP3 | SHP2 | 蛋白质酪氨酸磷酸酶,非受体11型 | Autophosphorylated PDGFR interacts with Syp. This interaction was modelled on a demonstrated interaction between human PDGFR and Syp from an unspecified species. | 绑定 | 8890167 |
RAF1 | 克拉夫|NS5 |RAF-1 |C-Raf | v-raf-1 murine leukemia viral oncogene homolog 1 | - | HPRD,Biogrid | 2475255 |
rasa1 | CM-AVM | CMAVM | DKFZp434N071 | GAP | PKWS | RASA | RASGAP | p120GAP | p120RASGAP | RAS p21 protein activator (GTPase activating protein) 1 | Activated PDGFR interacts with GAP. This interaction was modeled on a demonstrated interaction between human PDGFR and canine GAP. | 绑定 | 2157284 |
rasa1 | CM-AVM | CMAVM | DKFZp434N071 | GAP | PKWS | RASA | RASGAP | p120GAP | p120RASGAP | RAS p21 protein activator (GTPase activating protein) 1 | GAP的N末端SH2结构域与PDGFR相互作用。这种相互作用是建立在未指定物种的人类和PDGFR之间的间隙之间的相互作用上建模的。 | 绑定 | 1385407|2173144 |7689724|8344248 |
rasa1 | CM-AVM | CMAVM | DKFZp434N071 | GAP | PKWS | RASA | RASGAP | p120GAP | p120RASGAP | RAS p21 protein activator (GTPase activating protein) 1 | - | HPRD,Biogrid | 10697503|11896619 |
rasa1 | CM-AVM | CMAVM | DKFZp434N071 | GAP | PKWS | RASA | RASGAP | p120GAP | p120RASGAP | RAS p21 protein activator (GTPase activating protein) 1 | 自磷酸化的PDGFR与间隙相互作用。这种相互作用是根据未指定物种的人类PDGFR和间隙之间的相互作用进行建模的。 | 绑定 | 8890167 |
S1PR1 | CHEDG1 | D1S3362 | ECGF1 | EDG-1 | EDG1 | FLJ58121 | S1P1 | 鞘氨醇1-磷酸受体1 | - | HPRD,Biogrid | 12480944 |
SH3KBP1 | CIN85 |gig10 |MIG18 | SH3-domain kinase binding protein 1 | - | HPRD,Biogrid | 12177062 |
SHB | RP11-3J10.8 |BA3J10.2 | SRC同源性2含有衔接蛋白B的结构域 | SHB与PDGFβ受体相互作用。 | 绑定 | 7537362 |
SHC1 | FLJ26504 |SHC |SHCA | SHC(SRC同源性2结构域)转化蛋白1 | PDGFR与p52SHC相互作用 | 绑定 | 8195171 |
SHC1 | FLJ26504 |SHC |SHCA | SHC(SRC同源性2结构域)转化蛋白1 | PDGFR interacts with p66Shc. | 绑定 | 8195171 |
SHC1 | FLJ26504 |SHC |SHCA | SHC(SRC同源性2结构域)转化蛋白1 | - | HPRD,Biogrid | 8195171 |
SHC1 | FLJ26504 |SHC |SHCA | SHC(SRC同源性2结构域)转化蛋白1 | 自磷酸化的PDGFR与SHC相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的人类PDGFR和SHC之间的相互作用进行建模的。 | 绑定 | 8890167 |
SLC9A3R1 | EBP50 |nherf |nherf1 |nphlop2 | 溶质载体家族9(钠/氢交换器),成员3调节器1 | - | HPRD,Biogrid | 11046132 |
SNX1 | HST17379 |MGC8664 |SNX1A |VPS5 | 排序Nexin 1 | - | HPRD,Biogrid | 9819414 |
SNX2 | MGC5204 | TRG-9 | 排序Nexin 2 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 9819414 |
SNX4 | - | 排序Nexin 4 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 9819414 |
SOCS1 | 顺式1 |cish1 |jab |SOCS-1 |SSI-1 |SSI1 |提示3 | 抑制细胞因子信号传导1 | Socs1 interacts with PDGF-R. This interaction was modeled on a demonstrated interaction between mouse Socs1 and human PDGF-R. | 绑定 | 10022833 |
SRC | ASV |src1 |C-SRC |P60-SRC | v - src肉瘤(Schmidt-Ruppin a)病毒致癌基因homolog (avian) | PDGFR与SRC相互作用。这种相互作用是根据未知物种的大鼠PDGFR和SRC之间的相互作用进行建模的。 | 绑定 | 2173144 |
VAV1 | VAV | vav 1 guanine nucleotide exchange factor | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 10938113 |
VAV2 | - | VAV 2鸟嘌呤核苷酸交换因子 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 10938113 |
VAV3 | FLJ40431 | VAV 3鸟嘌呤核苷酸交换因子 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 10938113 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg mapk信号通路 | 267 | 205 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg钙信号通路 | 178 | 134 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG CYTOKINE CYTOKINE RECEPTOR INTERACTION | 267 | 161 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg焦点粘附 | 201 | 138 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg间隙交界处 | 90 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG REGULATION OF ACTIN CYTOSKELETON | 216 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
癌症中的KEGG途径 | 328 | 259 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG GLIOMA | 65 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG PROSTATE CANCER | 89 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG MELANOMA | 71 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID PTP1B途径 | 52 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID Integin3途径 | 43 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID S1P S13途径 | 29 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID nectin途径 | 30 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID TCPTP途径 | 43 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID SHP2途径 | 58 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID S1P S1P1途径 | 21 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pid upa upar途径 | 42 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID PDGFRB PATHWAY | 129 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
pid myc抑制道路 | 63 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PDGF的Reactome信号传导 | 122 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
REACTOME DOWNSTREAM SIGNAL TRANSDUCTION | 95 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SCHUETZ BREAST CANCER DUCTAL INVASIVE UP | 351 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kokkinakis蛋氨酸剥夺48小时 | 128 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kokkinakis甲硫氨酸剥夺96小时 | 117 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LINDGREN BLADDER CANCER CLUSTER 1 DN | 378 | 231 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
血清剥夺的Graessmann凋亡 | 552 | 347 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和血清剥夺的反应 | 211 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN DN | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗PML目标由MYC DN绑定 | 14 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Berenjeno由Rhoa DN转变 | 394 | 258 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HAEGERSTRAND RESPONSE TO IMATINIB | 9 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lindgren膀胱癌簇2B | 392 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
myllykangas放大热点27 | 15 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Teramoto OPN目标群集6 | 27 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gruetzmann胰腺癌 | 358 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jazag TGFB1通过SMAD4 DN发出信号 | 66 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SASAI RESISTANCE TO NEOPLASTIC TRANSFROMATION | 50 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
THEODOROU MAMMARY TUMORIGENESIS | 31 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WEI MIR34A TARGETS | 148 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
SCHAEFFER PROSTATE DEVELOPMENT 48HR DN | 428 | 306 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jechlinger上皮到间充质转变 | 71 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
亚伯拉罕ALPC与多发性骨髓瘤 | 26 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
牙肺纹状横纹肌肉瘤DN | 408 | 274 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
JAZAERI BREAST CANCER BRCA1 VS BRCA2 DN | 43 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BROWNE HCMV INFECTION 24HR DN | 148 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chiba对TSA的反应 | 52 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gerhold脂肪形成DN | 64 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染18小时DN | 178 | 121 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Burton脂肪形成峰在0hr | 63 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
JI CARCINOGENESIS BY KRAS AND STK11 DN | 17 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CLAUS PGR POSITIVE MENINGIOMA DN | 12 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mishra癌相关的成纤维细胞 | 24 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
H3K27ME3 DN的Acevedo肝癌 | 228 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
对Salirasib dn的Blum响应 | 342 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
格雷希克癌症复制号码 | 323 | 240 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
VART KSHV感染血管生成标记DN | 138 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha PGC | 420 | 269 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ruiz TNC目标 | 153 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甜肺癌Kras DN | 435 | 289 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MILI假足趋化性DN | 457 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足型haptotaxis dn | 668 | 419 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yamashita肝癌干细胞向上 | 47 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF LCP带有H3K4ME3 | 128 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen IPS LCP带有H3K4Me3 | 174 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NAKAYAMA FGF2 TARGETS | 29 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC DN监管 | 253 | 192 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1 TARGETS UP | 682 | 433 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Delacroix Rar Bound ES | 462 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
anastassiou癌症间充质过渡特征 | 64 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
DURAND STROMA S UP | 297 | 194 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Section VI. microRNA annotation
miRNA family | Target position | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-29 | 1907 | 1913 | M8 | HSA-MIR-29ASZ | uagcaccaucugaaaucgguu |
HSA-MIR-29BSZ | uagcaccauuugaaaucaguguu | ||||
HSA-MIR-29CSZ | UAGCACCAUUUGAAAUCGGU | ||||
mir-30-5p | 1784年 | 1790年 | 1A | hsa-miR-30a-5p | UGUAAACAUCCUCGACUGGAAG |
HSA-MIR-30C脑 | uguaaacauccuacucucucucucagc | ||||
HSA-MIR-30DSZ | uguaaacauccccgacuggaag | ||||
HSA-MIR-30BSZ | uguaaacauccuaccucucagcu | ||||
HSA-MIR-30E-5P | uguaaacauccuugacugga | ||||
mir-378 | 1123 | 1129 | 1A | HSA-MIR-378 | cuccugacuccaggucugugu |
mir-9 | 1763年 | 1770年 | 1A,M8 | hsa-miR-9SZ | ucuuuguuaucuagcuguauga |