基因页：TRIM33

Summary？
基因ID 51592
象征 TRIM33
同义词 ecto | ptc7 | rfg7 | tf1g | tif1g | tif1gamma | tifgamma
描述 包含33的三方图案
参考 MIM：605769|HGNC：HGNC：16290|ENSEMBL：ENSG00000197323|HPRD：10423|Vega：Otthumg00000011891
基因类型 蛋白质编码
地图位置 1p13.1
Pascal P值 0.014
Sherlock P值 0.757
胎儿β 0.738

基因in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：Gwascat 全基因组关联研究 This data set includes 560 SNPs associated with schizophrenia. A total of 486 genes were mapped to these SNPs within 50kb.
CV:GWASdb 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR：0.0235
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析（所有样品） PSR：0.00814

部分即遗传学and epigenetics annotation

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 Sift CG46 特征 学习
TRIM33 CHR1 114967255 G 一个 NM_015906
NM_033020		 。
。		 沉默的
沉默的		 Schizophrenia DNM:Fromer_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0003677 DNA结合 IEA -
去：0005515 蛋白质结合 IEA -
GO：0016874 连接酶活性 IEA -
去：0008270 锌离子结合 nas -
GO：0046872 金属离子结合 IEA -
Biological process 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0006355 调节转录，DNA依赖性的调节 IEA -
去：0006511 泛素依赖性蛋白质分解代谢过程 IEA -
GO：0016481 转录的负调节 nas 10022127
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005622 细胞内 IEA -
去：0005634 核 nas -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
SMAD2 SMAD3 SMAD4异三聚体的反应组转录活性 38 26 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Smad2 3 Smad4转录活性的反应组下调 20 14 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome通用转录途径 352 181 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME SIGNALING BY TGF BETA RECEPTOR COMPLEX 63 42 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
渡边直肠癌放疗反应能力 108 67 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Gal白血病干细胞向上 133 78 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Hoebeke淋巴干细胞向上 95 64 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
hahtola兄弟姐妹fungoides CD4 DN 116 71 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
哈马凋亡通过Trail Up 584 356 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Dacosta UV响应通过ERCC3 DN 855 609 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Dacosta UV响应通过ERCC3公共DN 483 336 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 479 299 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Nuytten Nipp1靶向DN 848 527 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
buytaert光动力疗法压力 811 508 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath Myc Max目标 775 494 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
王前列腺癌雄激素独立 66 37 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
肯尼CTNNB1靶向DN 52 34 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Browne HCMV感染20小时 240 152 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Browne HCMV感染16小时 225 139 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Bild SRC致癌特征 62 38 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Finetti乳腺癌Kinome Grey 15 10 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Mitsiades对aplidin的反应 439 257 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Mir34b和Mir34C的丰田目标 463 262 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
格雷希克癌症复制号码 323 240 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
法拉利对fenretinide的反应 22 16 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
lu eszh2靶向DN 414 237 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Gabriely miR21靶标 289 187 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway
Roessler肝癌转移DN 53 29 一个ll SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
Let-7/98 3190 3196 1a HSA-LET-7A脑 ugagguaguaguauauaguu
HSA-LET-7B脑 ugagguaguagguuguguguguu
HSA-LET-7C脑 ugagguaguagguuguaugguu
HSA-LET-7D脑 一个G一个GGUAGUAGGUUGCAUAGU
HSA-LET-7E脑 ugagguaggagguuauauagu
HSA-LET-7F脑 ugagguagauuguauauaguu
HSA-MIR-98脑 UGAGGUAGUAAGUUGUAUUGUU
HSA-LET-7GSZ ugagguaguuguuguacagu
HSA-LET-7I脑 ugagguaguugugugugugcugu
miR-137 3669 3676 1A，M8 HSA-MIR-137 uauugcuuaagaauacgcguag
mir-19 4543 4550 1A，M8 HSA-MIR-19A ugugcaaauaugauaugaaaacuga
HSA-MIR-19B UGUGCAAAUCCAUGCAAAACUGA
MiR-200BC/429 145 152 1A，M8 hsa-miR-200b uaauacugccugguaaugaugac
hsa-miR-200c uaauacugccggguaaugaugg
HSA-MIR-429 uaauacuguguguguguguaaaaaccgu
mir-203.1 3942 3949 1A，M8 HSA-MIR-203 ugaaauguuuaggaccacuag
mir-21 1032 1038 1a HSA-MIR-21脑 uagcuuaucagacugauguuga
hsa-miR-590 GAGCUUAUUCAUAAAAGUGCAG
mir-214 3565 3571 1a HSA-MIR-214脑 acagcaggcacagacaggcag
mir-24 1018 1024 M8 HSA-MIR-24SZ uggcucucagagcaggaagag
mir-26 1322 1328 1a HSA-MIR-26A脑 Uucaaguaauccaggauaggc
HSA-MIR-26BSZ UUCAAGUAAUUCAGGAUAGGUU
mir-30-5p 3932 3938 1a hsa-miR-30a-5p uguaaaacauccuccugagaag
HSA-MIR-30C脑 UGUAAACAUCCUACACUCUCAGC
HSA-MIR-30DSZ UGUAAACAUCCCCGACUGGAAG
HSA-MIR-30BSZ uguaaacauccuaccucucagcu
HSA-MIR-30E-5P uguaaacauccuugacugga
mir-323 1037 1043 M8 HSA-MIR-323脑 GCACAUUACACGGUCGACCUCU
mir-338 3798 3805 1A，M8 HSA-MIR-338脑 UCCAGCAUCAGUGAUUUUGUUGA
miR-370 3195 3201 M8 HSA-MIR-370脑 gccugggggguggaaccugg
mir-384 3738 3744 1a HSA-MIR-384 auuccuagaaauuguucaua
miR-409-3p 1107 1113 1a HSA-MIR-409-3P CGAAUGUUGCUCGGUGAACCCCU
mir-455 4546 4552 1a HSA-MIR-455 Uaugugccuuuggacuacaucg
miR-491 1317 1323 M8 HSA-MIR-491脑 aguggggaacccuuccaugga