概括
基因 51604
象征 质量
同义词 CGI-06 | MCAHS3 | NDAP | PNH2
描述 磷脂酰肌醇聚糖锚固生物合成类T类
参考 MIM:610272|HGNC:HGNC:14938|ENSEMBL:ENSG00000124155|HPRD:15136|Vega:Otthumg0000000032574
基因类型 蛋白质编码
地图位置 20q13.12
Pascal P值 0.983
Sherlock P值 0.976
胎儿β -0.661
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG15733055 20 44065713 质量 2.69e-8 -0.009 8.54e-6 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG糖基磷脂酰肌醇GPI锚固生物合成 25 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
蛋白质的反应组代谢 518 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome的翻译后修饰合成GPI锚定蛋白 26 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome术后翻译蛋白修饰 188 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王食道癌与正常 121 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
狮子转移 539 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发6小时DN 514 330 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lein Midbrain标记 82 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stearman肺癌早期与晚期DN 61 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
级结肠癌 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vantveer乳腺癌ESR1 UP 167 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vantveer乳腺癌BRCA1 DN 44 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
钱德兰转移DN 306 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kasler HDAC7靶向1个 194 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Huang GATA2靶向DN 72 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rarg Bound MEF 367 231 该途径中的所有SZGR 2.0基因