基因页：PDK1

概括?
基因ID 5163
Symbol PDK1
同义词 -
描述 pyruvate dehydrogenase kinase 1
参考 MIM:602524|HGNC：HGNC：8809|Ensembl:ENSG00000152256|HPRD：03954|Vega：Otthumg00000132285
基因type protein-coding
地图位置 2 q31.1
Pascal P值 0.849
Fetal beta 0.097
DMG 1（＃研究）
eGene Cerebellum
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因set name 基因组方法 描述 Info
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 Genome-wide DNA methylation analysis This dataset includes 4641 differentially methylated probes corresponding to 2929 unique genes between schizophrenia patients (n=24) and controls (n=24). 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 系统本身arch in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 Click to show details

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 Chromosome Position Nearest gene P (dis) beta（dis） FDR (dis) Study
CG04865480 2 173421027 PDK1 2.225E-4 -0.235 0.036 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID Chromosome Position eGene 基因Entrez ID PVALUE qvalue TSS distance eQTL type
rs4322086 chr9 85787717 PDK1 5163 0.14 trans

Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

无法使用

基因expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
FARSA 0.87 0.82
TCF25 0.85 0.81
CDC37 0.83 0.82
ANAPC2 0.83 0.81
RNF187 0.83 0.78
otud5 0.82 0.77
EPN1 0.82 0.80
IKBKG 0.82 0.78
IDH3B 0.82 0.75
KATNB1 0.82 0.77
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
AF347015.21 -0.72 -0.58
AF347015.31 -0.71 -0.59
MT-CO2 -0.69 -0.56
AF347015.8 -0.68 -0.56
AF347015.2 -0.67 -0.53
MT-CYB -0.67 -0.55
NOSTRIN -0.66 -0.60
AF347015.33 -0.65 -0.53
AF347015.15 -0.64 -0.54
AF347015.27 -0.64 -0.57

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors Aliases B Official full name B Experimental 资源 PubMed ID
AKT1 AKT | MGC99656 | PKB | PKB-ALPHA | PRKBA | RAC | RAC-ALPHA v-akt murine thymoma viral oncogene homolog 1 PDK1与Akt1相互作用并磷酸化。这种相互作用是根据来自未指定的物种的PDK1和AKT1之间的相互作用进行了建模的。 BIND 15678105
dlat DLTA | PDC-E2 | PDCE2 二氢丙酰胺S-乙酰转移酶 - HPRD，Biogrid 11978179
FRAP1 FLJ44809 | FRAP | FRAP2 | MTOR | RAFT1 | RAPT1 FK506结合蛋白12-宽霉素相关蛋白1 Phenotypic Enhancement BioGRID 10567431
伊尔克 DKFZp686F1765 | P59 integrin-linked kinase - HPRD，Biogrid 11313365
KIAA1303 - raptor Affinity Capture-Western BioGRID 12150926
PDK2 PDHK2 丙酮酸脱氢酶激酶，同工酶2 - HPRD，Biogrid 12573248
PKN1 DBK | MGC46204 | PAK1 | PKN | PKN-ALPHA | PRK1 | PRKCL1 蛋白激酶N1 Affinity Capture-Western BioGRID 10753910
PKN2 MGC150606 |MGC71074 |pak2 |prk2 |prkcl2 |Pro2042 |PAK-2 蛋白激酶N2 Affinity Capture-Western BioGRID 10753910
PRKCD MAY1 | MGC49908 | PKCD | nPKC-delta protein kinase C, delta - HPRD 11781095
RALGDS FLJ20922 | RGF | RalGEF ral guanine nucleotide dissociation stimulator Affinity Capture-Western BioGRID 11889038
RPS6KB1 PS6K | S6K | S6K1 | STK14A | p70(S6K)-alpha | p70-S6K | p70-alpha ribosomal protein S6 kinase, 70kDa, polypeptide 1 Reconstituted Complex BioGRID 11733037
是的 ywha1 tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, eta polypeptide - HPRD 12177059


V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
kegg t细胞受体信号通路 108 89 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG FC EPSILON RI SIGNALING PATHWAY 79 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG NEUROTROPHIN SIGNALING PATHWAY 126 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SIG PIP3 SIGNALING IN CARDIAC MYOCTES 67 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SIG趋化性 45 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
B型膜片中的SIG IL4受体 27 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
St GAQ途径 28 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
St GA13途径 37 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SIG INSULIN RECEPTOR PATHWAY IN CARDIAC MYOCYTES 51 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
B淋巴细胞中的SIG PIP3信号传导 36 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SIG BCR SIGNALING PATHWAY 46 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SA PTEN途径 17 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ST PHOSPHOINOSITIDE 3 KINASE PATHWAY 37 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME PYRUVATE METABOLISM AND CITRIC ACID TCA CYCLE 48 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME TCA CYCLE AND RESPIRATORY ELECTRON TRANSPORT 141 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
丙酮酸脱氢酶PDH复合物的反应组调节 13 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME PYRUVATE METABOLISM 19 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NAKAMURA TUMOR ZONE PERIPHERAL VS CENTRAL DN 634 384 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIU SOX4 TARGETS DN 309 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GARY CD5 TARGETS UP 473 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOOI ST7靶向DN 123 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
thum收缩性心力衰竭 423 283 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Basaki YBX1靶向DN 384 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
埃尔维奇缺氧 171 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ELVIDGE HYPOXIA BY DMOG UP 130 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ELVIDGE HIF1A TARGETS DN 91 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ELVIDGE HIF1A AND HIF2A TARGETS DN 104 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARKEY RB1 ACUTE LOF UP 215 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY SERUM DEPRIVATION DN 234 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CONCANNON APOPTOSIS BY EPOXOMICIN DN 172 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN DN 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAUSSMANN MLL AF4 FUSION TARGETS A UP 191 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCBRYAN PUBERTAL BREAST 3 4WK UP 214 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCBRYAN PUBERTAL BREAST 4 5WK DN 196 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Scheidereit IKK相互作用蛋白 58 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HEIDENBLAD AMPLICON 8Q24 UP 40 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向胎儿肝 227 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHETH LIVER CANCER VS TXNIP LOSS PAM4 261 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC NETWORK 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA ATM PCC NETWORK 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
总ELK3靶向DN 32 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GROSS HIF1A TARGETS DN 25 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过ELK3和HIF1A的总缺氧 142 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUYTTEN NIPP1 TARGETS UP 769 437 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUYTTEN EZH2 TARGETS UP 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIAO METASTASIS 539 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH ES 1 379 235 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH MYC MAX TARGETS 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mori小型BII淋巴细胞DN 76 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与B淋巴细胞向上 78 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MENSE HYPOXIA UP 98 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MLL AF9融合的Kumar目标 405 264 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 419 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MONNIER POSTRADIATION TUMOR ESCAPE DN 373 196 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群P4 100 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARSON BOUND BY FOXP3 STIMULATED 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向由甲基化DN沉默 281 179 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RIGGI EWING SARCOMA PROGENITOR DN 191 123 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID BREAST CANCER RELAPSE IN BONE DN 315 197 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID BREAST CANCER BASAL UP 648 398 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张乳腺癌祖细胞 425 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha Human Mitodb 6 2002 429 260 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha线粒体 447 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YOSHIMURA MAPK8 TARGETS DN 366 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHEDDEN LUNG CANCER GOOD SURVIVAL A12 317 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHAFFER IRF4 TARGETS IN MYELOMA VS MATURE B LYMPHOCYTE 101 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SHAFFER IRF4 TARGETS IN PLASMA CELL VS MATURE B LYMPHOCYTE 67 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MILI PSEUDOPODIA HAPTOTAXIS UP 518 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHIANG LIVER CANCER SUBCLASS CTNNB1 UP 176 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LI INDUCED T TO NATURAL KILLER DN 116 83 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG RESPONSE TO GSK3 INHIBITOR SB216763 DN 374 217 该途径中的所有SZGR 2.0基因
QI HYPOXIA 140 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vandesluis Commd1目标2组 15 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FARDIN HYPOXIA 9 7 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FARDIN HYPOXIA 11 32 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vanloo SP3靶向DN 89 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GOBERT OLIGODENDROCYTE DIFFERENTIATION DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
瓦克缺氧VHL的目标 13 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Servitja Islet HNF1A靶向DN 109 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOHOUTEK CCNT2 TARGETS 58 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DELACROIX RAR BOUND ES 462 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIEG HYPOXIA NOT VIA KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KUMAR PATHOGEN LOAD BY MACROPHAGES 275 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KUMAR AUTOPHAGY NETWORK 71 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ROESSLER LIVER CANCER METASTASIS UP 107 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMIRNOV RESPONSE TO IR 6HR DN 114 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因