基因页面:LUC7L2
总结吗?
| GeneID | 51631年 |
| 象征 | LUC7L2 |
| 同义词 | CGI-59 | cgi - 74 | LUC7B2 |
| 描述 | LUC7-like 2 pre-mRNA剪接因子 |
| 参考 | MIM: 613056|HGNC: HGNC: 21608|运用:ENSG00000146963|HPRD: 17456|织女:OTTHUMG00000185163 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 7 q34 |
| 帕斯卡假定值 | 0.031 |
| 夏洛克假定值 | 0.966 |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| 网络 | 最短路径距离核心基因在人类蛋白质相互作用网络 | 贡献在PPI网络最短路径:0.0179 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs6467822 | chr7 | 138773010 | LUC7L2 | 51631年 | 0.13 | 独联体 | ||
| rs1507047 | chr16 | 50932778 | LUC7L2 | 51631年 | 0.09 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 新闻学会 | 17353931 | |
| 去:0008270 | 锌离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0046872 | 金属离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - |
第四部分,注释蛋白质间交互作用
| 扶少团团员 | 别名B | 官方全名B | 实验 | 源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| 铝青铜 | DKFZp779N1935 | PRO0883 | PRO0903 | PRO1341 | 白蛋白 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| ATRX | ATR2 | MGC2094 | MRXHF1 | RAD54 | RAD54L | SFM1 |啦| XH2 | XNP | ZNF-HX | α地中海贫血/智力迟钝综合症x连锁(RAD54同族体,酵母) | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| C14orf139 | FLJ21276 | 139年14号染色体开放阅读框 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| CCDC53 | cgi - 116 | 卷曲螺旋域包含53 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| CDK5RAP2 | C48 | Cep215 | DKFZp686B1070 | DKFZp686D1070 | KIAA1633 | MCPH3 | CDK5调节亚基相关蛋白2 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| CHD3 | Mi-2a | Mi2-ALPHA | ZFH | chromodomain解旋酶DNA结合蛋白3 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| FAM173A | C16orf24 | MGC2494 | 173年家庭序列相似性,成员 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| FXR1 | - - - - - - | 脆性X智力迟钝,常染色体同族体1 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| GADD45G | CR6 | DDIT2 | GADD45gamma | GRP17 | 增长逮捕和DNA-damage-inducible,γ | - - - - - - | HPRD | 15383276 |
| KIAA1377 | - - - - - - | KIAA1377 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| KLHL20 | KHLHX | KLEIP | KLHLX | rp3 - 383 j4.3 | kelch-like 20(果蝇) | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| LPL | HDLCQ11 | LIPD | 脂蛋白脂肪酶 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| LUC7L2 | CGI-59 | cgi - 74 | FLJ10657 | LUC7B2 | LUC7-like 2(酵母) | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| MAN2A2 | MANA2X | 甘露糖苷酶、α2类,成员2 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| MAP1LC3B | blc3 LC3B | MAP1A / 1 | microtubule-associated蛋白质1轻链3β | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| NAP1L5 | DRLM | 核小体组装蛋白质1 5 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| NASP | DKFZp547F162 | FLB7527 | FLJ31599 | FLJ35510 | MGC19722 | MGC20372 | MGC2297 | PRO1999 | 核autoantigenic精子蛋白(histone-binding) | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| NAT9 | DKFZp564C103 |不同 | N-acetyltransferase 9 (GCN5-related假定的) | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| NDUFA4L2 | FLJ26118 | NUOMS | NADH脱氢酶(辅酶q) 1α复形,4-like 2 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| NKAP | FLJ22626 | NFKB激活蛋白 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| NSF | SKD2 | N-ethylmaleimide-sensitive因素 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| NUTF2 | NTF2 | PP15 | 核运输因子2 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| OFD1 | 71 - 7 - | CXorf5 | MGC117039 | MGC117040 | SGBS2 | oral-facial-digital综合征1 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| PEA15 | HMAT1 | HUMMAT1H | MAT1 | MAT1H | PEA-15 | PED | 磷蛋白质丰富在星形胶质细胞15 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| PTCD3 | DKFZp666K071 | FLJ20758 | Pentatricopeptide重复域3 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| PTN | 竖琴| HBGF8 | HBNF | NEGF1 | pleiotrophin | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| RNPS1 | E5.1 | MGC117332 | RNA结合蛋白S1, serine-rich域 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| SAT1 | 坐在DC21 | KFSD | | SSAT | SSAT-1 | 亚精胺和精胺N1-acetyltransferase 1 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| SSFA2 | CS-1 | CS1 | DKFZp313O1039 | DKFZp779G0129 | FLJ45996 | KIAA1927 | KRAP | SPAG13 | 精子特异性抗原2 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| SVIL | DKFZp686A17191 | supervillin | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| ULK2 | KIAA0623 | Unc51.2 | unc-51-like激酶2(秀丽隐杆线虫) | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| UNC119 | HRG4 | unc - 119同族体(秀丽隐杆线虫) | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
| YWHAG | 14-3-3GAMMA | 酪氨酸3-monooxygenase /色氨酸5-monooxygenase激活蛋白质、伽马多肽 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| YWHAG | 14-3-3GAMMA | 酪氨酸3-monooxygenase /色氨酸5-monooxygenase激活蛋白质、伽马多肽 | - - - - - - | HPRD | 15324660 |
| YWHAQ | 14-3-3 | 1 c5 | HS1 | 酪氨酸3-monooxygenase /色氨酸5-monooxygenase激活蛋白,θ多肽 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 17353931 |
| ZCCHC10 | FLJ20094 | 锌指,角声域包含10 | 2台混合动力 | BioGRID | 16169070 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| ONKEN葡萄膜黑色素瘤了 | 783年 | 507年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| CASORELLI急性早幼粒细胞白血病DN | 663年 | 425年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 多德鼻咽癌DN | 1375年 | 806年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由阿霉素DN GRAESSMANN细胞凋亡 | 1781年 | 1082年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GRAESSMANN MC和阿霉素DN | 770年 | 415年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MARTORIATI MDM4目标胎儿肝脏 | 227年 | 137年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 郭十六进制的目标了 | 81年 | 54 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 崔TCF21目标2 DN | 830年 | 547年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| MARIADASON由组蛋白乙酰化作用DN | 54 | 30. | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 阿尔茨海默病了布莱洛克的 | 1691年 | 1088年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BOYLAN多发性骨髓瘤C D | 139年 | 95年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| PILON KLF1目标了 | 504年 | 321年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 约翰斯通PARVB目标2 DN | 336年 | 211年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 约翰斯通PARVB目标3 DN | 918年 | 550年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 棕熊短波紫外线反应通过TP53 D组 | 280年 | 158年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN CHANGOLKAR H2AFY目标 | 40 | 26 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| GOBERT少突细胞分化DN | 1080年 | 713年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
| microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| miR-124/506 | 904年 | 911年 | 1、m8 | hsa - mir - 506 | UAAGGCACCCUUCUGAGUAGA |
| hsa - mir - 124大脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
| mir - 320 | 350年 | 356年 | m8 | hsa - mir - 320 | AAAAGCUGGGUUGAGAGGGCGAA |
| miR-9 | 923年 | 929年 | m8 | hsa-miR-9深圳 | UCUUUGGUUAUCUAGCUGUAUGA |
| 米尔- 93. - hd / 291 - 3 - p / 294/295/302/372/373/520 | 724年 | 730年 | m8 | hsa - mir - 93大脑 | AAAGUGCUGUUCGUGCAGGUAG |
| hsa - mir - 302 a | UAAGUGCUUCCAUGUUUUGGUGA | ||||
| hsa - mir - 302 b | UAAGUGCUUCCAUGUUUUAGUAG | ||||
| hsa - mir - 302 c | UAAGUGCUUCCAUGUUUCAGUGG | ||||
| hsa - mir - 302 d | UAAGUGCUUCCAUGUUUGAGUGU | ||||
| hsa - mir - 372 | AAAGUGCUGCGACAUUUGAGCGU | ||||
| hsa - mir - 373 | GAAGUGCUUCGAUUUUGGGGUGU | ||||
| hsa - mir - 520 e | AAAGUGCUUCCUUUUUGAGGG | ||||
| hsa - mir - 520 a | AAAGUGCUUCCCUUUGGACUGU | ||||
| hsa - mir - 520 b | AAAGUGCUUCCUUUUAGAGGG | ||||
| hsa - mir - 520 c | AAAGUGCUUCCUUUUAGAGGGUU | ||||
| hsa - mir - 520 d | AAAGUGCUUCUCUUUGGUGGGUU | ||||