基因页:PDK2
概括?
基因 | 5164 |
象征 | PDK2 |
同义词 | pdhk2 | pdkii |
描述 | 丙酮酸脱氢酶激酶2 |
参考 | MIM:602525|HGNC:HGNC:8810|ENSEMBL:ENSG00000005882|HPRD:03955|Vega:Otthumg00000161948 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 17Q21.33 |
Pascal P值 | 0.313 |
Sherlock P值 | 0.038 |
胎儿β | -1.099 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献:0.1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PDK2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
HBM | 0.78 | 0.68 |
ppbp | 0.77 | 0.73 |
HBG1 | 0.76 | 0.71 |
SLC4A1 | 0.75 | 0.74 |
alas2 | 0.75 | 0.77 |
阿拉夫 | 0.74 | 0.76 |
EPB42 | 0.72 | 0.73 |
Hemgn | 0.71 | 0.71 |
HBA1 | 0.70 | 0.71 |
DPEP1 | 0.70 | 0.72 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C5orf53 | -0.47 | -0.67 |
FBXO2 | -0.45 | -0.64 |
CCNI2 | -0.45 | -0.66 |
HLA-F | -0.44 | -0.61 |
CA4 | -0.44 | -0.63 |
asphd1 | -0.43 | -0.61 |
PTGD | -0.43 | -0.61 |
BCl2L2 | -0.42 | -0.61 |
SPARCL1 | -0.42 | -0.62 |
CSRP1 | -0.42 | -0.59 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000155 | 两分量传感器活性 | IEA | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
去:0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
去:0004740 | 丙酮酸脱氢酶(乙酰基转移)激酶活性 | 塔斯 | 7499431 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006006 | 葡萄糖代谢过程 | 塔斯 | 7499431 | |
去:0005975 | 碳水化合物代谢过程 | IEA | - | |
去:0007165 | 信号转导 | IEA | - | |
GO:0016310 | 磷酸化 | IEA | - | |
GO:0018106 | 肽基 - 抗苷酸磷酸化 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005634 | 核 | 艾达 | 18029348 | |
去:0005730 | 核仁 | 艾达 | 18029348 | |
去:0005739 | 线粒体 | IEA | - | |
去:0005759 | 线粒体基质 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Biocarta mtor途径 | 23 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta Pten途径 | 18 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta EIF4途径 | 24 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta IGF1MTOR途径 | 20 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组丙酮酸代谢和柠檬酸TCA循环 | 48 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome TCA循环和呼吸电子传输 | 141 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
丙酮酸脱氢酶PDH复合物的反应组调节 | 13 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组丙酮酸代谢 | 19 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
家长mtor信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
deurig t细胞促进性白血病 | 368 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
刘cmyb靶向 | 165 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Doane对雄激素的反应 | 184 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bidus转移DN | 161 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN | 805 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合靶向G | 238 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Myc Max目标 | 775 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌17q21 Q25 Amplicon | 335 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿斯顿主要抑郁症DN | 160 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wong IFNA2电阻DN | 34 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
彭雷帕霉素的反应 | 203 | 130 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
雄鹿癌俯卧反应E2 | 28 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西肾上腺皮质肿瘤DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chang Core血清反应DN | 209 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Aguirre胰腺癌复制号 | 298 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌良好生存A5 | 70 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张TLX目标60小时 | 293 | 203 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Han Satb1靶向 | 395 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
蒙特罗甲状腺癌的生存率差DN | 11 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由MYC约束 | 1103 | 714 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2目标 | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krieg缺氧不是通过KDM3A | 770 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |