概括
基因 5164
象征 PDK2
同义词 pdhk2 | pdkii
描述 丙酮酸脱氢酶激酶2
参考 MIM:602525|HGNC:HGNC:8810|ENSEMBL:ENSG00000005882|HPRD:03955|Vega:Otthumg00000161948
基因类型 蛋白质编码
地图位置 17Q21.33
Pascal P值 0.313
Sherlock P值 0.038
胎儿β -1.099

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:0.1

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
HBM 0.78 0.68
ppbp 0.77 0.73
HBG1 0.76 0.71
SLC4A1 0.75 0.74
alas2 0.75 0.77
阿拉夫 0.74 0.76
EPB42 0.72 0.73
Hemgn 0.71 0.71
HBA1 0.70 0.71
DPEP1 0.70 0.72
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C5orf53 -0.47 -0.67
FBXO2 -0.45 -0.64
CCNI2 -0.45 -0.66
HLA-F -0.44 -0.61
CA4 -0.44 -0.63
asphd1 -0.43 -0.61
PTGD -0.43 -0.61
BCl2L2 -0.42 -0.61
SPARCL1 -0.42 -0.62
CSRP1 -0.42 -0.59

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000155 两分量传感器活性 IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IEA -
去:0005524 ATP结合 IEA -
去:0004740 丙酮酸脱氢酶(乙酰基转移)激酶活性 塔斯 7499431
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006006 葡萄糖代谢过程 塔斯 7499431
去:0005975 碳水化合物代谢过程 IEA -
去:0007165 信号转导 IEA -
GO:0016310 磷酸化 IEA -
GO:0018106 肽基 - 抗苷酸磷酸化 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005634 艾达 18029348
去:0005730 核仁 艾达 18029348
去:0005739 线粒体 IEA -
去:0005759 线粒体基质 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Biocarta mtor途径 23 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta Pten途径 18 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta EIF4途径 24 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta IGF1MTOR途径 20 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组丙酮酸代谢和柠檬酸TCA循环 48 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome TCA循环和呼吸电子传输 141 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
丙酮酸脱氢酶PDH复合物的反应组调节 13 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组丙酮酸代谢 19 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
家长mtor信号向上 567 375 该途径中的所有SZGR 2.0基因
deurig t细胞促进性白血病 368 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘cmyb靶向 165 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Doane对雄激素的反应 184 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bidus转移DN 161 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN 805 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向G 238 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Myc Max目标 775 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌17q21 Q25 Amplicon 335 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿斯顿主要抑郁症DN 160 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wong IFNA2电阻DN 34 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭雷帕霉素的反应 203 130 该途径中的所有SZGR 2.0基因
雄鹿癌俯卧反应E2 28 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西肾上腺皮质肿瘤DN 546 362 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chang Core血清反应DN 209 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Aguirre胰腺癌复制号 298 174 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌良好生存A5 70 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标60小时 293 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Han Satb1靶向 395 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
蒙特罗甲状腺癌的生存率差DN 11 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由MYC约束 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2目标 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg缺氧不是通过KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因