基因页面:RASD1
总结吗?
GeneID | 51655年 |
象征 | RASD1 |
同义词 | AGS1 | DEXRAS1 | MGC: 26290 |
描述 | RAS, dexamethasone-induced 1 |
参考 | MIM: 605550|HGNC: HGNC: 15828|运用:ENSG00000108551|HPRD: 08958|织女:OTTHUMG00000059292 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 17 p11.2 |
帕斯卡假定值 | 0.019 |
夏洛克假定值 | 0.011 |
DMG | 1(#研究) |
eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了DNA的甲基化概要首发精神分裂症患者外周血细胞从18岁(FESZ)和15名正常对照组。 | 1 |
网络 | 最短路径距离核心基因在人类蛋白质相互作用网络 | 贡献在PPI网络最短路径:0.0018 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg06990298 | 17 | 17399700 | RASD1 | -0.029 | 0.27 | DMG: Nishioka_2013 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs10929202 | chr2 | 237843949 | RASD1 | 51655年 | 0.18 | 反式 | ||
rs1435845 | chr2 | 237848398 | RASD1 | 51655年 | 0.2 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/RASD1_DE_GTEx.png)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000166 | 核苷酸绑定 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0003924 | GTPase活性 | 助教 | 10471929 | |
去:0005525 | 三磷酸鸟苷结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0007186 | g蛋白耦合受体蛋白信号通路 | 助教 | 10840027 | |
去:0007165 | 信号转导 | 助教 | 10471929|10673050 | |
去:0007264 | 小GTPase介导信号转导 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0005622 | 细胞内的 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005886 | 等离子体膜 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
GARGALOVIC应对氧化磷脂洋红色 | 28 | 18 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN GOZGIT ESR1目标 | 781年 | 465年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
LASTOWSKA神经母细胞瘤拷贝数 | 181年 | 108年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
AMUNDSON基因毒性的签名 | 105年 | 68年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
SCHAEFFER前列腺癌发展48小时 | 487年 | 286年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
祖奇转移DN | 44 | 29日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
建筑师中央时钟 | 88年 | 62年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
纳德勒肥胖DN | 48 | 34 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
阮TROGLITAZONE反应 | 25 | 15 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
阮应对TNF TROGLITAZONE DN | 42 | 24 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
伊万诺娃造血干细胞 | 254年 | 164年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
阮应对TNF DN | 84年 | 50 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
伯顿脂肪生成5 | 126年 | 78年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
CREIGHTON内分泌治疗抵抗5 | 482年 | 296年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MASSARWEH他莫昔芬耐了 | 578年 | 341年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
营地结肠癌拷贝数 | 92年 | 45 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
恩格尔曼氏癌症祖细胞了 | 48 | 31日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
李双极性胸腺细胞 | 27 | 17 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
迈斯纳和H3 UNMETHYLATED人大HCP | 536年 | 296年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
黄成人组织干细胞模块 | 721年 | 492年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
国外RB1目标衰老 | 572年 | 352年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DUTERTRE雌二醇响应24小时DN | 505年 | 328年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
李BMP2目标了 | 745年 | 475年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
PURBEY CTBP1不是SATB1 DN的目标 | 448年 | 282年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
皮德森转移由ERBB2同种型1 | 46 | 33 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
FORTSCHEGGER PHF8目标了 | 279年 | 155年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
DN PEDRIOLI MIR31目标 | 418年 | 245年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
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UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
miR-130/301 | 546年 | 552年 | m8 | hsa - mir - 130 a大脑 | CAGUGCAAUGUUAAAAGGGCAU |
hsa - mir - 301 | CAGUGCAAUAGUAUUGUCAAAGC | ||||
hsa - mir - 130 b大脑 | CAGUGCAAUGAUGAAAGGGCAU | ||||
hsa - mir - 454 - 3 - p | UAGUGCAAUAUUGCUUAUAGGGUUU | ||||
miR-17-5p / 20/93.mr / 106/519.d | 548年 | 555年 | 1、m8 | hsa-miR-17-5p | CAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGU |
hsa-miR-20a大脑 | UAAAGUGCUUAUAGUGCAGGUAG | ||||
hsa - mir - 106 a | AAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGC | ||||
hsa - mir - 106 b深圳 | UAAAGUGCUGACAGUGCAGAU | ||||
hsa-miR-20b深圳 | CAAAGUGCUCAUAGUGCAGGUAG | ||||
hsa - mir - 519 d | CAAAGUGCCUCCCUUUAGAGUGU | ||||
miR-30-5p | 501年 | 508年 | 1、m8 | hsa-miR-30a-5p | UGUAAACAUCCUCGACUGGAAG |
hsa-miR-30c大脑 | UGUAAACAUCCUACACUCUCAGC | ||||
hsa-miR-30d深圳 | UGUAAACAUCCCCGACUGGAAG | ||||
hsa-miR-30b深圳 | UGUAAACAUCCUACACUCAGCU | ||||
hsa-miR-30e-5p | UGUAAACAUCCUUGACUGGA | ||||
mir - 365 | 396年 | 403年 | 1、m8 | hsa - mir - 365 | UAAUGCCCCUAAAAAUCCUUAU |
mir - 375 | 583年 | 590年 | 1、m8 | hsa - mir - 375 | UUUGUUCGUUCGGCUCGCGUGA |