基因页面:TPPP3
总结吗?
GeneID | 51673年 |
象征 | TPPP3 |
同义词 | CGI-38 | TPPP / p20 | p20 | p25gamma |
描述 | 微管蛋白polymerization-promoting蛋白质家族成员3 |
参考 | HGNC: HGNC: 24162|运用:ENSG00000159713|HPRD: 16710|织女:OTTHUMG00000137516 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 16 q22.1 |
帕斯卡假定值 | 9.145的军医 |
夏洛克假定值 | 0.459 |
胎儿β | -1.631 |
DMG | 1(#研究) |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg13067215 | 16 | 67427285 | TPPP3 | 2.95平台以及 | -0.027 | 6.67 e - | DMG: Jaffe_2016 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/TPPP3_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
森古普塔鼻咽癌DN | 349年 | 157年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MULLIGHAN NPM1突变签名1 DN | 126年 | 86年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MULLIGHAN NPM1签名3 DN | 162年 | 116年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
多德鼻咽癌起来 | 1821年 | 933年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ENK紫外线反应表皮DN | 508年 | 354年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
通过SMAD4 JAZAG TGFB1信号 | 108年 | 66年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
HATADA甲基化在肺癌 | 390年 | 236年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
英格拉姆嘘DN的目标 | 64年 | 41 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH SUZ12目标 | 1038年 | 678年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH速度的目标 | 1062年 | 725年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH ES与H3K27ME3 | 1118年 | 744年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BENPORATH PRC2目标 | 652年 | 441年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
谢泼德BMYB吗啉代了 | 205年 | 126年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
任肺泡横纹肌肉瘤了 | 98年 | 64年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
伊万诺娃造血干细胞和祖 | 681年 | 420年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
道格拉斯BMI1目标了 | 566年 | 371年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
CREIGHTON内分泌治疗抵抗2 | 473年 | 224年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
LEIN少突细胞标记 | 74年 | 53 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
乳腺癌萧述三腔的B | 172年 | 109年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
萧述三乳腺癌基本DN | 701年 | 446年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
BOQUEST干细胞培养与新鲜的DN | 31日 | 25 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
VANTVEER乳腺癌BRCA1 DN | 44 | 28 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
VALK AML集群9 | 35 | 26 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米凯尔森IPS ICP H3K4ME3和H327ME3 | 126年 | 83年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米凯尔森ES与H3K4ME3 ICP | 718年 | 401年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
MARTENS受PML RARA融合 | 456年 | 287年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
VANDESLUIS COMMD1目标组4 DN | 16 | 11 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ZWANG仅由二EGF脉冲瞬变 | 1725年 | 838年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
miR-15/16/195/424/497 | 304年 | 310年 | m8 | hsa-miR-15a大脑 | UAGCAGCACAUAAUGGUUUGUG |
hsa-miR-16大脑 | UAGCAGCACGUAAAUAUUGGCG | ||||
hsa-miR-15b大脑 | UAGCAGCACAUCAUGGUUUACA | ||||
hsa - mir - 195深圳 | UAGCAGCACAGAAAUAUUGGC | ||||
hsa - mir - 424 | CAGCAGCAAUUCAUGUUUUGAA | ||||
hsa - mir - 497 | CAGCAGCACACUGUGGUUUGU |