基因页面:MPP6
总结吗?
| GeneID | 51678年 |
| 象征 | MPP6 |
| 同义词 | PALS2 | VAM-1 | VAM1 | p55T |
| 描述 | 膜蛋白,palmitoylated 6 |
| 参考 | MIM: 606959|HGNC: HGNC: 18167|运用:ENSG00000105926|HPRD: 09509|织女:OTTHUMG00000023507 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 7 p15 |
| 帕斯卡假定值 | 0.002 |
| 胎儿β | 0.465 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 元 |
| 支持 | 蛋白质聚类 G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSENSUS |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:GWAScat | 全基因组关联研究 | 这个数据集包含560个snp与精神分裂症有关。总共有486个基因映射到这些snp在50 kb。 | |
| 简历:GWASdb | 全基因组关联研究 | 精神分裂症GWASdb记录 | |
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
| 网络 | 最短路径距离核心基因在人类蛋白质相互作用网络 | 贡献在PPI网络最短路径:0.05 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg10678266 | 7 | 24614348 | MPP6 | 2.275的军医 | 0.615 | 0.036 | DMG: Wockner_2014 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs2813827 | chr7 | 24252970 | MPP6 | 51678年 | 0.18 | 独联体 | ||
| rs2642265 | chr7 | 24253061 | MPP6 | 51678年 | 0.15 | 独联体 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0005515 | 蛋白结合 | 新闻学会 | 11311936 | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0006461 | 蛋白质复合体组装 | NAS | 11311936 | |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005886 | 等离子体膜 | 国际能源机构 | - - - - - - |
第四部分,注释蛋白质间交互作用
| 扶少团团员 | 别名B | 官方全名B | 实验 | 源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| AATF | CHE-1 | CHE1 | d | 细胞凋亡与转录因子 | 2台混合动力 | BioGRID | 15231747 |
| ARHGAP18 | FLJ25728 | MGC126757 | MGC138145 | MacGAP | bA307O14.2 | ρGTPase激活蛋白质18 | 2台混合动力 | BioGRID | 15231747 |
| C15orf23 | FLJ14502 | HSD11 | MGC141728 | MGC141729 | TRAF4AF1 | 15号染色体开放阅读框23 | 2台混合动力 | BioGRID | 15231747 |
| DNM2 | CMTDI1 | CMTDIB | DI-CMTB | DYN2 | DYNII | dynamin 2 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 15231747 |
| DYNLRB1 | BITH | BLP | DNCL2A | DNLC2A | ROBLD1 | 动力蛋白轻链,roadblock-type 1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 15231747 |
| EIF3G | EIF3-P42 | EIF3S4 | eIF3-delta | eIF3-p44 | 真核翻译起始因子3 G亚基 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 15231747 |
| EXOSC10 | PM-Scl PM / sci - 100 | | PMSCL | PMSCL2 | RRP6 | Rrp6p | p2 | p3 | p4 | 外来体组件10 | 2台混合动力 | BioGRID | 15231747 |
| FTL | MGC71996 | 铁蛋白,多肽 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 15231747 |
| KCNJ12 | FLJ14167 | IRK2 | KCNJN1 | Kir2.2 | Kir2.2v | hIRK | hIRK1 | hkir2.2x | kcnj12x | 整流钾通道,亚J, 12个成员 | 亲和力Capture-MS | BioGRID | 15024025 |
| LIN7A | LIN-7A | LIN7 | MALS-1 | MGC148143 | TIP-33 | VELI1 | lin-7同族体(秀丽隐杆线虫) | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 10753959|11311936 |
| RPS20 | FLJ27451 | MGC102930 | 核糖体蛋白S20 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 15231747 |
| SKIV2L2 | Dob1 | KIAA0052 | MGC142069 | Mtr4 | fSAP118 | superkiller viralicidic活动2 2(酵母) | 2台混合动力 | BioGRID | 15231747 |
| SMARCA4 | BAF190 |缺失| FLJ39786 | SNF2 | SNF2-BETA | SNF2L4 | SNF2LB | SWI2 | hSNF2b | 瑞士/ SNF相关,关联矩阵,肌动蛋白依赖的染色质的调节器,亚科,成员4 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 15231747 |
| SNX9 | MST155 | MSTP155 | SDP1 | SH3PX1 | SH3PXD3A |缕 | 排序nexin 9 | 2台混合动力 | BioGRID | 15231747 |
| THOP1 | EP24.15 | MEPD_HUMAN | MP78 | | 甲拌磷oligopeptidase 1 | - - - - - - | HPRD, BioGRID | 15231747 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 多恩乳腺癌ESR1 DN | 48 | 28 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 金赛的目标EWSR1 FLII融合起来 | 1278年 | 748年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 由阿霉素DN GRAESSMANN细胞凋亡 | 1781年 | 1082年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 乳腺癌顶浆分泌与腔的农民 | 326年 | 213年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 乳腺癌基底VS LULMINAL农民 | 330年 | 215年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 通过ERCC3 DN滑落紫外线反应 | 855年 | 609年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 滑落紫外线反应通过ERCC3常见的DN | 483年 | 336年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 杨乳腺癌ESR1激光DN | 50 | 38 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| SCHAEFFER前列腺癌发展6人力资源 | 176年 | 115年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH NANOG目标 | 988年 | 594年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| BENPORATH MYC最大目标 | 775年 | 494年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 松田自然杀伤细胞分化 | 475年 | 313年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| AFFAR YY1目标了 | 214年 | 133年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 伊万诺娃早期造血祖 | 532年 | 309年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染血巨细胞病毒16人力资源 | 225年 | 139年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 苏睾丸 | 76年 | 53 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 崔TCF21目标2 | 428年 | 266年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KRIGE TOSEDOSTAT反应6小时DN | 911年 | 527年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| KRIGE应对TOSEDOSTAT 24小时DN | 1011年 | 592年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 萧述三骨DN乳腺癌复发 | 315年 | 197年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 乳腺癌萧述三腔的DN | 564年 | 326年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 萧述三乳腺癌基底 | 648年 | 398年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 穆勒PLURINET | 299年 | 189年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| COLINA 4 ebp1和4 ebp2的目标 | 356年 | 214年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 党受MYC | 1103年 | 714年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 王GSK3反应抑制剂SB216763 DN | 374年 | 217年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| DN PILON KLF1目标 | 1972年 | 1213年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 农民乳腺癌集群3 | 16 | 12 | 所有SZGR 2.0基因通路 |