基因页：LSM7
Summary？
| GeneID | 51690 |
| 象征 | LSM7 |
| 同义词 | YNL147W |
| 描述 | LSM7同源物，U6小核RNA和mRNA降解相关 |
| 参考 | MIM：607287|HGNC：HGNC：20470|Ensembl：ENSG00000130332|HPRD：06287|Vega：Otthumg00000180441 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 19p13.3 |
| Pascal P值 | 0.313 |
| Sherlock P值 | 0.99 |
| 胎儿β | 1.041 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| DMG：Vaneijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点，对应于精神分裂症患者（n = 260）和未受影响的对照（n = 250）之间的391个独特的转录本。 | 1 |
| 网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献：0.0139 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG01129847 | 19 | 2281919 | LSM7 | 7.134E-4 | 4.293 | DMG：Vaneijk_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0003723 | RNA结合 | IEA | - | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 12165861|15231747 | |
| GO：0017070 | U6 snRNA结合 | nas | 10523320 | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0000398 | 核mRNA剪接，通过剪接体 | nas | - | |
| 去：0008380 | RNA剪接 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005634 | 核 | nas | - | |
| 去：0030529 | 核糖核蛋白复合物 | IEA | - |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| exosc6 | EAP4 |mtr3 |mtr3p |HMTR3P |P11 | 外泌体组件6 | 两个杂交 | Biogrid | 15231747 |
| exosc8 | CIP3 |EAP2 |OIP2 |RP11-421P11.3 |RRP43 |RRP43P |BA421P11.3 |P9 | 外泌体组件8 | - | HPRD，Biogrid | 15231747 |
| LSM1 | CASM |YJL124C | LSM1同源物，U6小核RNA相关（酿酒酵母） | - | HPRD | 11920408 |
| LSM2 | C6orf28 |g7b |YBL026W |snrnp | LSM2同源物，U6小核RNA相关（酿酒酵母） | 两个杂交 | Biogrid | 14667819|15231747 |
| LSM2 | C6orf28 |g7b |YBL026W |snrnp | LSM2同源物，U6小核RNA相关（酿酒酵母） | - | HPRD | 11920408|15231747 |
| LSM3 | smx4 |USS2 |YLR438C | LSM3同源物，U6小核RNA相关（酿酒酵母） | - | HPRD，Biogrid | 11920408|15231747 |
| LSM4 | yer112w | LSM4同源物，U6小核RNA相关（酿酒酵母） | - | HPRD，Biogrid | 11920408 |
| LSM5 | FLJ12710 |yer146w | LSM5同源物，U6小核RNA相关（酿酒酵母） | - | HPRD | 11920408 |
| LSM6 | YDR378C | LSM6同源物，U6小核RNA相关（酿酒酵母） | - | HPRD | 11920408 |
| LSM8 | YJR022W | LSM8同源物，U6小核RNA相关（酿酒酵母） | - | HPRD | 11920408 |
| myh13 | myhc-eo | 肌球蛋白，重链13，骨骼肌 | - | HPRD，Biogrid | 15231747 |
| npy1r | npyr | 神经肽Y受体Y1 | - | HPRD，Biogrid | 15231747 |
| rab7l1 | DKFZP686P1051 |rab7l | Rab7，成员Ras Oncogene家庭状1 | 两个杂交 | Biogrid | 15231747 |
| sart3 | DSAP1 |KIAA0156 |MGC138188 |P100 |RP11-13G14 |TIP110 |P110 |P110（NRB） | T细胞识别的鳞状细胞癌抗原3 | 烦恼 | Biogrid | 15452143 |
| SMN1 | BCD541 |SMA |sma1 |sma2 |sma3 |sma4 |sma@ |SMN |SMNT |T-BCD541 | 运动神经元1，端粒的生存 | - | HPRD，Biogrid | 10851237 |
| SNRPD3 | SMD3 | 小核核糖核蛋白D3多肽18KDA | - | HPRD，Biogrid | 15231747 |
| TACC1 | DKFZP686K18126 |GA55 |KIAA1103 | 转化含有蛋白质1的酸性盘绕卷皮 | - | HPRD，Biogrid | 12165861 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| KeGG RNA降解 | 59 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg剪接体 | 128 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GAZDA钻石黑芬贫血髓样DN | 38 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 钟对偶氮丁丁和TSA DN的反应 | 70 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| tien肠益生菌24小时 | 557 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wamunyokoli卵巢癌LMP | 265 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Provenzani转移 | 194 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 环氧素DN的浓凋亡 | 172 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schlosser MYC靶标和血清反应 | 47 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Martoriati MDM4靶向胎儿肝 | 227 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kaab失败的心房DN | 141 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 道格拉斯BMI1靶向 | 566 | 371 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 | 911 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| RIZKI TUMOR INVASIVENESS 2D UP | 69 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张乳腺癌祖细胞 | 425 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mueller Plurinet | 299 | 189 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YAO对孕酮簇的时间反应17 | 181 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chicas RB1靶向低血清 | 100 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| lu eszh2靶向 | 295 | 155 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rattenbacher由Celf1绑定 | 467 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Holleman vincristine抗性所有DN | 19 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |