基因页：trappc2l
概括？
| 基因 | 51693 |
| 象征 | trappc2l |
| 同义词 | HSPC176 |
| 描述 | 运输蛋白颗粒复合物2类 |
| 参考 | MIM：610970|HGNC：HGNC：30887|ENSEMBL：ENSG00000167515|HPRD：13711|Vega：Otthumg00000137861 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 16Q24.3 |
| Pascal P值 | 0.009 |
| 主持人 | 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 下丘脑 伏隔核基底神经节 梭子基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS7372527 | 0 | trappc2l | 51693 | 0.07 | 反式 | |||
| RS9937138 | 16 | 88921022 | trappc2l | ENSG00000167515.6 | 2.33e-9 | 0 | -2472 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS12932588 | 16 | 88921493 | trappc2l | ENSG00000167515.6 | 2.459E-9 | 0 | -2001 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS34150867 | 16 | 88921634 | trappc2l | ENSG00000167515.6 | 6.416E-8 | 0 | -1860 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS113289677 | 16 | 88922989 | trappc2l | ENSG00000167515.6 | 1.172E-10 | 0 | -505 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11076728 | 16 | 88925567 | trappc2l | ENSG00000167515.6 | 1.45e-9 | 0 | 2073 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS28656031 | 16 | 88927044 | trappc2l | ENSG00000167515.6 | 1.328E-9 | 0 | 3550 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS3826061 | 16 | 88927221 | trappc2l | ENSG00000167515.6 | 1.9e-10 | 0 | 3727 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS12597391 | 16 | 88928290 | trappc2l | ENSG00000167515.6 | 1.642E-6 | 0 | 4796 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS12596491 | 16 | 88928417 | trappc2l | ENSG00000167515.6 | 5.14e-10 | 0 | 4923 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS12921479 | 16 | 88929207 | trappc2l | ENSG00000167515.6 | 6.965e-9 | 0 | 5713 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS889753 | 16 | 88931914 | trappc2l | ENSG00000167515.6 | 9.452e-7 | 0 | 8420 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS12445058 | 16 | 88950025 | trappc2l | ENSG00000167515.6 | 8.676E-7 | 0 | 26531 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS12149315 | 16 | 88950302 | trappc2l | ENSG00000167515.6 | 7.359E-7 | 0 | 26808 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11076730 | 16 | 88950685 | trappc2l | ENSG00000167515.6 | 9.798E-7 | 0 | 27191 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Fulcher炎症反应凝集素与LPS | 579 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| tien肠益生菌24小时 | 557 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dairkee Tert目标 | 380 | 213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Stark前额叶皮层22Q11删除DN | 517 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nikolsky乳腺癌16q24 Amplicon | 53 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伊万诺娃造血晚期祖先 | 544 | 307 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 江VHL目标 | 138 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 | 911 | 527 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 | 1011 | 592 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝癌DN | 540 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gratias视网膜细胞瘤16Q24 | 17 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 通过VHL的江南缺氧 | 34 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Li DCP2绑定mRNA | 89 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |