基因页：ATP5G2

Summary？
基因 517
象征 ATP5G2
同义词 ATP5A
Description ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial Fo complex subunit C2 (subunit 9)
Reference MIM：603193|HGNC:HGNC:842|Ensembl:ENSG00000135390|HPRD：04429|Vega:OTTHUMG00000133442
基因类型 蛋白质编码
地图位置 12q13.13
Pascal P值 0.06
胎儿β 0.166
DMG 1 (# studies)
主持人 尾状基底神经节
小脑半球
小脑
皮质
Frontal Cortex BA9
海马
Hypothalamus
伏隔核基底神经节
putamen basal ganglia
元

Gene in Data Sources
基因集名称 基因组方法 Description 信息
CV:GWASdb Genome-wide Association Studies 精神分裂症的GWASDB记录
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 2
表达 元-analysis of gene expression p价值：2.556

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） Beta (dis) fdr（dis） 学习
CG02056144 12 54070517 ATP5G2 3.51E-5 0.649 0.02 DMG：Wockner_2014
cg22997177 12 54070527 ATP5G2 5.968E-4 0.746 0.05 DMG：Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
rs59921666 12 53688489 ATP5G2 ENSG00000135390.13 4.107E-6 0 382703 gtex_brain_putamen_basal
RS11170594 12 53944119 ATP5G2 ENSG00000135390.13 1.942E-8 0 127073 gtex_brain_putamen_basal
RS7970047 12 53971255 ATP5G2 ENSG00000135390.13 3.812E-6 0 99937 gtex_brain_putamen_basal
rs4019971 12 53978715 ATP5G2 ENSG00000135390.13 6.165E-7 0 92477 gtex_brain_putamen_basal
RS3852551 12 53979505 ATP5G2 ENSG00000135390.13 6.059E-7 0 91687 gtex_brain_putamen_basal
RS10783586 12 53980821 ATP5G2 ENSG00000135390.13 4.354e-6 0 90371 gtex_brain_putamen_basal
RS10876466 12 53981426 ATP5G2 ENSG00000135390.13 6.059E-7 0 89766 gtex_brain_putamen_basal
RS7312372 12 53999121 ATP5G2 ENSG00000135390.13 7.667E-7 0 72071 gtex_brain_putamen_basal
rs10747675 12 54000031 ATP5G2 ENSG00000135390.13 4.354e-6 0 71161 gtex_brain_putamen_basal
RS7311902 12 54015236 ATP5G2 ENSG00000135390.13 2.652E-6 0 55956 gtex_brain_putamen_basal
RS7970462 12 54022602 ATP5G2 ENSG00000135390.13 2.082e-8 0 48590 gtex_brain_putamen_basal
RS11170631 12 54041192 ATP5G2 ENSG00000135390.13 2.866E-9 0 30000 gtex_brain_putamen_basal
rs4759278 12 54055801 ATP5G2 ENSG00000135390.13 3.779E-12 0 15391 gtex_brain_putamen_basal
rs112183557 12 54056555 ATP5G2 ENSG00000135390.13 1.722e-11 0 14637 gtex_brain_putamen_basal
RS79942047 12 54056747 ATP5G2 ENSG00000135390.13 5.76e-12 0 14445 gtex_brain_putamen_basal
RS61141630 12 54057067 ATP5G2 ENSG00000135390.13 2.392e-12 0 14125 gtex_brain_putamen_basal
RS56963435 12 54057912 ATP5G2 ENSG00000135390.13 3.782e-12 0 13280 gtex_brain_putamen_basal
RS1971762 12 54058238 ATP5G2 ENSG00000135390.13 3.779E-12 0 12954 gtex_brain_putamen_basal
RS11170639 12 54060451 ATP5G2 ENSG00000135390.13 1.482E-11 0 10741 gtex_brain_putamen_basal
RS7965111 12 54061357 ATP5G2 ENSG00000135390.13 3.779E-12 0 9835 gtex_brain_putamen_basal
RS1800633 12 54063501 ATP5G2 ENSG00000135390.13 3.779E-12 0 7691 gtex_brain_putamen_basal
RS4759279 12 54064888 ATP5G2 ENSG00000135390.13 2.54E-6 0 6304 gtex_brain_putamen_basal
RS10876480 12 54066271 ATP5G2 ENSG00000135390.13 3.779E-12 0 4921 gtex_brain_putamen_basal
RS10876481 12 54066743 ATP5G2 ENSG00000135390.13 3.779E-12 0 4449 gtex_brain_putamen_basal
rs916134 12 54069803 ATP5G2 ENSG00000135390.13 3.055e-13 0 1389 gtex_brain_putamen_basal
rs3892761 12 54070445 ATP5G2 ENSG00000135390.13 2.28e-12 0 747 gtex_brain_putamen_basal
rs12818213 12 54072007 ATP5G2 ENSG00000135390.13 4.421E-13 0 -815 gtex_brain_putamen_basal
rs4759282 12 54072435 ATP5G2 ENSG00000135390.13 1.924e-10 0 -1243 gtex_brain_putamen_basal
RS7963016 12 54072819 ATP5G2 ENSG00000135390.13 1.985e-10 0 -1627 gtex_brain_putamen_basal
RS7976793 12 54073069 ATP5G2 ENSG00000135390.13 3.629E-10 0 -1877 gtex_brain_putamen_basal
rs7312853 12 54073597 ATP5G2 ENSG00000135390.13 1.912E-10 0 -2405 gtex_brain_putamen_basal
RS12424729 12 54073928 ATP5G2 ENSG00000135390.13 1.881E-10 0 -2736 gtex_brain_putamen_basal
RS11170643 12 54074777 ATP5G2 ENSG00000135390.13 3.939E-9 0 -3585 gtex_brain_putamen_basal
RS11170646 12 54087253 ATP5G2 ENSG00000135390.13 2.568E-10 0 -16061 gtex_brain_putamen_basal
rs12830769 12 54087705 ATP5G2 ENSG00000135390.13 1.921E-10 0 -16513 gtex_brain_putamen_basal
RS111714152 12 54092021 ATP5G2 ENSG00000135390.13 8.45e-7 0 -20829 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

No co-expressed genes in brain regions


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005215 转运蛋白活性 nas 8328972
GO:0008289 脂质结合 IEA -
去：0046933 氢离子转运ATP合酶活性，旋转机制 IEA -
去：0046961 氢离子运输ATPase活性，旋转机制 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0006811 离子运输 IEA -
GO:0015992 质子运输 IEA -
GO:0015986 ATP合成耦合质子转运 IEA -
GO：0046034 ATP代谢过程 IEA -
蜂窝组件 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005739 线粒体 IEA -
去：0005753 线粒体质子传输ATP合酶复合物 TAS 8328972
去：0016020 membrane IEA -
GO：0016021 膜不可或缺 IEA -
GO：0016469 质子传输两扇门ATPase复合物 IEA -
GO：0031966 线粒体膜 IEA -
GO:0045263 质子传输ATP合酶复合物，耦合因子F（O） IEA -

Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 # SZGR 2.0 genes in pathway 信息
KEGG氧化磷酸化 135 73 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kegg阿尔茨海默氏病 169 110 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kegg帕金森氏病 133 78 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kegg Huntingtons病 185 109 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Provenzani转移 194 112 All SZGR 2.0 genes in this pathway
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781 1082 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Dairkee Tert目标 380 213 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM1 229 137 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 479 299 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pujana ATM PCC网络 1442 892 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Nuytten Nipp1靶向 769 437 All SZGR 2.0 genes in this pathway
洛佩兹MBD目标 957 597 All SZGR 2.0 genes in this pathway
里克曼肿瘤区分良好，而不是很差 236 139 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath Myc Max目标 775 494 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BYSTRYKH造血细胞和脑QTL Trans 185 114 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mootha Voxphos 87 51 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pomeroy髓母细胞瘤预后DN 43 28 All SZGR 2.0 genes in this pathway
伊万诺娃造血早期祖先 532 309 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Browne HCMV感染24小时DN 148 102 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ZHANG RESPONSE TO CANTHARIDIN DN 69 46 All SZGR 2.0 genes in this pathway
周TNF信号30分钟 54 36 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hillion HMGA1目标 90 71 All SZGR 2.0 genes in this pathway
GAVIN FOXP3 TARGETS CLUSTER T7 98 63 All SZGR 2.0 genes in this pathway
黄线粒体基因模块 217 122 All SZGR 2.0 genes in this pathway
马洛尼对17aag的回应 41 26 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MOOTHA HUMAN MITODB 6 2002 429 260 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mootha线粒体 447 277 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hsiao家政基因 389 245 All SZGR 2.0 genes in this pathway
MILI PSEUDOPODIA HAPTOTAXIS DN 668 419 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Boyault肝癌子类G1 UP 113 70 All SZGR 2.0 genes in this pathway
CAIRO HEPATOBLASTOMA CLASSES UP 605 377 All SZGR 2.0 genes in this pathway
由MYC约束 1103 714 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Chicas RB1靶向低血清 100 51 All SZGR 2.0 genes in this pathway

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 miRNA ID mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-101 129 135 1a hsa-miR-101 uacaguacugauaacugaag
miR-125/351 98 104 M8 hsa-miR-125bbrain ucccugagacccuaacuuguga
hsa-miR-125abrain ucccugagacccuuaaccugug
miR-144 128 135 1A，M8 HSA-MIR-144 uacaguauagauguauguaguag