Gene Page:GPRC5B

概括?
基因 51704
Symbol GPRC5B
Synonyms RAIG-2|RAIG2
Description G protein-coupled receptor class C group 5 member B
Reference MIM:605948|HGNC：HGNC：13308|Ensembl:ENSG00000167191|HPRD:16177|织女:OTTHUMG00000131460
Gene type protein-coding
Map location 16p12
Pascal p-value 0.112
Sherlock p-value 0.063
度p-value DEG：Zhao_2015:p=1.02e-04:q=0.0693
Fetal beta -2.347
eGene Myers' cis & trans
Support CompositeSet

数据源中的基因
Gene set name Method of gene set Description Info
CV:GWASdb Genome-wide Association Studies GWASdb records for schizophrenia
CV:PGCnp Genome-wide Association Study GWAS
DEG：Zhao_2015 RNA Sequencing analysis 转录组测序和全基因组的关联分析揭示了精神分裂症和躁郁症中的溶酶体功能和肌动蛋白细胞骨架重塑。
GSMA_IIE Genome scan meta-analysis (European-ancestry samples) Psr: 0.01775

Section I. Genetics and epigenetics annotation

@eQTL annotation

SNP ID Chromosome Position eGene Gene Entrez ID pvalue qvalue TSS distance eQTL type
rs6829546 chr4 12587664 GPRC5B 51704 0.13 trans

Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

Not available

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

No co-expressed genes in brain regions


Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0004872 receptor activity IEA -
GO:0005118 sevenless binding IEA -
GO:0004930 G-protein coupled receptor activity IEA -
生物过程 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0007186 G-protein coupled receptor protein signaling pathway IEA -
GO:0007165 signal transduction IEA -
GO:0007601 visual perception IEA -
Cellular component 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO：0016021 integral to membrane IEA -
GO:0005886 plasma membrane IEA -
GO：0031410 cytoplasmic vesicle IEA -
GO:0030659 cytoplasmic vesicle membrane IEA -

Section V. Pathway annotation

Pathway name Pathway size # SZGR 2.0 genes in pathway Info
PICCALUGA ANGIOIMMUNOBLASTIC LYMPHOMA UP 205 140 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHARAFE BREAST CANCER LUMINAL VS MESENCHYMAL DN 460 312 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DELYS THYROID CANCER UP 443 294 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG ESOPHAGUS CANCER VS NORMAL UP 121 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FARMER BREAST CANCER APOCRINE VS LUMINAL 326 213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 UP 309 199 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUYTTEN NIPP1 TARGETS DN 848 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUYTTEN EZH2 TARGETS UP 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BUYTAERT PHOTODYNAMIC THERAPY STRESS UP 811 508 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIAO HAVE SOX4 BINDING SITES 40 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIAO METASTASIS 539 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RICKMAN METASTASIS UP 344 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHAEFFER PROSTATE DEVELOPMENT 48HR UP 487 286 该途径中的所有SZGR 2.0基因
COLIN PILOCYTIC ASTROCYTOMA VS GLIOBLASTOMA UP 35 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH ES 1 379 235 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CERVERA SDHB TARGETS 2 114 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ASTON MAJOR DEPRESSIVE DISORDER DN 160 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PETROVA ENDOTHELIUM LYMPHATIC VS BLOOD UP 131 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LI WILMS TUMOR VS FETAL KIDNEY 1 UP 182 119 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PETROVA PROX1 TARGETS UP 28 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血干细胞长期 302 191 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE UP 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NIELSEN LIPOSARCOMA UP 18 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LU AGING BRAIN UP 262 186 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 18HR UP 178 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DOUGLAS BMI1 TARGETS UP 566 371 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 COMMON UP 77 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAVIN FOXP3 TARGETS CLUSTER P4 100 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
COATES MACROPHAGE M1 VS M2 DN 78 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WALLACE PROSTATE CANCER RACE UP 299 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMID BREAST CANCER BASAL UP 648 398 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IZADPANAH STEM CELL ADIPOSE VS BONE DN 108 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BRUECKNER TARGETS OF MIRLET7A3 DN 78 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
VANTVEER BREAST CANCER ESR1 DN 240 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HINATA NFKB TARGETS KERATINOCYTE UP 91 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MILI PSEUDOPODIA CHEMOTAXIS DN 457 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MILI PSEUDOPODIA HAPTOTAXIS DN 668 419 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WONG ADULT TISSUE STEM MODULE 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SASSON RESPONSE TO GONADOTROPHINS UP 91 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SASSON RESPONSE TO FORSKOLIN UP 90 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染4小时 55 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金所有障碍OLIGODENDROCYTE NUMBER CORR UP 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHICAS RB1 TARGETS CONFLUENT 567 365 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IKEDA MIR1 TARGETS UP 53 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SERVITJA LIVER HNF1A TARGETS UP 135 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WAKABAYASHI ADIPOGENESIS PPARG RXRA BOUND 8D 882 506 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WAKABAYASHI ADIPOGENESIS PPARG RXRA BOUND WITH H4K20ME1 MARK 145 82 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIEG HYPOXIA NOT VIA KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PHONG TNF RESPONSE NOT VIA P38 337 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RATTENBACHER BOUND BY CELF1 467 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZWANG CLASS 1 TRANSIENTLY INDUCED BY EGF 516 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

miRNA family Target position miRNA ID miRNA seq
UTR start UTR end Match method
miR-148/152 1267 1273 m8 hsa-miR-148a UCAGUGCACUACAGAACUUUGU
hsa-miR-152brain UCAGUGCAUGACAGAACUUGGG
hsa-miR-148b UCAGUGCAUCACAGAACUUUGU
miR-23 151 158 1A,m8 hsa-miR-23abrain AUCACAUUGCCAGGGAUUUCC
hsa-miR-23bbrain AUCACAUUGCCAGGGAUUACC
miR-323 151 157 1A hsa-miR-323brain gcacauuacggucgaccucu
miR-326 14 20 1A hsa-miR-326 ccucugggcccuccag
mir-96 617 624 1A,m8 hsa-miR-96brain UUUGGCACUAGCACAUUUUUGC