基因页：Rab23
概括？
| 基因 | 51715 |
| 象征 | Rab23 |
| 同义词 | HSPC137 |
| 描述 | RAB23，成员Ras Oncogene家族 |
| 参考 | MIM：606144|HGNC：HGNC：14263|ENSEMBL：ENSG00000112210|HPRD：05850| |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 6p11 |
| Pascal P值 | 0.035 |
| Sherlock P值 | 0.376 |
| 胎儿β | 0.438 |
| DMG | 2（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 3 |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 3 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG18606378 | 6 | 57087261 | Rab23 | 1.942E-4 | -0.652 | 0.035 | DMG：Wockner_2014 |
| CG11240439 | 6 | 57087088 | Rab23 | 2.285E-4 | -0.291 | 0.036 | DMG：Wockner_2014 |
| CG26430450 | 6 | 57087242 | Rab23 | 2.8e-9 | -0.008 | 1.99E-6 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
| 去：0005525 | GTP结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007399 | 神经系统的发展 | IEA | 神经突（GO期限：5） | - |
| 去：0007165 | 信号转导 | IEA | - | |
| 去：0007264 | 小GTPase介导的信号转导 | IEA | - | |
| 去：0015031 | 蛋白质运输 | IEA | - | |
| GO：0042733 | 胚胎数字形态发生 | IEA | - | |
| GO：0021513 | 脊髓背或腹侧图案 | IEA | - | |
| GO：0045861 | 蛋白水解的负调控 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005886 | 质膜 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg刺猬信号通路 | 56 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID刺猬Gli途径 | 48 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gargalovic对氧化磷脂的反应绿色 | 23 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath循环基因 | 648 | 385 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mir192和Mir215的Georges目标 | 893 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shen Smarca2目标 | 424 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 牙肺纹状横纹肌肉瘤DN | 408 | 274 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nielsen Leomomyosarcoma CNN1 UP | 19 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 骨骼DN中的Smid乳腺癌复发 | 315 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SMID乳腺癌腔B DN | 564 | 326 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smid乳腺癌基础 | 648 | 398 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 惠特菲尔德细胞周期G1 S | 147 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bruins通过TP53组B响应UVC响应 | 549 | 316 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smirnov对IR 6小时的回应 | 166 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-182 | 711 | 717 | 1a | HSA-MIR-182 | uuuggcaaugguagaacucaca |
| mir-25/32/92/363/367 | 500 | 507 | 1A，M8 | HSA-MIR-25脑 | Cauugcacuugucucggucuga |
| HSA-MIR-32 | uauugcacauacuaaguugc | ||||
| HSA-MIR-92 | uauugcacuugucccgcgcug | ||||
| HSA-MIR-367 | Aauugcacuuuagcaaugga | ||||
| HSA-MIR-92BSZ | uauugcacucgucccgcgcuc | ||||
| mir-96 | 710 | 717 | 1A，M8 | HSA-MIR-96脑 | uuuggcacuagcacauuuuugc |