基因页面:PDYN
总结吗?
| GeneID | 5173年 |
| 象征 | PDYN |
| 同义词 | ADCA | PENKB | SCA23 |
| 描述 | prodynorphin |
| 参考 | MIM: 131340|HGNC: HGNC: 8820|运用:ENSG00000101327|HPRD: 08838|织女:OTTHUMG00000031683 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 20 p13 |
| 帕斯卡假定值 | 0.188 |
| 夏洛克假定值 | 0.663 |
| DMG | 1(#研究) |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 元 |
| 支持 | 生成的信号 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| 协会 | 综合优势比方法(太阳et al . 2008),协会研究 | 1 | 链接到SZGene |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、精神分裂,神经 | 点击显示详细信息 |
| GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:2 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
不同甲基化基因| 探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg24377694 | 20. | 1975372 | PDYN | 1.551的军医 | 0.518 | 0.032 | DMG: Wockner_2014 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs6666937 | chr1 | 170286842 | PDYN | 5173年 | 0.16 | 反式 | ||
| rs636167 | chr1 | 237402264 | PDYN | 5173年 | 0.13 | 反式 | ||
| rs13396829 | chr2 | 120222603 | PDYN | 5173年 | 0.06 | 反式 | ||
| rs921163 | chr2 | 205337399 | PDYN | 5173年 | 0.03 | 反式 | ||
| rs13003798 | chr2 | 205355767 | PDYN | 5173年 | 0.03 | 反式 | ||
| rs6746267 | chr2 | 205612604 | PDYN | 5173年 | 0.16 | 反式 | ||
| rs16863576 | chr2 | 223120977 | PDYN | 5173年 | 0.1 | 反式 | ||
| rs9882574 | chr3 | 56944018 | PDYN | 5173年 | 0.05 | 反式 | ||
| rs9862967 | chr3 | 56944181 | PDYN | 5173年 | 0.05 | 反式 | ||
| rs9825359 | chr3 | 56944297 | PDYN | 5173年 | 0.05 | 反式 | ||
| rs9828029 | chr3 | 56949706 | PDYN | 5173年 | 0.01 | 反式 | ||
| rs1392700 | chr3 | 56952899 | PDYN | 5173年 | 0.05 | 反式 | ||
| rs4362744 | chr3 | 87821108 | PDYN | 5173年 | 0.01 | 反式 | ||
| rs16827037 | chr3 | 117203284 | PDYN | 5173年 | 0 | 反式 | ||
| rs16836473 | chr3 | 131078626 | PDYN | 5173年 | 0.19 | 反式 | ||
| rs16847375 | chr3 | 137426961 | PDYN | 5173年 | 0.17 | 反式 | ||
| rs17468523 | chr3 | 137427751 | PDYN | 5173年 | 0.17 | 反式 | ||
| rs16847377 | chr3 | 137427893 | PDYN | 5173年 | 0.17 | 反式 | ||
| rs17481423 | chr3 | 137442185 | PDYN | 5173年 | 0.17 | 反式 | ||
| rs6834153 | chr4 | 8606484 | PDYN | 5173年 | 0.01 | 反式 | ||
| rs7688257 | chr4 | 68126424 | PDYN | 5173年 | 0.13 | 反式 | ||
| rs6894161 | chr5 | 91098032 | PDYN | 5173年 | 0.03 | 反式 | ||
| rs17109939 | chr5 | 148694416 | PDYN | 5173年 | 0.01 | 反式 | ||
| rs226963 | chr6 | 3724120 | PDYN | 5173年 | 0.13 | 反式 | ||
| rs16885600 | chr6 | 22110853 | PDYN | 5173年 | 0.1 | 反式 | ||
| snp_a - 2046639 | 0 | PDYN | 5173年 | 0.04 | 反式 | |||
| rs7749235 | chr6 | 30635592 | PDYN | 5173年 | 0.08 | 反式 | ||
| rs16884095 | chr6 | 53470796 | PDYN | 5173年 | 0.1 | 反式 | ||
| rs887719 | chr7 | 21184272 | PDYN | 5173年 | 3.568的军医 | 反式 | ||
| rs320082 | chr7 | 29105404 | PDYN | 5173年 | 2.379 e-6 | 反式 | ||
| rs317720 | chr7 | 29110633 | PDYN | 5173年 | 3.047的军医 | 反式 | ||
| rs317714 | chr7 | 29115553 | PDYN | 5173年 | 2.17 e - | 反式 | ||
| rs317724 | chr7 | 29120565 | PDYN | 5173年 | 3.047的军医 | 反式 | ||
| rs6942437 | chr7 | 146798442 | PDYN | 5173年 | 0.09 | 反式 | ||
| rs7829733 | chr8 | 9691720 | PDYN | 5173年 | 0.06 | 反式 | ||
| rs10099022 | chr8 | 24510800 | PDYN | 5173年 | 0.02 | 反式 | ||
| rs4242415 | chr8 | 24597175 | PDYN | 5173年 | 0.06 | 反式 | ||
| rs10504043 | chr8 | 41567870 | PDYN | 5173年 | 0.08 | 反式 | ||
| rs16886605 | chr8 | 115894398 | PDYN | 5173年 | 0.04 | 反式 | ||
| rs7020469 | chr9 | 27338005 | PDYN | 5173年 | 0.08 | 反式 | ||
| rs11203077 | chr10 | 91097084 | PDYN | 5173年 | 0.01 | 反式 | ||
| rs16933545 | chr11 | 7918293 | PDYN | 5173年 | 0.1 | 反式 | ||
| rs10834670 | chr11 | 25404015 | PDYN | 5173年 | 0.12 | 反式 | ||
| rs11019015 | chr11 | 90157517 | PDYN | 5173年 | 0.01 | 反式 | ||
| rs12312877 | chr12 | 79751818 | PDYN | 5173年 | 0.07 | 反式 | ||
| rs11066476 | chr12 | 113465366 | PDYN | 5173年 | 0.01 | 反式 | ||
| rs2993290 | chr13 | 113647189 | PDYN | 5173年 | 0.01 | 反式 | ||
| rs1307687 | 0 | PDYN | 5173年 | 0.06 | 反式 | |||
| rs11158850 | chr14 | 70757171 | PDYN | 5173年 | 0 | 反式 | ||
| rs2444983 | chr15 | 33443919 | PDYN | 5173年 | 0.12 | 反式 | ||
| rs16957838 | chr16 | 82630295 | PDYN | 5173年 | 0.1 | 反式 | ||
| rs12452652 | chr17 | 72235560 | PDYN | 5173年 | 7.708的军医 | 反式 | ||
| rs7230403 | chr18 | 54982203 | PDYN | 5173年 | 0.18 | 反式 | ||
| rs1230712 | chr18 | 54992531 | PDYN | 5173年 | 0.04 | 反式 | ||
| rs6039399 | chr20 | 9127493 | PDYN | 5173年 | 0.16 | 反式 | ||
| rs6121844 | chr20 | 60489981 | PDYN | 5173年 | 0.06 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| FRMPD4 | 0.72 | 0.69 |
| THRB | 0.72 | 0.71 |
| RIMBP2 | 0.71 | 0.69 |
| ADAM22 | 0.70 | 0.69 |
| STXBP5 | 0.70 | 0.67 |
| KIF5C | 0.70 | 0.65 |
| CSMD1 | 0.69 | 0.69 |
| DLG2 | 0.69 | 0.67 |
| CYTH3 | 0.69 | 0.68 |
| POU6F2 | 0.69 | 0.64 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| C1orf61 | -0.44 | -0.50 |
| SERF2 | -0.44 | -0.50 |
| WBP1 | -0.44 | -0.44 |
| ENHO | -0.43 | -0.42 |
| RPS27L | -0.43 | -0.47 |
| DBI | -0.41 | -0.43 |
| RFXANK | -0.41 | -0.46 |
| IFI27L2 | -0.40 | -0.47 |
| H2AFJ | -0.40 | -0.47 |
| TMEM219 | -0.40 | -0.40 |
第三部分。基因本体论注释
| 分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去:0001515 | 阿片肽活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0007268 | 突触传递 | 国际能源机构 | Synap神经元,神经递质(术语层面:6) | - - - - - - |
| 去:0007218 | 神经肽信号通路 | 国际能源机构 | 神经递质(术语层面:8) | - - - - - - |
| 蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
| 去:0005576 | 细胞外区域 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
| 去:0005886 | 等离子体膜 | 艾达 | 9047294 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| REACTOME GPCR信号的 | 920年 | 449年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME肽配体受体有约束力 | 188年 | 108年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME类A1受体等视紫红质 | 305年 | 177年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME阿片类信号 | 78年 | 56 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME G蛋白激活 | 27 | 15 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 下游REACTOME GPCR信号 | 805年 | 368年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 我REACTOME Gα信号事件 | 195年 | 114年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| REACTOME GPCR配体结合 | 408年 | 246年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 费雷拉尤因肉瘤不稳定和稳定 | 167年 | 92年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 魏盖尔HNE和过氧化氢氧化应激 | 39 | 29日 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 麦克朗CREB1 DN的目标 | 57 | 39 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 佐藤在胰腺癌2被甲基化 | 50 | 34 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染血巨细胞病毒6小时 | 71年 | 48 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 佐藤在胰腺癌1被甲基化 | 419年 | 273年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染24小时血巨细胞病毒 | 148年 | 96年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| RIZKI肿瘤侵袭性2 d | 69年 | 46 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森MCV6 H3K27ME3 ICP | 74年 | 46 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森MEF和H3K27ME3 ICP | 206年 | 108年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森IPS ICP H3K4ME3和H327ME3 | 126年 | 83年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 米凯尔森ES ICP H3K4ME3和H3K27ME3 | 137年 | 85年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 布朗感染血巨细胞病毒30分钟 | 56 | 38 | 所有SZGR 2.0基因通路 |