SZGR2 - Beplay体育中心

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GeneID	5174
Symbol	PDZK1
同义词	CAP70\|CLAMP\|NHERF-3\|NHERF3\|PDZD1
描述	PDZ域包含1个
参考	MIM:603831\|HGNC：HGNC：8821\|ENSEMBL：ENSG00000174827\|HPRD：04829\|Vega:OTTHUMG00000013735
基因类型	蛋白质编码
地图位置	1q21
胎儿β	-0.435
主持人	小脑 Myers' cis & trans

Gene in Data Sources

基因集名称	基因组方法	描述	信息
CNV：是的	拷贝数变异研究	Manual curation
简历：Gwascat	全基因组关联研究	This data set includes 560 SNPs associated with schizophrenia. A total of 486 genes were mapped to these SNPs within 50kb.
简历：PGCNP	全基因组协会研究	GWAS
PMID：cooccur	高通量文献搜索	PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_I	Genome scan meta-analysis	PSR：0.0235
GSMA_IIA	基因组扫描荟萃分析（所有样品）	PSR：0.00814
Literature	高通量文献搜索	Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenias	点击显示详细信息

Section I. Genetics and epigenetics annotation

EQTL注释

SNP ID	染色体	位置	主持人	Gene Entrez ID	QVALUE	eQTL type
rs1934584	CHR1	245971711	PDZK1	5174	0.05	反式
RS16829545	CHR2	151977407	PDZK1	5174	1.663E-5	反式
RS7584986	CHR2	184111432	PDZK1	5174	0.04	反式
RS16878852	CHR4	27115684	PDZK1	5174	0.01	反式
rs17762315	CHR5	76807576	PDZK1	5174	0.1	反式
rs504430	CHR12	129477364	PDZK1	5174	0.18	反式
RS10847737	CHR12	129507602	PDZK1	5174	0.07	反式
RS16955618	CHR15	29937543	PDZK1	5174	9.479E-5	反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因

第三节。基因本体论注释

Molecular function	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
去：0005215	转运蛋白活性	TAS		9461128
去：0030165	PDZ结构域结合	IPI		16236806\|16738539
去：0008022	蛋白C末端结合	IPI		15304510
Biological process	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
去：0008283	细胞增殖	TAS		9461128
GO：0015893	drug transport	nas		16738539
细胞分量	去学期	证据	神经关键字	PubMed ID
去：0005737	cytoplasm	IEA		-
GO:0016020	membrane	IEA		-

Section IV. Protein-protein interaction annotation

Interactors	别名b	官方全名b	实验	Source	PubMed ID
ABCC2	ABC30 \|cmoat \|DJS \|KIAA1010 \|MRP2 \|CMRP	ATP结合盒，子家庭C（CFTR/MRP），成员2	-	HPRD，Biogrid	10496535\|12615054
AKAP10	d-akap2 \|MGC9414 \|PRKA10	A kinase (PRKA) anchor protein 10	-	HPRD，Biogrid	14531806
CFTR	ABC35 \|ABCC7 \|CF \|CFTR/MRP \|MRP7 \|TNR-CFTR \|DJ760C5.1	囊性纤维化跨膜电导调节剂（ATP结合盒子亚家族C，成员7）	-	HPRD，Biogrid	11051556\|12471024 \|12615054
CLCN3	Clc3 \|CLC-3	氯化物通道3	-	HPRD，Biogrid	12471024
farp2	fir \|frg \|KIAA0793 \|plekhc3	Ferm，Rhogef和Pleckstrin域蛋白2	重构的复合物 Two-hybrid	Biogrid	14531806
GFAP	FLJ45472	胶质原纤维酸性蛋白	Two-hybrid	Biogrid	16189514
PDZK1IP1	DD96 \|MAP17 \|RP1-18D14.5 \|空位	PDZK1相互作用蛋白1	-	HPRD，Biogrid	9461128\|12754212 \|12837682\|14531806
PEX5	FLJ50634 \|FLJ50721 \|FLJ51948 \|PTS1-BP \|pts1r \|PXR1	peroxisomal biogenesis factor 5	Two-hybrid	Biogrid	16189514
Scarb1	CD36L1 \|CLA-1 \|cla1 \|MGC138242 \|sr-bi \|SRB1	清道夫受体B类，成员1	-	HPRD，Biogrid	10829064\|12119305 \|14551195
SLC17A1	MGC126794 \|MGC126796 \|NAPI-1 \|NPT-1 \|NPT1	溶质载体家族17（磷酸钠），成员1	-	HPRD，Biogrid	14531806
SLC22A12	OAT4L \| RST \| URAT1	溶质载体家族22（有机阴离子/尿酸盐转运蛋白），成员12	-	HPRD，Biogrid	14531806
SLC22A4	MGC34546 \|MGC40524 \|八月	溶质载体家族22（有机阳离子/ergothionine Transporter），成员4	重构的复合物 Two-hybrid	Biogrid	14531806
SLC34A3	FLJ38680 \| HHRH \| NPTIIc	溶质载体家族34（磷酸钠），成员3	重构的复合物 Two-hybrid	Biogrid	14531806
SLC9A3	MGC126718 \| MGC126720 \| NHE3	溶质载体家族9（钠/氢交换器），成员3	-	HPRD，Biogrid	14531806
SLC9A3R1	EBP50 \| NHERF \| NHERF1 \| NPHLOP2	溶质载体家族9（钠/氢交换器），成员3调节器1	重构的复合物 Two-hybrid	Biogrid	14531806
SLC9A3R2	E3KARP \| MGC104639 \| NHE3RF2 \| NHERF-2 \| NHERF2 \| OCTS2 \| SIP-1 \| SIP1 \| TKA-1	溶质载体家族9（钠/氢交换器），成员3调节剂2	Two-hybrid	Biogrid	14531806
SLK	KIAA0204 \|洛斯克\|MGC133067 \|stk2 \|BA16H23.1 \|SE20-9	Ste20样激酶（酵母）	重构的复合物 Two-hybrid	Biogrid	14531806
ube2i	C358B7.1 \| P18 \| UBC9	ubiquitin-conjugating enzyme E2I (UBC9 homolog, yeast)	Two-hybrid	Biogrid	14531806

Section V. Pathway annotation

路径名	路径大小	＃szgr 2.0基因	信息
BIOCARTA MTA3 PATHWAY	19	10	All SZGR 2.0 genes in this pathway
turashvili乳房导管癌与导管正常DN	198	110	All SZGR 2.0 genes in this pathway
turashvili乳房导管癌与小叶正常DN	69	43	All SZGR 2.0 genes in this pathway
turashvili乳房小叶癌与导管正常DN	91	53	All SZGR 2.0 genes in this pathway
turashvili乳房小叶癌与小叶正常	94	59	All SZGR 2.0 genes in this pathway
KHSV miRNAS DN的Samols目标	62	35	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Doane乳腺癌ESR1 UP	112	72	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Wang LMO4靶向	372	227	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Tien肠益生菌6小时DN	167	100	All SZGR 2.0 genes in this pathway
剑麻结肠直肠腺瘤DN	291	176	All SZGR 2.0 genes in this pathway
ELVIDGE HYPOXIA DN	146	94	All SZGR 2.0 genes in this pathway
ELVIDGE HYPOXIA BY DMOG DN	59	40	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Gozgit ESR1靶向DN	781	465	All SZGR 2.0 genes in this pathway
农民乳腺癌基础与仙女	330	215	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Schlosser血清反应DN	712	443	All SZGR 2.0 genes in this pathway
KORKOLA YOLK SAC TUMOR	62	33	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Mohankumar TLX1靶向	414	287	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Frasor对雌二醇的反应	37	28	All SZGR 2.0 genes in this pathway
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn	546	351	All SZGR 2.0 genes in this pathway
贝克莫昔芬抵抗DN	52	37	All SZGR 2.0 genes in this pathway
斯托西对雌二醇的反应	50	35	All SZGR 2.0 genes in this pathway
江缺氧癌	83	52	All SZGR 2.0 genes in this pathway
CREIGHTON ENDOCRINE THERAPY RESISTANCE 1	528	324	All SZGR 2.0 genes in this pathway
CREIGHTON ENDOCRINE THERAPY RESISTANCE 4	307	185	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Heller HDAC靶向DN	292	189	All SZGR 2.0 genes in this pathway
MASSARWEH TAMOXIFEN RESISTANCE DN	258	160	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Massarweh对雌二醇的反应	61	47	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Masri对他莫昔芬和芳香酶抑制剂的耐药性向上	20	10	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Smid乳腺癌基础DN	701	446	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Bonome卵巢癌的生存最佳逃亡	246	152	All SZGR 2.0 genes in this pathway
CADWELL ATG16L1 TARGETS UP	93	56	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Poola侵入性乳腺癌DN	134	83	All SZGR 2.0 genes in this pathway
CAIRO HEPATOBLASTOMA UP	207	143	All SZGR 2.0 genes in this pathway
li诱导了自然杀手	307	182	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Chicas RB1靶向衰老	572	352	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Hoelzel NF1靶向	139	93	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Ohguchi肝HNF4A靶向DN	149	85	All SZGR 2.0 genes in this pathway
BHAT ESR1目标不是通过AKT1向上的	211	131	All SZGR 2.0 genes in this pathway
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标	281	183	All SZGR 2.0 genes in this pathway
BRUINS UVC RESPONSE VIA TP53 GROUP C	92	60	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Vandesluis Commd1目标3	89	50	All SZGR 2.0 genes in this pathway
Fortschegger PHF8靶向DN	784	464	All SZGR 2.0 genes in this pathway
前列腺癌模型DN中的Acevedo FGFR1靶标	308	187	All SZGR 2.0 genes in this pathway

基因页：PDZK1