基因页：CDK12
概括？
| 基因 | 51755 |
| 象征 | CDK12 |
| 同义词 | crk7 | crkr | crkrs |
| 描述 | 细胞周期蛋白依赖性激酶12 |
| 参考 | MIM：615514|HGNC：HGNC：24224|ENSEMBL：ENSG00000167258|HPRD：10849|Vega：Otthumg00000133214 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 17q12 |
| Pascal P值 | 0.001 |
| 胎儿β | 0.386 |
| DMG | 1（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG22133495 | 17 | 37618498 | CDK12 | 9.47e-9 | -0.016 | 4.22E-6 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0004693 | 细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶活性 | IEA | 神经元（GO期限：8） | - |
| 去：0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
| 去：0003702 | RNA聚合酶II转录因子活性 | nas | 11683387 | |
| 去：0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
| GO：0016740 | 转移酶活性 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0046777 | 蛋白氨基酸自磷酸化 | 艾达 | 11683387 | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005634 | 核 | 艾达 | 11683387 | |
| GO：0016607 | 核斑点 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 家长mtor信号向上 | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gary CD5目标DN | 431 | 263 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多恩乳腺癌课程 | 72 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Basaki YBX1靶向DN | 384 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| vecchi胃癌早期 | 430 | 232 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 奥斯曼膀胱癌DN | 406 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dittmer Pthlh靶向 | 112 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 农民乳腺癌簇8 | 7 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath SOX2目标 | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nikolsky乳腺癌17q11 Q21 Amplicon | 133 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smid乳腺癌ERBB2 UP | 147 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 等级结肠和直肠癌DN | 101 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 米利假足 | 518 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rattenbacher由Celf1绑定 | 467 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-143 | 560 | 566 | 1a | HSA-MIR-143脑 | ugagaugaagcacuguagcuca |
| mir-494 | 541 | 547 | M8 | HSA-MIR-494脑 | ugaaacauacgggaaaccucuu |