基因页：SYT17
概括？
| 基因 | 51760 |
| 象征 | SYT17 |
| 同义词 | Sytxvii |
| 描述 | Synaptotagmin 17 |
| 参考 | HGNC：HGNC：24119|ENSEMBL：ENSG00000103528|HPRD：17425|Vega：Otthumg00000131461 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 16p12.3 |
| Pascal P值 | 0.114 |
| 胎儿β | -2.754 |
| DMG | 2（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 3 |
| DMG：Nishioka_2013 | 全基因组DNA甲基化分析 | 作者研究了来自18例第一期精神分裂症（FESZ）和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 | 3 |
| gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析（欧洲官方样品） | PSR：0.01775 | |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG12454725 | 16 | 19179231 | SYT17 | -0.017 | 0.7 | DMG：Nishioka_2013 | |
| CG01516580 | 16 | 19179433 | SYT17 | 6.07E-9 | -0.01 | 3.22E-6 | DMG：JAFFE_2016 |
| CG12454725 | 16 | 19179231 | SYT17 | 6.27E-9 | -0.011 | 3.3e-6 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005215 | 转运蛋白活性 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006810 | 运输 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0008021 | 突触囊泡 | IEA | 突触，神经递质（GO期限：12） | - |
| 去：0016020 | 膜 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 中村肿瘤区周围与中央DN | 634 | 384 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fulcher炎症反应凝集素与LPS | 579 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HOOI ST7靶向DN | 123 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Doane乳腺癌ESR1 UP | 112 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Odonnell TFRC靶向 | 456 | 228 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MYC和TFRC的Odonnell目标 | 83 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Senese HDAC1靶向DN | 260 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| sabates结直肠腺瘤尺寸DN | 14 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dairkee Tert目标DN | 124 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 王HCP前列腺癌 | 111 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| UEDA中央时钟 | 88 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ross AML带有MLL融合 | 78 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Jazaeri乳腺癌BRCA1 vs BRCA2 DN | 43 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McClung Creb1靶向 | 100 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性3 | 720 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SMID乳腺癌腔内B | 172 | 109 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shedden肺癌良好生存A5 | 70 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Poola侵入性乳腺癌DN | 134 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boyault肝癌子类G6 DN | 19 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 开罗肝母细胞瘤DN | 267 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gutierrez慢性淋巴细胞性白血病DN | 56 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim所有疾病Calb1 Corr Up | 548 | 370 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CTBP1的PURBEY目标不是SATB1 | 344 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Fortschegger PHF8靶向DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rattenbacher由Celf1绑定 | 467 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 前列腺癌模型DN中的Acevedo FGFR1靶标 | 308 | 187 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-542-3p | 62 | 68 | 1a | HSA-MIR-542-3P | ugugacauugauaacugaaa |