概括
基因 51761
象征 ATP8A2
同义词 ATP | ATPIB | CAMRQ4 | IB | ML-1
描述 ATPase磷脂运输8A2
参考 MIM:605870|HGNC:HGNC:13533|ENSEMBL:ENSG00000132932|HPRD:05795|Vega:Otthumg0000000016611
基因类型 蛋白质编码
地图位置 13Q12
Pascal P值 0.146
胎儿β -1.274
主持人 小脑
迈尔斯的顺式和跨性别
支持 Ascano FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS12997903 CHR2 1952083 ATP8A2 51761 0.19 反式
RS6733654 CHR2 1963270 ATP8A2 51761 0.04 反式
RS934955 CHR2 193537127 ATP8A2 51761 0.16 反式
RS6772815 CHR3 5164768 ATP8A2 51761 0.12 反式
RS17029291 CHR3 32402138 ATP8A2 51761 0.17 反式
RS17465252 CHR3 118537078 ATP8A2 51761 0.18 反式
RS17069894 CHR4 181542718 ATP8A2 51761 0.05 反式
RS7868778 Chr9 133811342 ATP8A2 51761 0.09 反式
RS4607971 Chr10 19407890 ATP8A2 51761 0 反式
RS10145685 CHR14 22794892 ATP8A2 51761 0.12 反式
RS17793827 CHR14 22797560 ATP8A2 51761 0.05 反式
RS10136383 CHR14 22801078 ATP8A2 51761 0.05 反式
RS624778 CHR15 48073967 ATP8A2 51761 0.06 反式
RS532707 CHR15 48074070 ATP8A2 51761 0.06 反式
RS553338 CHR15 48076921 ATP8A2 51761 0.06 反式
RS596942 CHR15 48082150 ATP8A2 51761 0.05 反式
RS1761450 CHR19 54818034 ATP8A2 51761 0.14 反式
RS9637082 CHR21 21213235 ATP8A2 51761 1.26E-4 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0000287 镁离子结合 IEA -
去:0004012 磷脂 - 转移ATPase活性 IEA -
去:0005524 ATP结合 IEA -
GO:0016787 水解酶活性 IEA -
GO:0016820 水解酶活性,作用在酸酐上,催化物质的跨膜运动 IEA -
GO:0015662 ATPase活性,与离子的跨膜运动耦合,磷酸化机制 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0008285 细胞增殖的阴性调节 塔斯 10551800
去:0006810 运输 IEA -
GO:0015914 磷脂转运 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
小分子的反应组跨膜转运 413 270 该途径中的所有SZGR 2.0基因
P型ATPases的Reactome离子传输 34 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome离子通道传输 55 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AKL HTLV1感染DN 68 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄端癌DN 82 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
加鲁兹防止线粒体通透性 22 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hatada甲基化在肺癌中 390 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mantovani NFKB目标 43 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mantovani病毒GPCR信号向上 86 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发48小时 487 286 该途径中的所有SZGR 2.0基因
URS脂肪细胞分化 74 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Liu Smarca4目标 64 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng由Foxp3绑定 491 310 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Riggins他莫昔芬抵抗DN 220 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
H3K27ME3 DN的Acevedo肝癌 228 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 435 318 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-150 331 337 1a HSA-MIR-150 ucucccaacccuuguaccagug
mir-203.1 111 117 M8 HSA-MIR-203 ugaaauguuuaggaccacuag
mir-377 274 280 1a HSA-MIR-377 aucacacaaaggaacuuuuugu
mir-495 40 46 M8 HSA-MIR-495 Aaacaaacauggugcacuuuuu
HSA-MIR-495 Aaacaaacauggugcacuuuuu