基因页:ATP8A2
概括?
基因 | 51761 |
象征 | ATP8A2 |
同义词 | ATP | ATPIB | CAMRQ4 | IB | ML-1 |
描述 | ATPase磷脂运输8A2 |
参考 | MIM:605870|HGNC:HGNC:13533|ENSEMBL:ENSG00000132932|HPRD:05795|Vega:Otthumg0000000016611 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 13Q12 |
Pascal P值 | 0.146 |
胎儿β | -1.274 |
主持人 | 小脑 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS12997903 | CHR2 | 1952083 | ATP8A2 | 51761 | 0.19 | 反式 | ||
RS6733654 | CHR2 | 1963270 | ATP8A2 | 51761 | 0.04 | 反式 | ||
RS934955 | CHR2 | 193537127 | ATP8A2 | 51761 | 0.16 | 反式 | ||
RS6772815 | CHR3 | 5164768 | ATP8A2 | 51761 | 0.12 | 反式 | ||
RS17029291 | CHR3 | 32402138 | ATP8A2 | 51761 | 0.17 | 反式 | ||
RS17465252 | CHR3 | 118537078 | ATP8A2 | 51761 | 0.18 | 反式 | ||
RS17069894 | CHR4 | 181542718 | ATP8A2 | 51761 | 0.05 | 反式 | ||
RS7868778 | Chr9 | 133811342 | ATP8A2 | 51761 | 0.09 | 反式 | ||
RS4607971 | Chr10 | 19407890 | ATP8A2 | 51761 | 0 | 反式 | ||
RS10145685 | CHR14 | 22794892 | ATP8A2 | 51761 | 0.12 | 反式 | ||
RS17793827 | CHR14 | 22797560 | ATP8A2 | 51761 | 0.05 | 反式 | ||
RS10136383 | CHR14 | 22801078 | ATP8A2 | 51761 | 0.05 | 反式 | ||
RS624778 | CHR15 | 48073967 | ATP8A2 | 51761 | 0.06 | 反式 | ||
RS532707 | CHR15 | 48074070 | ATP8A2 | 51761 | 0.06 | 反式 | ||
RS553338 | CHR15 | 48076921 | ATP8A2 | 51761 | 0.06 | 反式 | ||
RS596942 | CHR15 | 48082150 | ATP8A2 | 51761 | 0.05 | 反式 | ||
RS1761450 | CHR19 | 54818034 | ATP8A2 | 51761 | 0.14 | 反式 | ||
RS9637082 | CHR21 | 21213235 | ATP8A2 | 51761 | 1.26E-4 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ATP8A2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
去:0000287 | 镁离子结合 | IEA | - | |
去:0004012 | 磷脂 - 转移ATPase活性 | IEA | - | |
去:0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
GO:0016787 | 水解酶活性 | IEA | - | |
GO:0016820 | 水解酶活性,作用在酸酐上,催化物质的跨膜运动 | IEA | - | |
GO:0015662 | ATPase活性,与离子的跨膜运动耦合,磷酸化机制 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0008285 | 细胞增殖的阴性调节 | 塔斯 | 10551800 | |
去:0006810 | 运输 | IEA | - | |
GO:0015914 | 磷脂转运 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
小分子的反应组跨膜转运 | 413 | 270 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
P型ATPases的Reactome离子传输 | 34 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome离子通道传输 | 55 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
AKL HTLV1感染DN | 68 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄端癌DN | 82 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
加鲁兹防止线粒体通透性 | 22 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hatada甲基化在肺癌中 | 390 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mantovani NFKB目标 | 43 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mantovani病毒GPCR信号向上 | 86 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schaeffer前列腺开发48小时 | 487 | 286 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
URS脂肪细胞分化 | 74 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Liu Smarca4目标 | 64 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng由Foxp3绑定 | 491 | 310 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Riggins他莫昔芬抵抗DN | 220 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
H3K27ME3 DN的Acevedo肝癌 | 228 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 | 435 | 318 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-150 | 331 | 337 | 1a | HSA-MIR-150 | ucucccaacccuuguaccagug |
mir-203.1 | 111 | 117 | M8 | HSA-MIR-203 | ugaaauguuuaggaccacuag |
mir-377 | 274 | 280 | 1a | HSA-MIR-377 | aucacacaaaggaacuuuuugu |
mir-495 | 40 | 46 | M8 | HSA-MIR-495脑 | Aaacaaacauggugcacuuuuu |
HSA-MIR-495脑 | Aaacaaacauggugcacuuuuu |