基因页:PEG3
概括?
基因 | 5178 |
象征 | PEG3 |
同义词 | PW1 | ZKSCAN22 | ZNF904 | ZSCAN24 |
描述 | 父亲表达3 |
参考 | MIM:601483|HGNC:HGNC:8826|ENSEMBL:ENSG00000198300|HPRD:03285|Vega:Otthumg00000171953Vega:Otthumg00000171954 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19q13.4 |
Pascal P值 | 0.054 |
Sherlock P值 | 0.005 |
胎儿β | -2.113 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | COMPOSITESET Darnell FMRP目标 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS16849964 | CHR2 | 165802504 | PEG3 | 5178 | 0.15 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PEG3_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
DPYSL3 | 0.94 | 0.90 |
KDM4B | 0.94 | 0.93 |
KCTD7 | 0.94 | 0.93 |
KLF11 | 0.94 | 0.90 |
CSK | 0.94 | 0.93 |
patz1 | 0.94 | 0.92 |
EDC3 | 0.93 | 0.89 |
SS18L1 | 0.93 | 0.91 |
KDM2B | 0.93 | 0.91 |
Znf71 | 0.93 | 0.91 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C5orf53 | -0.73 | -0.77 |
AF347015.27 | -0.71 | -0.87 |
HLA-F | -0.70 | -0.72 |
AF347015.31 | -0.70 | -0.86 |
MT-CO2 | -0.69 | -0.87 |
AF347015.33 | -0.68 | -0.84 |
AIFM3 | -0.68 | -0.69 |
S100B | -0.68 | -0.78 |
aldoc | -0.67 | -0.64 |
mt-cyb | -0.67 | -0.84 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Davicioni分子臂与ERMS | 332 | 228 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim WT1靶向8小时 | 164 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gaussmann MLL AF4融合目标E DN | 22 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄端癌DN | 82 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martoriati MDM4靶向神经上皮 | 176 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jazag TGFB1通过SMAD4向上信号传导 | 108 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM2 | 153 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Koyama Sema3b靶向DN | 411 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Cervera SDHB目标2 | 114 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CERVERA SDHB目标1 DN | 38 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
尼尔森对雄激素DN的反应 | 19 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yao Hoxa10通过孕酮靶向 | 79 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德韦尔衰老肾脏无血DN | 150 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德韦尔老化的肾脏DN | 145 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Aprelikova BRCA1目标 | 49 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染18小时 | 178 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
杰克逊DNMT1靶向DN | 25 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nielsen Gist和滑膜肉瘤 | 20 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bacolod抗烷基化剂DN | 60 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yegnasubramanian前列腺癌 | 128 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马丁内斯RB1靶向 | 673 | 430 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez TP53靶向 | 602 | 364 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1和TP53靶向DN | 591 | 366 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riggi ewing肉瘤祖先 | 430 | 288 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 | 940 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
骨骼DN中的Smid乳腺癌复发 | 315 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础 | 648 | 398 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bonome卵巢癌的生存次优秀 | 510 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boquest干细胞培养与新鲜 | 425 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WU被膀胱癌中的甲基化沉默 | 55 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schraets MLL靶向 | 35 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甜肺癌Kras DN | 435 | 289 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张TLX目标36小时DN | 185 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张TLX目标60小时DN | 277 | 166 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张TLX目标DN | 89 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boyault肝癌子类G1 UP | 113 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yamashita肝癌与Epcam Up | 53 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌亚类S2 | 115 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤 | 207 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄成人组织茎模块 | 721 | 492 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nakayama软组织肿瘤PCA1 DN | 74 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇1的时间反应1 | 68 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向 | 504 | 321 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化 | 570 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Plasari TGFB1目标10小时DN | 244 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Plasari TGFB1通过NFIC 1HR DN信号传导 | 106 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Brideau印迹基因 | 63 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
林乳腺干细胞向上 | 489 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |