基因页:CECR1
概括?
基因 | 51816 |
象征 | CECR1 |
同义词 | ada2 | adgf | idgfl | pan | sneds |
描述 | 猫眼综合征染色体区域,候选1 |
参考 | MIM:607575|HGNC:HGNC:1839|Ensembl:ENSG00000093072|HPRD:10462|Vega:Otthumg00000030726 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 22q11.2 |
Pascal P值 | 0.361 |
Sherlock P值 | 0.291 |
DEG P值 | DEG:SANDERS_2014:DS1_P = -0.140:DS1_BETA = 0.017600:DS2_P = 2.32E-01:DS2_BETA = -0.053:DS2_FDR = 4.84E-01 |
胎儿β | -0.108 |
主持人 | 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 皮质 额叶皮质BA9 下丘脑 伏隔核基底神经节 梭子基底神经节 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DEG:Sanders_2013 | 微阵列 | 使用微阵列在413例和446例对照中使用微阵列(LCLS)上的微阵列进行全基因组基因表达谱。 | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.031 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS1990227 | 22 | 17677175 | CECR1 | ENSG0000000093072.11 | 7.75279E-7 | 0.02 | 25704 | gtex_brain_putamen_basal |
RS12160609 | 22 | 17678195 | CECR1 | ENSG0000000093072.11 | 7.04243E-7 | 0.02 | 24684 | gtex_brain_putamen_basal |
RS17807317 | 22 | 17680519 | CECR1 | ENSG0000000093072.11 | 9.679E-7 | 0.02 | 22360 | gtex_brain_putamen_basal |
RS5992639 | 22 | 17680971 | CECR1 | ENSG0000000093072.11 | 3.99041E-7 | 0.02 | 21908 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2013910 | 22 | 17685194 | CECR1 | ENSG0000000093072.11 | 3.39734E-7 | 0.02 | 17685 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1807517 | 22 | 17685351 | CECR1 | ENSG0000000093072.11 | 3.36607E-7 | 0.02 | 17528 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1807518 | 22 | 17685358 | CECR1 | ENSG0000000093072.11 | 2.48307E-7 | 0.02 | 17521 | gtex_brain_putamen_basal |
RS362129 | 22 | 17690409 | CECR1 | ENSG0000000093072.11 | 1.90974E-6 | 0.02 | 12470 | gtex_brain_putamen_basal |
RS5748944 | 22 | 17692032 | CECR1 | ENSG0000000093072.11 | 4.83868E-7 | 0.02 | 10847 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CECR1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
GO:0016787 | 水解酶活性 | IEA | - | |
去:0008083 | 生长因子活性 | nas | 10756095 | |
GO:0019239 | 脱氨酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0009168 | 嘌呤核糖核苷单磷酸生物合成过程 | IEA | - | |
去:0007275 | 多细胞生物发育 | nas | 10756095 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005794 | 高尔基体 | 艾达 | 18029348 | |
去:0005576 | 细胞外区域 | IEA | - | |
去:0005615 | 细胞外空间 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
thum收缩性心力衰竭 | 423 | 283 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Casorelli急性临时细胞白血病 | 177 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨型性白血病DN | 116 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN | 584 | 395 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath ES 1 | 379 | 235 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HBV感染的Wieland | 101 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
麦克拉克兰牙科龋齿 | 253 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
道格拉斯BMI1靶向 | 566 | 371 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
华莱士前列腺癌竞赛 | 299 | 167 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee区分T淋巴细胞 | 200 | 115 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌亚类S3 | 266 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Wang对GSK3抑制剂SB216763的响应向上 | 397 | 206 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |