概括
基因 51816
象征 CECR1
同义词 ada2 | adgf | idgfl | pan | sneds
描述 猫眼综合征染色体区域,候选1
参考 MIM:607575|HGNC:HGNC:1839|Ensembl:ENSG00000093072|HPRD:10462|Vega:Otthumg00000030726
基因类型 蛋白质编码
地图位置 22q11.2
Pascal P值 0.361
Sherlock P值 0.291
DEG P值 DEG:SANDERS_2014:DS1_P = -0.140:DS1_BETA = 0.017600:DS2_P = 2.32E-01:DS2_BETA = -0.053:DS2_FDR = 4.84E-01
胎儿β -0.108
主持人 尾状基底神经节
小脑半球
小脑
皮质
额叶皮质BA9
下丘脑
伏隔核基底神经节
梭子基底神经节

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DEG:Sanders_2013 微阵列 使用微阵列在413例和446例对照中使用微阵列(LCLS)上的微阵列进行全基因组基因表达谱。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.031

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS1990227 22 17677175 CECR1 ENSG0000000093072.11 7.75279E-7 0.02 25704 gtex_brain_putamen_basal
RS12160609 22 17678195 CECR1 ENSG0000000093072.11 7.04243E-7 0.02 24684 gtex_brain_putamen_basal
RS17807317 22 17680519 CECR1 ENSG0000000093072.11 9.679E-7 0.02 22360 gtex_brain_putamen_basal
RS5992639 22 17680971 CECR1 ENSG0000000093072.11 3.99041E-7 0.02 21908 gtex_brain_putamen_basal
RS2013910 22 17685194 CECR1 ENSG0000000093072.11 3.39734E-7 0.02 17685 gtex_brain_putamen_basal
RS1807517 22 17685351 CECR1 ENSG0000000093072.11 3.36607E-7 0.02 17528 gtex_brain_putamen_basal
RS1807518 22 17685358 CECR1 ENSG0000000093072.11 2.48307E-7 0.02 17521 gtex_brain_putamen_basal
RS362129 22 17690409 CECR1 ENSG0000000093072.11 1.90974E-6 0.02 12470 gtex_brain_putamen_basal
RS5748944 22 17692032 CECR1 ENSG0000000093072.11 4.83868E-7 0.02 10847 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0016787 水解酶活性 IEA -
去:0008083 生长因子活性 nas 10756095
GO:0019239 脱氨酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0009168 嘌呤核糖核苷单磷酸生物合成过程 IEA -
去:0007275 多细胞生物发育 nas 10756095
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005794 高尔基体 艾达 18029348
去:0005576 细胞外区域 IEA -
去:0005615 细胞外空间 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
thum收缩性心力衰竭 423 283 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Casorelli急性临时细胞白血病 177 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨型性白血病DN 116 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN 584 395 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath ES 1 379 235 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HBV感染的Wieland 101 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦克拉克兰牙科龋齿 253 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向 566 371 该途径中的所有SZGR 2.0基因
华莱士前列腺癌竞赛 299 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee区分T淋巴细胞 200 115 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌亚类S3 266 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Wang对GSK3抑制剂SB216763的响应向上 397 206 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因