基因页面:维特
总结吗?
| GeneID | 5212年 |
| 象征 | 维特 |
| 同义词 | - - - - - - |
| 描述 | vitrin |
| 参考 | HGNC: HGNC: 12697|运用:ENSG00000205221|HPRD: 18284|织女:OTTHUMG00000152149 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 2 p22.2 |
| 帕斯卡假定值 | 0.006 |
| eGene | 迈尔斯的顺式和反式 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
| PMID: cooccur | 高通量文献检索 | 系统搜索PubMed的基因共病SCZ关键词。总共有3027个基因包括在内。 | |
| 文学 | 高通量文献检索 | 与精神分裂症Co-occurance关键词:精神分裂症、神经 | 点击显示详细信息 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
认为表
认为表| 基因 | 染色体 | 位置 | 裁判 | Alt | 成绩单 | AA变化 | 突变类型 | 筛选 | CG46 | 特征 | 研究 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 维特 | chr2 | 36970391 | C | T | NM_001177969 NM_001177970 NM_001177971 NM_001177972 NM_053276 |
。 。 。 。 。 |
沉默 沉默 沉默 沉默 沉默 |
精神分裂症 | 认为:Fromer_2014 |
eQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs6714112 | chr2 | 36905012 | 维特 | 5212年 | 0.05 | 独联体 | ||
| rs4670589 | chr2 | 36929220 | 维特 | 5212年 | 0.08 | 独联体 | ||
| rs644651 | chr1 | 43683365 | 维特 | 5212年 | 0.18 | 反式 | ||
| rs1387871 | chr3 | 67343837 | 维特 | 5212年 | 0.06 | 反式 | ||
| rs13362722 | chr6 | 6171044 | 维特 | 5212年 | 0.09 | 反式 | ||
| rs10993634 | chr9 | 93453379 | 维特 | 5212年 | 0.13 | 反式 | ||
| rs10993640 | chr9 | 93467200 | 维特 | 5212年 | 0.13 | 反式 | ||
| rs10509166 | chr10 | 63833921 | 维特 | 5212年 | 0.01 | 反式 | ||
| rs16906076 | chr11 | 20360967 | 维特 | 5212年 | 0.02 | 反式 | ||
| rs5943566 | chrX | 28401493 | 维特 | 5212年 | 0.05 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| LIPG | 0.68 | 0.37 |
| LTBP1 | 0.66 | 0.48 |
| DNMBP | 0.66 | 0.49 |
| EEPD1 | 0.65 | 0.47 |
| JUB | 0.64 | 0.45 |
| NOTCH1 | 0.64 | 0.46 |
| TGIF2 | 0.64 | 0.32 |
| MCM3 | 0.64 | 0.45 |
| STON1-GTF2A1L | 0.64 | 0.39 |
| PALLD | 0.64 | 0.38 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| 说出 | -0.28 | -0.27 |
| GALNTL5 | -0.28 | -0.29 |
| MT1E | -0.28 | -0.25 |
| MT1X | -0.26 | -0.23 |
| MT1G | -0.25 | -0.29 |
| CISD3 | -0.25 | -0.26 |
| NDUFA4 | -0.25 | -0.24 |
| AC019206.3 | -0.25 | -0.29 |
| SFTPC | -0.25 | -0.23 |
| AF347015.27 | -0.24 | -0.23 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| COLINA 4 ebp1和4 ebp2的目标 | 356年 | 214年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 王GSK3反应抑制剂SB216763 | 397年 | 206年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| LIM乳腺干细胞 | 489年 | 314年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NABA ECM糖蛋白 | 196年 | 99年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NABA核心MATRISOME | 275年 | 148年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| NABA MATRISOME | 1028年 | 559年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |