基因页:PFN2
Summary?
基因 | 5217 |
象征 | PFN2 |
同义词 | D3S1319E | PFL |
描述 | profilin 2 |
参考 | MIM:176590|HGNC:HGNC:8882|Ensembl:ENSG00000070087|HPRD:01451|Vega:Otthumg00000159683 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 3Q25.1 |
Pascal P值 | 0.566 |
Sherlock P值 | 0.02 |
胎儿β | 0.278 |
支持 | 结构可塑性 COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
网络 | 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 | PPI网络中最短路径的贡献:0.0086 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PFN2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003779 | 肌动蛋白结合 | nas | - | |
去:0005546 | 磷脂酰肌醇-4,5-双磷酸的结合 | nas | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 15383276|16169070 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007010 | 细胞骨架组织 | IEA | - | |
去:0008064 | 调节肌动蛋白聚合或解聚 | nas | - | |
去:0030036 | 肌动蛋白细胞骨架组织 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
GO:0015629 | 肌动蛋白细胞骨架 | nas | - |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
动作 | PS1TP5BP1 | Actin,Beta | - | HPRD | 10600384 |
ACTG1 | 行为|ACTG |DFNA20 |DFNA26 | 肌动蛋白,伽马1 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
CCDC113 | DKFZP434N1418 |FLJ23555 |HSPC065 | 包含113 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
DDX11 | chl1 |chlr1 |Krg2 |MGC133249 |MGC9335 | 死亡/H(ASP-GLU-ALA-ASP/HIS)盒多肽11(CHL1样旋转酶同源物,S。cerevisiae) | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
dlst | DLTS | 二氢丙酰胺S-核转移酶(2-氧基 - 谷氨酸酯配合物的E2成分) | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
DNM1 | DNM | Dynamin 1 | - | HPRD | 9463375 |
EEF1A1 | CCS-3 |CCS3 |EEF-1 |EEF1A |ef-tu |EF1A |FLJ25721 |graf-1ef |HNGC:16303 |leng7 | MGC102687 | MGC131894 | MGC16224 | PTI1 | eEF1A-1 | 真核翻译伸长因子1 alpha 1 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
EVL | RNB6 | enah/vasp like | - | HPRD,Biogrid | 10945997 |
FAM173A | C16orf24 |MGC2494 | 具有序列相似性的家庭173,成员a | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
FHOD1 | FHOS | formin同源性2包含1个域 | 两个杂交 | Biogrid | 12677009 |
FHOD1 | FHOS | formin同源性2包含1个域 | PFN IIA与FHOS相互作用。 | 绑定 | 12677009 |
FHOD1 | FHOS | formin同源性2包含1个域 | PFN IIA与FHOS78相互作用。 | 绑定 | 12677009 |
FMNL1 | C17orf1 |C17orf1b |FHOD4 |fmnl |KW-13 |MGC133052 |MGC1894 |MGC21878 | 类似于形式的1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 10958683 |
Golgb1 | GCP |gcp372 |Giantin |Golim1 | Golgin B1,Golgi积分膜蛋白 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
我知道 | CSA2 |MGC59741 |红色的 | IK Cytokine,HLA II的下调剂 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
IVNS1ABP | DKFZP686K06216 |flara3 |FLJ10069 |FLJ10411 |FLJ10962 |FLJ35593 |FLJ36593 |HSPC068 |KIAA0850 |ND1 | NS-1 | NS1-BP | NS1BP | 流感病毒NS1A结合蛋白 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
LOC39344 | - | 假设蛋白LOC339344 | - | HPRD | 15615774 |
NDUFB8 | 阿什|Ci-ashi | NADH脱氢酶(泛氨基酮)1 Beta子复合物,8,19KDA | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
plaur | CD87 |UPAR |urkr | 纤溶酶原激活剂,尿激酶受体 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
PTPR | ptpsigma | 蛋白酪氨酸磷酸酶,受体类型,S | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
Rap1gap | KIAA0474 |Rap1ga1 |RAP1GAP1 |Rap1gapii | RAP1 GTPase激活蛋白 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
RNF146 | DKFZP434O1427 |RP3-351K20.1 |DJ351K20.1 | 环手指蛋白146 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
Rock1 | MGC131603 |MGC43611 |P160ROCK |Pro0435 | Rho相关的,含有蛋白激酶1 | - | HPRD,Biogrid | 14517206 |
RPS10 | MGC88819 | 核糖体蛋白S10 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
9月5日 | cdcrel |CDCREL-1 |CDCREL1 |H5 |pnutl1 | 9月5日 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
sgta | 中士|Alphastgt |HSGT | 富含谷氨酰胺的小四肽重复(TPR)含α | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
sin3a | DKFZP434K2235 |FLJ90319 |KIAA0700 | SIN3同源物A,转录调节剂(酵母) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12391155 |
SYN1 | Syn1a |SYN1B |Syni | 突触i | - | HPRD | 9463375 |
terf1 | FLJ41416 |PIN2 |trbf1 |trf |trf1 |htrf1-as |T-TRF1 | 端粒重复结合因子(NIMA相互作用)1 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
vasp | - | 血管扩张剂刺激的磷蛋白 | - | HPRD,Biogrid | 7737110|10882740 |
WDR33 | FLJ11294 |WDC146 | WD重复域33 | 两个杂交 | Biogrid | 16169070 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
肌动蛋白细胞骨架的KEGG调节 | 216 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rho GTPases对肌动蛋白细胞骨架的SIG调节 | 35 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
St FAS信号通路 | 65 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome发育生物学 | 396 | 292 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Axon指导 | 251 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Robo受体的反应组信号传导 | 30 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
渡边直肠癌放射疗法反应性DN | 92 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gozgit ESR1靶向DN | 781 | 465 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Provenzani转移DN | 136 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
chiaradonna肿瘤转化cdc25 | 120 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
chebotaev gr目标dn | 120 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann血清剥夺DN的细胞凋亡 | 234 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素的Graessmann凋亡 | 1142 | 669 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和阿霉素的反应 | 612 | 367 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal乳房4 5WK | 271 | 175 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal TGFB1靶向DN | 62 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HU血管生成DN | 37 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LI在肺癌中扩增 | 178 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过ELK3 UP总缺氧 | 209 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tarte浆细胞与Plasmablast向上 | 398 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn | 546 | 351 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 | 555 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
松本自然杀手差分 | 475 | 313 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Tavor Cebpa靶向DN | 30 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Petrova内皮淋巴与血液DN | 162 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FAELT B CLL具有VH重排DN | 48 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sesto对UV C8的反应 | 72 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
贝尔德糖尿病性肾病DN | 434 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性2 | 473 | 224 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
riggins他莫昔芬抗性 | 66 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向 | 317 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 | 461 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伽玛辐射8G后的生存率不佳 | 95 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伽玛辐射2G后的生存率不佳 | 171 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1靶向DN | 543 | 317 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez TP53目标DN | 593 | 372 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1和TP53靶向DN | 591 | 366 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
POS对组胺的反应 | 13 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
POS组胺反应网络 | 32 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础 | 648 | 398 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mir34b和Mir34C的丰田目标 | 463 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张乳腺癌祖细胞 | 425 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Cromer肿瘤发生 | 63 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌的生存率差A6 | 456 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
4EBP1和4EBP2的COLINA目标 | 356 | 214 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足 | 518 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Jison Sickle细胞疾病DN | 181 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boyault肝癌子类G3 UP | 188 | 121 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
woo肝癌复发 | 105 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝脏开发 | 166 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄成人组织茎模块 | 721 | 492 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇的时间反应16 | 79 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 | 682 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病Calb1 Corr Up | 548 | 370 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
verhaak胶质母细胞瘤pro | 177 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
figueroa aml甲基化簇1 | 125 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
figueroa aml甲基化簇2向上 | 54 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
figueroa aml甲基化簇3 | 170 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
figueroa aml甲基化簇4 | 112 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
figueroa aml甲基化簇6 | 140 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
figueroa aml甲基化簇7 | 118 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
卡mir302a目标 | 77 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标2 DN | 336 | 211 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Delpuech FOXO3靶向DN | 41 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2靶向DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CTBP1的PURBEY目标不是SATB1 | 344 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gobert少突胶质细胞分化DN | 1080 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krieg KDM3A靶向缺氧 | 208 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
miR-133 | 866 | 872 | 1a | HSA-MIR-133A | uugguccccuucaaccagcugu |
HSA-MIR-133B | uguguccccuucaaccagcua | ||||
mir-138 | 767 | 773 | M8 | HSA-MIR-138脑 | Agcugguuguguugaauc |
mir-150 | 401 | 407 | M8 | HSA-MIR-150 | ucucccaacccuuguaccagug |
mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D | 350 | 356 | M8 | HSA-MIR-17-5P | caaagugcuuacugcagguagu |
HSA-MIR-20A脑 | uaaagugcuuauagugcagguag | ||||
HSA-MIR-106A | aaaagugcuuacugugcagguagc | ||||
HSA-MIR-106BSZ | uaaagugcugacagugcagau | ||||
HSA-MIR-20BSZ | caaagugcuugugcagguag | ||||
HSA-MIR-519D | caaagugccucccuuuagugugu | ||||
HSA-MIR-17-5P | caaagugcuuacugcagguagu | ||||
HSA-MIR-20A脑 | uaaagugcuuauagugcagguag | ||||
HSA-MIR-106A | aaaagugcuuacugugcagguagc | ||||
HSA-MIR-106BSZ | uaaagugcugacagugcagau | ||||
HSA-MIR-20BSZ | caaagugcuugugcagguag | ||||
HSA-MIR-519D | caaagugccucccuuuagugugu | ||||
mir-183 | 959 | 966 | 1A,M8 | HSA-MIR-183 | uauggcacugguagaauucacug |
HSA-MIR-183 | uauggcacugguagaauucacug | ||||
mir-19 | 761 | 768 | 1A,M8 | HSA-MIR-19A | ugugcaaauaugauaugaaaacuga |
HSA-MIR-19B | ugugcaaauccaugcaaaacuga | ||||
mir-194 | 1151 | 1157 | 1a | HSA-MIR-194 | uguaacagcaacuccauga |
mir-218 | 192 | 198 | 1a | HSA-MIR-218脑 | uugugcuugaucuaaccaugu |
mir-30-5p | 1226 | 1233 | 1A,M8 | HSA-MIR-30A-5P | uguaaaacauccuccugagaag |
HSA-MIR-30C脑 | UGUAAACAUCCUACACUCUCAGC | ||||
HSA-MIR-30DSZ | UGUAAACAUCCCCGACUGGAAG | ||||
HSA-MIR-30BSZ | uguaaacauccuaccucucagcu | ||||
HSA-MIR-30E-5P | uguaaacauccuugacugga | ||||
mir-342 | 993 | 999 | 1a | hsa - mir - 342脑 | ucucacacagaaaucgcacccccguc |
mir-409-5p | 692 | 698 | 1a | HSA-MIR-409-5P | Agguacccgagaacuuugca |
mir-448 | 1188 | 1194 | M8 | HSA-MIR-448 | uugcauauguaggauguccccau |
mir-488 | 836 | 842 | 1a | HSA-MIR-488 | cccagauauggcacucucucaa |
HSA-MIR-488 | cccagauauggcacucucucaa | ||||
mir-493-5p | 1093 | 1099 | M8 | HSA-MIR-493-5p | uuguacaugguaggcuuucauu |
mir - 495 | 1149 | 1155 | 1a | HSA-MIR-495脑 | Aaacaaacauggugcacuuuuu |
mir-7 | 379 | 385 | M8 | HSA-MIR-7SZ | Uggaagacuaguuuuuguug |
mir-93.hd/291-3p/294/295/302/372/373/520 | 349 | 355 | M8 | HSA-MIR-93脑 | aaagugcuguucgugcagguag |
HSA-MIR-302A | uaagugcuugcauguuuguga | ||||
HSA-MIR-302B | uaagugcuuccauguuuaguag | ||||
HSA-MIR-302C | uaagugcuuccauguucagugg | ||||
HSA-MIR-302D | Uaagugcuauguugugugu | ||||
HSA-MIR-372 | aaagugcugcgacauuugagcgu | ||||
HSA-MIR-373 | Gaagugcuucgauuuggggugu | ||||
HSA-MIR-520E | Aaagugcuuuuuugaggg | ||||
HSA-MIR-520A | aaagugcuucccuuguggugu | ||||
HSA-MIR-520B | aaagugcuuuuuuagaggg | ||||
HSA-MIR-520C | aaagugcuuuuuuaggggug | ||||
HSA-MIR-520D | aaaguguuugugggguggguu |