Summary
基因 5217
象征 PFN2
同义词 D3S1319E | PFL
描述 profilin 2
参考 MIM:176590|HGNC:HGNC:8882|Ensembl:ENSG00000070087|HPRD:01451|Vega:Otthumg00000159683
基因类型 蛋白质编码
地图位置 3Q25.1
Pascal P值 0.566
Sherlock P值 0.02
胎儿β 0.278
支持 结构可塑性
COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 PPI网络中最短路径的贡献:0.0086

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003779 肌动蛋白结合 nas -
去:0005546 磷脂酰肌醇-4,5-双磷酸的结合 nas -
去:0005515 蛋白质结合 IPI 15383276|16169070
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007010 细胞骨架组织 IEA -
去:0008064 调节肌动蛋白聚合或解聚 nas -
去:0030036 肌动蛋白细胞骨架组织 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005737 细胞质 IEA -
GO:0015629 肌动蛋白细胞骨架 nas -

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
动作 PS1TP5BP1 Actin,Beta - HPRD 10600384
ACTG1 行为|ACTG |DFNA20 |DFNA26 肌动蛋白,伽马1 两个杂交 Biogrid 16169070
CCDC113 DKFZP434N1418 |FLJ23555 |HSPC065 包含113 两个杂交 Biogrid 16169070
DDX11 chl1 |chlr1 |Krg2 |MGC133249 |MGC9335 死亡/H(ASP-GLU-ALA-ASP/HIS)盒多肽11(CHL1样旋转酶同源物,S。cerevisiae) 两个杂交 Biogrid 16169070
dlst DLTS 二氢丙酰胺S-核转移酶(2-氧基 - 谷氨酸酯配合物的E2成分) 两个杂交 Biogrid 16169070
DNM1 DNM Dynamin 1 - HPRD 9463375
EEF1A1 CCS-3 |CCS3 |EEF-1 |EEF1A |ef-tu |EF1A |FLJ25721 |graf-1ef |HNGC:16303 |leng7 | MGC102687 | MGC131894 | MGC16224 | PTI1 | eEF1A-1 真核翻译伸长因子1 alpha 1 两个杂交 Biogrid 16169070
EVL RNB6 enah/vasp like - HPRD,Biogrid 10945997
FAM173A C16orf24 |MGC2494 具有序列相似性的家庭173,成员a 两个杂交 Biogrid 16169070
FHOD1 FHOS formin同源性2包含1个域 两个杂交 Biogrid 12677009
FHOD1 FHOS formin同源性2包含1个域 PFN IIA与FHOS相互作用。 绑定 12677009
FHOD1 FHOS formin同源性2包含1个域 PFN IIA与FHOS78相互作用。 绑定 12677009
FMNL1 C17orf1 |C17orf1b |FHOD4 |fmnl |KW-13 |MGC133052 |MGC1894 |MGC21878 类似于形式的1 亲和力捕获 - 韦斯特恩
重构的复合物
Biogrid 10958683
Golgb1 GCP |gcp372 |Giantin |Golim1 Golgin B1,Golgi积分膜蛋白 两个杂交 Biogrid 16169070
我知道 CSA2 |MGC59741 |红色的 IK Cytokine,HLA II的下调剂 两个杂交 Biogrid 16169070
IVNS1ABP DKFZP686K06216 |flara3 |FLJ10069 |FLJ10411 |FLJ10962 |FLJ35593 |FLJ36593 |HSPC068 |KIAA0850 |ND1 | NS-1 | NS1-BP | NS1BP 流感病毒NS1A结合蛋白 两个杂交 Biogrid 16169070
LOC39344 - 假设蛋白LOC339344 - HPRD 15615774
NDUFB8 阿什|Ci-ashi NADH脱氢酶(泛氨基酮)1 Beta子复合物,8,19KDA 两个杂交 Biogrid 16169070
plaur CD87 |UPAR |urkr 纤溶酶原激活剂,尿激酶受体 两个杂交 Biogrid 16169070
PTPR ptpsigma 蛋白酪氨酸磷酸酶,受体类型,S 两个杂交 Biogrid 16169070
Rap1gap KIAA047​​4 |Rap1ga1 |RAP1GAP1 |Rap1gapii RAP1 GTPase激活蛋白 两个杂交 Biogrid 16169070
RNF146 DKFZP434O1427 |RP3-351K20.1 |DJ351K20.1 环手指蛋白146 两个杂交 Biogrid 16169070
Rock1 MGC131603 |MGC43611 |P160ROCK |Pro0435 Rho相关的,含有蛋白激酶1 - HPRD,Biogrid 14517206
RPS10 MGC88819 核糖体蛋白S10 两个杂交 Biogrid 16169070
9月5日 cdcrel |CDCREL-1 |CDCREL1 |H5 |pnutl1 9月5日 两个杂交 Biogrid 16169070
sgta 中士|Alphastgt |HSGT 富含谷氨酰胺的小四肽重复(TPR)含α 两个杂交 Biogrid 16169070
sin3a DKFZP434K2235 |FLJ90319 |KIAA0700 SIN3同源物A,转录调节剂(酵母) 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 12391155
SYN1 Syn1a |SYN1B |Syni 突触i - HPRD 9463375
terf1 FLJ41416 |PIN2 |trbf1 |trf |trf1 |htrf1-as |T-TRF1 端粒重复结合因子(NIMA相互作用)1 两个杂交 Biogrid 16169070
vasp - 血管扩张剂刺激的磷蛋白 - HPRD,Biogrid 7737110|10882740
WDR33 FLJ11294 |WDC146 WD重复域33 两个杂交 Biogrid 16169070


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
肌动蛋白细胞骨架的KEGG调节 216 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rho GTPases对肌动蛋白细胞骨架的SIG调节 35 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
St FAS信号通路 65 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome发育生物学 396 292 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Axon指导 251 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Robo受体的反应组信号传导 30 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
渡边直肠癌放射疗法反应性DN 92 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Provenzani转移DN 136 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
chiaradonna肿瘤转化cdc25 120 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
chebotaev gr目标dn 120 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann血清剥夺DN的细胞凋亡 234 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素的Graessmann凋亡 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素的反应 612 367 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房4 5WK 271 175 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal TGFB1靶向DN 62 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HU血管生成DN 37 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LI在肺癌中扩增 178 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过ELK3 UP总缺氧 209 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与Plasmablast向上 398 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 555 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
松本自然杀手差分 475 313 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tavor Cebpa靶向DN 30 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Petrova内皮淋巴与血液DN 162 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FAELT B CLL具有VH重排DN 48 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sesto对UV C8的反应 72 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
贝尔德糖尿病性肾病DN 434 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性2 473 224 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggins他莫昔芬抗性 66 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向 317 208 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 461 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伽玛辐射8G后的生存率不佳 95 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伽玛辐射2G后的生存率不佳 171 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1靶向DN 543 317 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53目标DN 593 372 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向DN 591 366 该途径中的所有SZGR 2.0基因
POS对组胺的反应 13 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
POS组胺反应网络 32 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础 648 398 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir34b和Mir34C的丰田目标 463 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张乳腺癌祖细胞 425 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Cromer肿瘤发生 63 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌的生存率差A6 456 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
4EBP1和4EBP2的COLINA目标 356 214 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足 518 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Jison Sickle细胞疾病DN 181 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G3 UP 188 121 该途径中的所有SZGR 2.0基因
woo肝癌复发 105 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝脏开发 166 105 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄成人组织茎模块 721 492 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇的时间反应16 79 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病Calb1 Corr Up 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
verhaak胶质母细胞瘤pro 177 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇1 125 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇2向上 54 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇3 170 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇4 112 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇6 140 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
figueroa aml甲基化簇7 118 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
卡mir302a目标 77 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标2 DN 336 211 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delpuech FOXO3靶向DN 41 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CTBP1的PURBEY目标不是SATB1 344 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg KDM3A靶向缺氧 208 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
miR-133 866 872 1a HSA-MIR-133A uugguccccuucaaccagcugu
HSA-MIR-133B uguguccccuucaaccagcua
mir-138 767 773 M8 HSA-MIR-138 Agcugguuguguugaauc
mir-150 401 407 M8 HSA-MIR-150 ucucccaacccuuguaccagug
mir-17-5p/20/93.mr/106/519.D 350 356 M8 HSA-MIR-17-5P caaagugcuuacugcagguagu
HSA-MIR-20A uaaagugcuuauagugcagguag
HSA-MIR-106A aaaagugcuuacugugcagguagc
HSA-MIR-106BSZ uaaagugcugacagugcagau
HSA-MIR-20BSZ caaagugcuugugcagguag
HSA-MIR-519D caaagugccucccuuuagugugu
HSA-MIR-17-5P caaagugcuuacugcagguagu
HSA-MIR-20A uaaagugcuuauagugcagguag
HSA-MIR-106A aaaagugcuuacugugcagguagc
HSA-MIR-106BSZ uaaagugcugacagugcagau
HSA-MIR-20BSZ caaagugcuugugcagguag
HSA-MIR-519D caaagugccucccuuuagugugu
mir-183 959 966 1A,M8 HSA-MIR-183 uauggcacugguagaauucacug
HSA-MIR-183 uauggcacugguagaauucacug
mir-19 761 768 1A,M8 HSA-MIR-19A ugugcaaauaugauaugaaaacuga
HSA-MIR-19B ugugcaaauccaugcaaaacuga
mir-194 1151 1157 1a HSA-MIR-194 uguaacagcaacuccauga
mir-218 192 198 1a HSA-MIR-218 uugugcuugaucuaaccaugu
mir-30-5p 1226 1233 1A,M8 HSA-MIR-30A-5P uguaaaacauccuccugagaag
HSA-MIR-30C UGUAAACAUCCUACACUCUCAGC
HSA-MIR-30DSZ UGUAAACAUCCCCGACUGGAAG
HSA-MIR-30BSZ uguaaacauccuaccucucagcu
HSA-MIR-30E-5P uguaaacauccuugacugga
mir-342 993 999 1a hsa - mir - 342 ucucacacagaaaucgcacccccguc
mir-409-5p 692 698 1a HSA-MIR-409-5P Agguacccgagaacuuugca
mir-448 1188 1194 M8 HSA-MIR-448 uugcauauguaggauguccccau
mir-488 836 842 1a HSA-MIR-488 cccagauauggcacucucucaa
HSA-MIR-488 cccagauauggcacucucucaa
mir-493-5p 1093 1099 M8 HSA-MIR-493-5p uuguacaugguaggcuuucauu
mir - 495 1149 1155 1a HSA-MIR-495 Aaacaaacauggugcacuuuuu
mir-7 379 385 M8 HSA-MIR-7SZ Uggaagacuaguuuuuguug
mir-93.hd/291-3p/294/295/302/372/373/520 349 355 M8 HSA-MIR-93 aaagugcuguucgugcagguag
HSA-MIR-302A uaagugcuugcauguuuguga
HSA-MIR-302B uaagugcuuccauguuuaguag
HSA-MIR-302C uaagugcuuccauguucagugg
HSA-MIR-302D Uaagugcuauguugugugu
HSA-MIR-372 aaagugcugcgacauuugagcgu
HSA-MIR-373 Gaagugcuucgauuuggggugu
HSA-MIR-520E Aaagugcuuuuuugaggg
HSA-MIR-520A aaagugcuucccuuguggugu
HSA-MIR-520B aaagugcuuuuuuagaggg
HSA-MIR-520C aaagugcuuuuuuaggggug
HSA-MIR-520D aaaguguuugugggguggguu