概括
基因 5230
象征 PGK1
同义词 HEL-S-68P | MIG10 | PGKA
描述 磷酸甘油酸激酶1
参考 MIM:311800|HGNC:HGNC:8896|HPRD:02412|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 XQ13.3
Sherlock P值 0.245
胎儿β -1.309
DMG 1(#研究)
支持 细胞代谢
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Vaneijk_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点,对应于精神分裂症患者(n = 260)和未受影响的对照(n = 250)之间的391个独特的转录本。 4
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
表达 基因表达的荟萃分析 p价值:2.078
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG02148711 X 77041559 PGK1 0.003 -5.047 DMG:Vaneijk_2014
CG18449462 X 77155144 PGK1 0.004 -5.189 DMG:Vaneijk_2014
CG26848126 X 77582913 PGK1 0.003 -5.766 DMG:Vaneijk_2014
CG10526888 X 77151237 PGK1 4.415E-4 -5.784 DMG:Vaneijk_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0004618 磷酸甘油酸激酶活性 ISS -
去:0005524 ATP结合 ISS -
GO:0016740 转移酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006096 糖酵解 IEA -
GO:0016310 磷酸化 ISS -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005737 细胞质 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG糖酵解糖异生 62 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
生物胶质糖酵解途径 10 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID HIF2Pathway 34 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID HIF1 TFPathway 66 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组糖酵解 29 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组糖异生 34 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
碳水化合物的反应组代谢 247 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组葡萄糖代谢 69 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
冬季缺氧 92 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
家长mtor信号向上 567 375 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村肿瘤区周围与中央DN 634 384 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gary CD5目标 473 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Puiffe入侵被腹水抑制 82 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
casorelli急性临时细胞白血病DN 663 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Borczuk恶性间皮瘤 305 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Horiuchi WTAP目标DN 310 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Basaki YBX1靶向DN 384 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bogni治疗与髓样白血病有关 30 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
莱茵所有糖皮质激素治疗DN 362 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tien肠益生菌2小时 27 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Tien肠益生菌6小时 55 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
埃尔维奇缺氧 171 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DMOG的Elvidge缺氧 130 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Elvidge Hif1a靶向​​DN 91 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Elvidge HIF1A和HIF2A靶向DN 104 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
berenjeno由Rhoa Up Troment 536 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KAN对砷三氧化物的反应 123 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche皮肤肿瘤启动子 142 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche Papilloma风险低 162 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche Papilloma风险高 147 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
darwiche鳞状细胞癌 146 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hwang前列腺癌标记 28 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Appierto对Fenretinide DN的反应 51 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
悍马皮肤癌进展 88 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
李肺癌 41 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
农民乳腺癌根源与腔内 326 213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应DN 712 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌 747 453 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向神经上皮 176 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向胎儿肝 227 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gruetzmann胰腺癌 358 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC网络 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GROSS HIF1A靶向DN 25 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过ELK3和HIF1A的总缺氧 142 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
带有E盒的WEI MYCN目标 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发12小时 116 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Colin Pilocytic星形胶质细胞瘤与胶质母细胞瘤DN 28 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Peng Leucine剥夺DN 187 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈肺癌的生存 28 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vantveer乳腺癌转移DN 121 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tarte浆细胞与Plasmablast DN 309 206 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭葡萄糖剥夺DN 169 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭雷帕霉素反应dn 245 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 555 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
量缺氧 98 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Greenbaum E2A靶向 33 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kaab失败的心房DN 141 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
哈里斯缺氧 81 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ramaswamy转移DN 61 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯对trabectedin的反应 71 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伦纳德缺氧 47 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dazard对紫外线nhek的反应 244 151 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dazard对UV SCC的反应 123 75 该途径中的所有SZGR 2.0基因
dazard UV响应集群G1 67 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Semenza HIF1目标 36 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
江口大脑皮层DN 54 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 6小时DN的响应 911 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krige对Tosedostat 24小时DN的反应 1011 592 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肺癌和巨噬细胞的钟分泌组 77 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肺癌和成纤维细胞的钟分泌组 132 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由FOXP3绑定的Marson刺激 1022 619 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sarrio上皮间质转变 180 114 该途径中的所有SZGR 2.0基因
iwanaga癌变由Kras Pten Up 181 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boquest干细胞培养与新鲜 425 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Labbe Wnt3a靶向DN 97 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TGFB1和WNT3A DN的LABBE目标 108 68 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村转移 47 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
中村转移模型 45 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
冬季缺氧metagene 242 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha PGC 420 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chauhan对甲氧基雌二醇DN的反应 102 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura MAPK8目标DN 366 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌克拉斯 491 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌的生存率差A6 456 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
骨髓瘤与成熟B淋巴细胞中的Shaffer IRF4靶标 101 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
活化B淋巴细胞中的Shaffer IRF4靶标 81 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hsiao家政基因 389 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G3 UP 188 121 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类未注释的DN 193 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
非政府组织恶性神经胶质瘤1p loh 17 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fournier腺泡开发2 277 172 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌亚类S1 237 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
穆萨糖异生 32 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha糖酵解 21 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
萨森对促性腺营养蛋白的反应 91 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sasson对Forskolin的反应 90 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病Calb1 Corr Up 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王掺杂基因被SIRT1抑制 28 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vandesluis Commd1目标3 89 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因
双龙雷帕霉素通过TSC1和TSC2敏感 73 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fardin缺氧11 32 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Servitja Islet HNF1A靶向DN 109 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg缺氧不是通过KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
巨噬细胞的库马尔病原体负荷 275 155 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kumar自噬网络 71 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-143 151 157 1a HSA-MIR-143 ugagaugaagcacuguagcuca