概括
基因 5241
象征 PGR
同义词 NR3C3 | Pr
描述 孕酮受体
参考 MIM:607311|HGNC:HGNC:8910|ENSEMBL:ENSG00000082175|HPRD:07077|Vega:Otthumg00000167531
基因类型 蛋白质编码
地图位置 11q22-Q23
Pascal P值 0.232
胎儿β -1.13
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG13906669 11 100999399 PGR 8.61E-9 -0.018 3.99e-6 DMG:JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS7132043 CHR12 80968399 PGR 5241 0.2 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
BCAS2 大坝1 乳腺癌扩增序列2 BCAS2与PR相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的人类BCAS2与PR之间的相互作用建模的。 绑定 15694360
cdc25b - 细胞分裂周期25同源物B(S. pombe) 重构的复合物 Biogrid 11689696
DAP3 DAP-3 |DKFZP686G12159 |MGC126058 |MGC126059 |MRP-S29 |MRPS29 |BMRP-10 死亡相关蛋白3 重构的复合物 Biogrid 10903152
DDX54 DP97 |MGC2835 死亡(ASP-GLU-ALA-ASP)盒多肽54 - HPRD,Biogrid 12466272
ESR1 DKFZP686N23123 |er |ESR |Esra |时代|NR3A1 雌激素受体1 ER-Alpha与PGRA启动子相互作用。 绑定 15019994
ESR1 DKFZP686N23123 |er |ESR |Esra |时代|NR3A1 雌激素受体1 ER-Alpha与PGRB启动子相互作用。 绑定 15019994
FKBP5 FKBP51 |FKBP54 |MGC111006 |p54 |PPIASE |PTG-10 FK506结合蛋白5 - HPRD,Biogrid 12538866
Hist3H3 H3.4 |H3/g |H3FT |H3T |MGC126886 |MGC126888 组蛋白簇3,H3 H3与PGRA启动子相互作用。 绑定 15019994
Hist3H3 H3.4 |H3/g |H3FT |H3T |MGC126886 |MGC126888 组蛋白簇3,H3 H3与PGRB启动子相互作用。 绑定 15019994
Hist4H4 H4/P |MGC24116 组蛋白簇4,H4 H4与PGRB启动子相互作用。 绑定 15019994
Hist4H4 H4/P |MGC24116 组蛋白簇4,H4 H4与PGRA启动子相互作用。 绑定 15019994
HMGB1 DKFZP686A04236 |HMG1 |HMG3 |SBP-1 高机动性组框1 重构的复合物 Biogrid 9671457
HMGB2 HMG2 高机动性组框2 - HPRD,Biogrid 9671457
JDP2 jundm2 二聚化蛋白2 - HPRD 12101239
kat2b CAF |P |P/CAF |PCAF K(赖氨酸)乙酰转移酶2B PRB与PCAF互动。这种相互作用是基于未指定物种的人类PRB和PCAF之间的相互作用建模的。 绑定 9223281
KLF9 BTEB |BTEB1 类似克鲁诗的因子9 - HPRD,Biogrid 12672823
KLF9 BTEB |BTEB1 类似克鲁诗的因子9 KLF9(BTEB1)与PGR(PR-B)相互作用。 绑定 12672823
NCOA1 F-SRC-1 |kat13a |MGC129719 |MGC129720 |NCOA-1 |RIP160 |SRC-1 |src1 |Bhlhe42 核受体共激活因子1 - HPRD,Biogrid 10757795|12529333
PIAS2 MGC102682 |Miz1 |piasx |piasx-alpha |piasx-beta |siz2 |zmiz4 |Miz 活化统计的蛋白质抑制剂2 重构的复合物 Biogrid 11117529
POU2F1 OCT1 |OTF1 POU 2级同型1 重构的复合物 Biogrid 10480874
POU2F2 OCT2 |OTF2 |10月2日 POU 2级HONEOBOX 2 重构的复合物 Biogrid 10480874
PRMT2 HRMT1L1 |MGC111373 蛋白精氨酸甲基转移酶2 PRMT2与PR相互作用。 绑定 12039952
RBM23 Caperbeta |FLJ10482 |MGC4458 |pp239 |RNPC4 RNA结合基序蛋白23 RBM23(Caper-Beta)与PR相互作用。 绑定 15694343
RBM39 刺山|Caperalpha |CC1.3 |DKFZP781C0423 |FLJ44170 |HCC1 |RNPC2 |FSAP59 RNA结合基序蛋白39 RNPC2(CAPER-ALPHA)与PR相互作用。 绑定 15694343
Rela MGC131774 |NFKB3 |P65 V-REL网状内皮症病毒性癌基因同源物A(Avian) - HPRD,Biogrid 8626413
RNF4 Res4-26 |鼻烟 环手指蛋白4 两个杂交 Biogrid 9710597
Smarcd1 BAF60A |cracd1 |RSC6P SWI/SNF相关,矩阵相关,染色质的肌动蛋白依赖性调节剂,亚家族D,成员1 重构的复合物 Biogrid 12917342
SP1 - SP1转录因子 SP1与PGRA启动子相互作用。 绑定 15019994
SP1 - SP1转录因子 SP1与PGRB启动子相互作用。 绑定 15019994
TDG - 胸腺氨酸-DNA糖基酶 重构的复合物 Biogrid 12874288
TRIM24 PTC6 |RNF82 |TF1A |tif1 |tif1a |tif1alpha |HTIF1 三方基序24 - HPRD 9115274
ube3a ancr |AS |e6-ap |epve6ap |FLJ26981 |HPVE6A 泛素蛋白连接酶E3A - HPRD,Biogrid 9891052
UBR5 DD5 |EDD |EDD1 |FLJ11310 |hyd |KIAA0896 |MGC57263 泛素蛋白连接酶E3成分N-验证蛋白5 - HPRD,Biogrid 12011095


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Kegg卵母细胞减数分裂 114 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG孕酮介导的卵母细胞成熟 86 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta MPR途径 34 28 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID时代基因组途径 65 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID炭疽路径 17 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB4的Reactome信号传导 90 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB4的Reactome核信号传导 38 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome通用转录途径 352 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome核受体转录途径 49 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
刘前列腺癌DN 481 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
turashvili乳房小叶癌与小叶正常 94 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础 380 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Doane乳腺癌ESR1 UP 112 72 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
铃木在口腔癌中放大 16 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Honrado乳腺癌BRCA1 vs BRCA2 18 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlesinger甲基化的癌症 88 64 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath PRC2目标 652 441 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bystrykh造血细胞Runx1 9 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans 882 572 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性1 528 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性4 307 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
H3K27me3 196 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Massarweh他莫昔芬抵抗DN 258 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Massarweh对雌二醇的反应 61 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Masri对他莫昔芬和芳香酶抑制剂的耐药性向上 20 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌腔 84 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础DN 701 446 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Matzuk排卵 14 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Matzuk植入和子宫 22 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC HCP带有H3K27ME3 341 243 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应6小时 229 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时 324 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1目标不是通过AKT1向上的 211 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 281 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lim乳腺腔内成熟 116 65 该途径中的所有SZGR 2.0基因