基因页:PGR
概括?
基因 | 5241 |
象征 | PGR |
同义词 | NR3C3 | Pr |
描述 | 孕酮受体 |
参考 | MIM:607311|HGNC:HGNC:8910|ENSEMBL:ENSG00000082175|HPRD:07077|Vega:Otthumg00000167531 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 11q22-Q23 |
Pascal P值 | 0.232 |
胎儿β | -1.13 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG13906669 | 11 | 100999399 | PGR | 8.61E-9 | -0.018 | 3.99e-6 | DMG:JAFFE_2016 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS7132043 | CHR12 | 80968399 | PGR | 5241 | 0.2 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PGR_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
BCAS2 | 大坝1 | 乳腺癌扩增序列2 | BCAS2与PR相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的人类BCAS2与PR之间的相互作用建模的。 | 绑定 | 15694360 |
cdc25b | - | 细胞分裂周期25同源物B(S. pombe) | 重构的复合物 | Biogrid | 11689696 |
DAP3 | DAP-3 |DKFZP686G12159 |MGC126058 |MGC126059 |MRP-S29 |MRPS29 |BMRP-10 | 死亡相关蛋白3 | 重构的复合物 | Biogrid | 10903152 |
DDX54 | DP97 |MGC2835 | 死亡(ASP-GLU-ALA-ASP)盒多肽54 | - | HPRD,Biogrid | 12466272 |
ESR1 | DKFZP686N23123 |er |ESR |Esra |时代|NR3A1 | 雌激素受体1 | ER-Alpha与PGRA启动子相互作用。 | 绑定 | 15019994 |
ESR1 | DKFZP686N23123 |er |ESR |Esra |时代|NR3A1 | 雌激素受体1 | ER-Alpha与PGRB启动子相互作用。 | 绑定 | 15019994 |
FKBP5 | FKBP51 |FKBP54 |MGC111006 |p54 |PPIASE |PTG-10 | FK506结合蛋白5 | - | HPRD,Biogrid | 12538866 |
Hist3H3 | H3.4 |H3/g |H3FT |H3T |MGC126886 |MGC126888 | 组蛋白簇3,H3 | H3与PGRA启动子相互作用。 | 绑定 | 15019994 |
Hist3H3 | H3.4 |H3/g |H3FT |H3T |MGC126886 |MGC126888 | 组蛋白簇3,H3 | H3与PGRB启动子相互作用。 | 绑定 | 15019994 |
Hist4H4 | H4/P |MGC24116 | 组蛋白簇4,H4 | H4与PGRB启动子相互作用。 | 绑定 | 15019994 |
Hist4H4 | H4/P |MGC24116 | 组蛋白簇4,H4 | H4与PGRA启动子相互作用。 | 绑定 | 15019994 |
HMGB1 | DKFZP686A04236 |HMG1 |HMG3 |SBP-1 | 高机动性组框1 | 重构的复合物 | Biogrid | 9671457 |
HMGB2 | HMG2 | 高机动性组框2 | - | HPRD,Biogrid | 9671457 |
JDP2 | jundm2 | 二聚化蛋白2 | - | HPRD | 12101239 |
kat2b | CAF |P |P/CAF |PCAF | K(赖氨酸)乙酰转移酶2B | PRB与PCAF互动。这种相互作用是基于未指定物种的人类PRB和PCAF之间的相互作用建模的。 | 绑定 | 9223281 |
KLF9 | BTEB |BTEB1 | 类似克鲁诗的因子9 | - | HPRD,Biogrid | 12672823 |
KLF9 | BTEB |BTEB1 | 类似克鲁诗的因子9 | KLF9(BTEB1)与PGR(PR-B)相互作用。 | 绑定 | 12672823 |
NCOA1 | F-SRC-1 |kat13a |MGC129719 |MGC129720 |NCOA-1 |RIP160 |SRC-1 |src1 |Bhlhe42 | 核受体共激活因子1 | - | HPRD,Biogrid | 10757795|12529333 |
PIAS2 | MGC102682 |Miz1 |piasx |piasx-alpha |piasx-beta |siz2 |zmiz4 |Miz | 活化统计的蛋白质抑制剂2 | 重构的复合物 | Biogrid | 11117529 |
POU2F1 | OCT1 |OTF1 | POU 2级同型1 | 重构的复合物 | Biogrid | 10480874 |
POU2F2 | OCT2 |OTF2 |10月2日 | POU 2级HONEOBOX 2 | 重构的复合物 | Biogrid | 10480874 |
PRMT2 | HRMT1L1 |MGC111373 | 蛋白精氨酸甲基转移酶2 | PRMT2与PR相互作用。 | 绑定 | 12039952 |
RBM23 | Caperbeta |FLJ10482 |MGC4458 |pp239 |RNPC4 | RNA结合基序蛋白23 | RBM23(Caper-Beta)与PR相互作用。 | 绑定 | 15694343 |
RBM39 | 刺山|Caperalpha |CC1.3 |DKFZP781C0423 |FLJ44170 |HCC1 |RNPC2 |FSAP59 | RNA结合基序蛋白39 | RNPC2(CAPER-ALPHA)与PR相互作用。 | 绑定 | 15694343 |
Rela | MGC131774 |NFKB3 |P65 | V-REL网状内皮症病毒性癌基因同源物A(Avian) | - | HPRD,Biogrid | 8626413 |
RNF4 | Res4-26 |鼻烟 | 环手指蛋白4 | 两个杂交 | Biogrid | 9710597 |
Smarcd1 | BAF60A |cracd1 |RSC6P | SWI/SNF相关,矩阵相关,染色质的肌动蛋白依赖性调节剂,亚家族D,成员1 | 重构的复合物 | Biogrid | 12917342 |
SP1 | - | SP1转录因子 | SP1与PGRA启动子相互作用。 | 绑定 | 15019994 |
SP1 | - | SP1转录因子 | SP1与PGRB启动子相互作用。 | 绑定 | 15019994 |
TDG | - | 胸腺氨酸-DNA糖基酶 | 重构的复合物 | Biogrid | 12874288 |
TRIM24 | PTC6 |RNF82 |TF1A |tif1 |tif1a |tif1alpha |HTIF1 | 三方基序24 | - | HPRD | 9115274 |
ube3a | ancr |AS |e6-ap |epve6ap |FLJ26981 |HPVE6A | 泛素蛋白连接酶E3A | - | HPRD,Biogrid | 9891052 |
UBR5 | DD5 |EDD |EDD1 |FLJ11310 |hyd |KIAA0896 |MGC57263 | 泛素蛋白连接酶E3成分N-验证蛋白5 | - | HPRD,Biogrid | 12011095 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kegg卵母细胞减数分裂 | 114 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG孕酮介导的卵母细胞成熟 | 86 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta MPR途径 | 34 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID时代基因组途径 | 65 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID炭疽路径 | 17 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB4的Reactome信号传导 | 90 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ERBB4的Reactome核信号传导 | 38 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome通用转录途径 | 352 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome核受体转录途径 | 49 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
刘前列腺癌DN | 481 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
turashvili乳房小叶癌与小叶正常 | 94 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与基础 | 380 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Doane乳腺癌ESR1 UP | 112 | 72 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gozgit ESR1靶向DN | 781 | 465 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
铃木在口腔癌中放大 | 16 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Honrado乳腺癌BRCA1 vs BRCA2 | 18 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlesinger甲基化的癌症 | 88 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Benporath PRC2目标 | 652 | 441 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bystrykh造血细胞Runx1 | 9 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性1 | 528 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性4 | 307 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
H3K27me3 | 196 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Massarweh他莫昔芬抵抗DN | 258 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Massarweh对雌二醇的反应 | 61 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Masri对他莫昔芬和芳香酶抑制剂的耐药性向上 | 20 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌腔 | 84 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Matzuk排卵 | 14 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Matzuk植入和子宫 | 22 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC HCP带有H3K27ME3 | 341 | 243 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dutertre雌二醇反应6小时 | 229 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dutertre雌二醇反应24小时 | 324 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BHAT ESR1目标不是通过AKT1向上的 | 211 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 | 281 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lim乳腺腔内成熟 | 116 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |