概括
基因 5243
象征 ABCB1
同义词 ABC20 | CD243 | CLCS | GP170 | MDR1 | P-GP | PGY1
描述 ATP绑定盒子亚家族B成员1
参考 MIM:171050|HGNC:HGNC:40|Ensembl:ENSG00000085563|HPRD:01370|Vega:Otthumg0000000023393
基因类型 蛋白质编码
地图位置 7Q21.12
Pascal P值 6.093E-5
Sherlock P值 0.143
胎儿β -1.587
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 G2CDB.HUMAN_CLATHRIN
g2cdb.human_synaptosom

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
协会 组合的优势比方法(Sun等。2008),协会研究 1 链接到Szgene
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS4728709 CHR7 87233601 ABCB1 5243 0.06 顺式
RS10264856 CHR7 87262580 ABCB1 5243 0.06 顺式
RS17149864 CHR7 87334383 ABCB1 5243 0.06 顺式
RS10227951 CHR7 87364096 ABCB1 5243 0.06 顺式
RS2188828 CHR7 87405350 ABCB1 5243 0.05 顺式
RS9289452 CHR3 133429642 ABCB1 5243 0.03 反式
RS16886446 CHR6 76012046 ABCB1 5243 0.18 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IPI 17088979
去:0005524 ATP结合 塔斯 3768958
GO:0016787 水解酶活性 IEA -
去:0005215 转运蛋白活性 塔斯 3022150
去:0008559 异生物传输ATPase活性 IEA -
GO:0016887 ATPase活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006810 运输 塔斯 3022150
GO:0042493 对药物的反应 塔斯 3022150
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005624 膜分数 塔斯 3022150
去:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 塔斯 3768958
去:0009986 细胞表面 艾达 12493773

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG ABC转运蛋白 44 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta P53Hypoxia途径 23 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta核途径 15 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID HIF1 TFPathway 66 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Abacavir Reactome Abacavir运输和代谢 10 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome ABC家族蛋白介导的运输 34 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
小分子的反应组跨膜转运 413 270 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Deurig t细胞促进性白血病DN 320 184 该途径中的所有SZGR 2.0基因
纽曼ERCC6靶向 26 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUP98 HOXA9 Fusion 8D的Takeda目标 157 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名1 DN 242 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mullighan MLL签名2 DN 281 186 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lucas HNF4A靶向 58 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM2 153 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
gotzmann上皮到间充质过渡dn 206 136 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LE EGR2目标DN 108 84 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Goldrath免疫记忆 65 42 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hedvat Elf4靶向 12 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
松本自然杀手差分 475 313 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1定位DN的Alcalay AML 184 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NPM1突变DN的Verhaak AML 246 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染20小时 240 152 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染16小时 225 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sato被胰腺癌中的脱乙酰化沉默 50 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群P2 79 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群P6 91 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng Foxp3目标 26 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 461 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Iwanaga癌变由Kras Pten DN 353 226 该途径中的所有SZGR 2.0基因
iwanaga癌变由KRAS DN 120 81 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rizki肿瘤侵入性3D DN 270 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝癌 973 570 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Izadpanah干细胞脂肪与骨头 126 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
西肾上腺皮质肿瘤DN 546 362 该途径中的所有SZGR 2.0基因
yague premumor耐药性 8 5 该途径中的所有SZGR 2.0基因
冬季缺氧metagene 242 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤C DN 59 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 536 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Valk AML群集4 31 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G1 DN 40 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Coulouarn颞TGFB1签名DN 138 99 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yamashita肝癌干细胞DN 76 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gyorffy阿霉素耐药性 56 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇6的时间反应6 75 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
尼尔森·吉斯特(Nielsen Gist) 98 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ohguchi肝HNF4A靶向 44 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2目标 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Servitja肝HNF1A靶向 135 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Madan DPPA4目标 46 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Plasari TGFB1靶向10小时 199 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOSCO TH1细胞毒性模块 114 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因