基因页:ABCB1
概括?
基因 | 5243 |
象征 | ABCB1 |
同义词 | ABC20 | CD243 | CLCS | GP170 | MDR1 | P-GP | PGY1 |
描述 | ATP绑定盒子亚家族B成员1 |
参考 | MIM:171050|HGNC:HGNC:40|Ensembl:ENSG00000085563|HPRD:01370|Vega:Otthumg0000000023393 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7Q21.12 |
Pascal P值 | 6.093E-5 |
Sherlock P值 | 0.143 |
胎儿β | -1.587 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | G2CDB.HUMAN_CLATHRIN g2cdb.human_synaptosom |
数据源中的基因
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS4728709 | CHR7 | 87233601 | ABCB1 | 5243 | 0.06 | 顺式 | ||
RS10264856 | CHR7 | 87262580 | ABCB1 | 5243 | 0.06 | 顺式 | ||
RS17149864 | CHR7 | 87334383 | ABCB1 | 5243 | 0.06 | 顺式 | ||
RS10227951 | CHR7 | 87364096 | ABCB1 | 5243 | 0.06 | 顺式 | ||
RS2188828 | CHR7 | 87405350 | ABCB1 | 5243 | 0.05 | 顺式 | ||
RS9289452 | CHR3 | 133429642 | ABCB1 | 5243 | 0.03 | 反式 | ||
RS16886446 | CHR6 | 76012046 | ABCB1 | 5243 | 0.18 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ABCB1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 17088979 | |
去:0005524 | ATP结合 | 塔斯 | 3768958 | |
GO:0016787 | 水解酶活性 | IEA | - | |
去:0005215 | 转运蛋白活性 | 塔斯 | 3022150 | |
去:0008559 | 异生物传输ATPase活性 | IEA | - | |
GO:0016887 | ATPase活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006810 | 运输 | 塔斯 | 3022150 | |
GO:0042493 | 对药物的反应 | 塔斯 | 3022150 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005624 | 膜分数 | 塔斯 | 3022150 | |
去:0016020 | 膜 | IEA | - | |
GO:0016021 | 膜不可或缺 | 塔斯 | 3768958 | |
去:0009986 | 细胞表面 | 艾达 | 12493773 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG ABC转运蛋白 | 44 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta P53Hypoxia途径 | 23 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta核途径 | 15 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID HIF1 TFPathway | 66 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Abacavir Reactome Abacavir运输和代谢 | 10 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome ABC家族蛋白介导的运输 | 34 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
小分子的反应组跨膜转运 | 413 | 270 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Deurig t细胞促进性白血病DN | 320 | 184 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
纽曼ERCC6靶向 | 26 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NUP98 HOXA9 Fusion 8D的Takeda目标 | 157 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan MLL签名1 DN | 242 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan MLL签名2 DN | 281 | 186 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lucas HNF4A靶向 | 58 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM2 | 153 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
gotzmann上皮到间充质过渡dn | 206 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LE EGR2目标DN | 108 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn | 546 | 351 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Goldrath免疫记忆 | 65 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hedvat Elf4靶向 | 12 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
松本自然杀手差分 | 475 | 313 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NPM1定位DN的Alcalay AML | 184 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NPM1突变DN的Verhaak AML | 246 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染20小时 | 240 | 152 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染16小时 | 225 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sato被胰腺癌中的脱乙酰化沉默 | 50 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gavin Foxp3目标集群P2 | 79 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gavin Foxp3目标集群P6 | 91 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zheng Foxp3目标 | 26 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 | 461 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Iwanaga癌变由Kras Pten DN | 353 | 226 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
iwanaga癌变由KRAS DN | 120 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rizki肿瘤侵入性3D DN | 270 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Izadpanah干细胞脂肪与骨头 | 126 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
西肾上腺皮质肿瘤DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
yague premumor耐药性 | 8 | 5 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
冬季缺氧metagene | 242 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boylan多发性骨髓瘤C DN | 59 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP,含H3未甲基化 | 536 | 296 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Valk AML群集4 | 31 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boyault肝癌子类G1 DN | 40 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Coulouarn颞TGFB1签名DN | 138 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yamashita肝癌干细胞DN | 76 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gyorffy阿霉素耐药性 | 56 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇6的时间反应6 | 75 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
尼尔森·吉斯特(Nielsen Gist) | 98 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ohguchi肝HNF4A靶向 | 44 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2目标 | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向 | 682 | 433 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Servitja肝HNF1A靶向 | 135 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Madan DPPA4目标 | 46 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Plasari TGFB1靶向10小时 | 199 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BOSCO TH1细胞毒性模块 | 114 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |