基因页：PHB

概括?
基因ID 5245
Symbol PHB
同义词 HEL-215|HEL-S-54e|PHB1
描述 prohibitin
参考 MIM:176705|HGNC：HGNC：8912|ENSEMBL：ENSG00000167085|HPRD：01454|Vega:OTTHUMG00000134271
基因type protein-coding
地图位置 17q21
Pascal P值 0.37
Sherlock P值 0.047
Fetal beta -0.355
支持 INTRACELLULAR SIGNAL TRANSDUCTION
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS
G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSENSUS
COMPOSITESET

数据源中的基因
基因set name 基因组方法 描述 Info
简历：PGCNP Genome-wide Association Study GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 系统搜索PubMed通用电气nes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 Click to show details

第一节遗传学和表观遗传学注释


Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

Not available

基因expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
STAG2 0.86 0.86
ZNF24 0.85 0.87
波尔克 0.85 0.85
C1orf55 0.84 0.85
COPB2 0.84 0.83
KIAA1826 0.84 0.85
皮基 0.84 0.87
EXOC5 0.84 0.84
CPSF2 0.83 0.84
Scarb2 0.83 0.87
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 Spearman's Correlation
AF347015.21 -0.65 -0.72
IFI27 -0.64 -0.71
MT-CO2 -0.62 -0.68
FXYD1 -0.62 -0.68
AF347015.8 -0.60 -0.66
CXCL14 -0.60 -0.68
AF347015.31 -0.59 -0.66
AF347015.27 -0.59 -0.64
MYL3 -0.58 -0.63
AF347015.33 -0.58 -0.63

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005515 protein binding 新闻学会 11302691
GO:0016564 转录阻遏活性 IDA 12566959
GO:0016563 转录激活剂活性 IDA 14500729
Biological process 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0006260 DNA replication IEA -
去：0007165 signal transduction 塔斯 16130169
去：0008285 细胞增殖的阴性调节 NAS 12466959
GO:0042981 regulation of apoptosis 塔斯 16130169
GO:0016481 negative regulation of transcription IDA 12566959
GO:0016575 histone deacetylation IDA 12466959
细胞分量 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0005634 核 塔斯 16130169
GO:0005654 nucleoplasm IDA 12466959
GO:0005739 线粒体 IEA -
GO:0005743 mitochondrial inner membrane IEA -
GO:0005743 mitochondrial inner membrane 塔斯 14500729
GO:0016020 膜 IEA -
GO:0005887 质膜的积分 IDA 15274632

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors Aliases B Official full name B Experimental 资源 PubMed ID
ACTN1 FLJ40884 actinin, alpha 1 Affinity Capture-Western BioGRID 12628297
ANXA2 ANX2 | ANX2L4 | CAL1H | LIP2 | LPC2 | LPC2D | P36 | PAP-IV annexin A2 - HPRD，Biogrid 12628297
E2F1 E2F-1 | RBAP1 | RBBP3 | RBP3 E2F转录因子1 Affinity Capture-Western
Co-localization
Reconstituted Complex		 BioGRID 10523633|12065415
|14500729|14637159
E2F1 E2F-1 | RBAP1 | RBBP3 | RBP3 E2F转录因子1 - HPRD 10523633|14637159
HDAC1 DKFZp686H12203 | GON-10 | HD1 | RPD3 | RPD3L1 组蛋白脱乙酰基酶1 - HPRD，Biogrid 12466959
MAP3K10 MLK2 |MST 有丝分裂原激活的蛋白激酶激酶激酶10 - HPRD 9629920
NCOR1 KIAA1047 | MGC104216 | N-CoR | TRAC1 | hCIT529I10 | hN-CoR nuclear receptor co-repressor 1 - HPRD，Biogrid 12466959
RAF1 CRAF | NS5 | Raf-1 | c-Raf V-RAF-1鼠白血病病毒癌基因同源1 - HPRD，Biogrid 10523633
RAF1 CRAF | NS5 | Raf-1 | c-Raf V-RAF-1鼠白血病病毒癌基因同源1 RAF1（C-RAF）与PHB相互作用。 BIND 16041367
RB1 OSRC | RB | p105-Rb | pRb | pp110 retinoblastoma 1 - HPRD，Biogrid 10376528
RBL1 CP107 |MGC40006 |prb1 |P107 retinoblastoma-like 1 (p107) in vitro
体内		 BioGRID 10376528
RBL2 FLJ26459 | P130 | Rb2 retinoblastoma-like 2 (p130) - HPRD，Biogrid 10376528
SIN3A DKFZp434K2235 | FLJ90319 | KIAA0700 SIN3 homolog A, transcription regulator (yeast) Affinity Capture-Western BioGRID 12466959
SMARCA2 BAF190 | BRM | FLJ36757 | MGC74511 | SNF2 | SNF2L2 | SNF2LA | SWI2 | Sth1p | hBRM | hSNF2a SWI/SNF相关，矩阵相关，染色质的肌动蛋白依赖性调节剂，亚家族A，成员2 Prohibitin interacts with Brm. BIND 12065415
SMARCA2 BAF190 | BRM | FLJ36757 | MGC74511 | SNF2 | SNF2L2 | SNF2LA | SWI2 | Sth1p | hBRM | hSNF2a SWI/SNF相关，矩阵相关，染色质的肌动蛋白依赖性调节剂，亚家族A，成员2 - HPRD，Biogrid 12065415
SMARCA4 BAF190 | BRG1 | FLJ39786 | SNF2 | SNF2-BETA | SNF2L4 | SNF2LB | SWI2 | hSNF2b SWI/SNF相关，矩阵相关，染色质的肌动蛋白依赖性调节剂，亚家族A，成员4 - HPRD，Biogrid 12065415
SMARCA4 BAF190 | BRG1 | FLJ39786 | SNF2 | SNF2-BETA | SNF2L4 | SNF2LB | SWI2 | hSNF2b SWI/SNF相关，矩阵相关，染色质的肌动蛋白依赖性调节剂，亚家族A，成员4 Prohibitin interacts with Brg-1 BIND 12065415
TP53 FLJ92943 |LFS1 |trp53 |p53 tumor protein p53 Affinity Capture-Western
Co-localization
Reconstituted Complex		 BioGRID 14500729


V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
NAKAMURA TUMOR ZONE PERIPHERAL VS CENTRAL UP 285 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAZDA DIAMOND BLACKFAN ANEMIA MYELOID DN 38 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GARY CD5 TARGETS DN 431 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HORIUCHI WTAP TARGETS DN 310 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
UDAYAKUMAR MED1 TARGETS UP 135 82 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tien肠益生菌24小时 557 331 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DODD NASOPHARYNGEAL CARCINOMA DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV RESPONSE EPIDERMIS UP 293 179 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV RESPONSE KERATINOCYTE DN 485 334 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN DN 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hwang前列腺癌标记 28 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LASTOWSKA NEUROBLASTOMA COPY NUMBER UP 181 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRUETZMANN PANCREATIC CANCER UP 358 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LOPEZ MBD TARGETS 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WEI MYCN TARGETS WITH E BOX 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
里克曼转移 344 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SCHAEFFER PROSTATE DEVELOPMENT 6HR DN 514 330 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH MYC TARGETS WITH EBOX 230 156 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌17q21 Q25 Amplicon 335 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Menssen MYC目标 53 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RADAEVA RESPONSE TO IFNA1 UP 52 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MANALO缺氧DN 289 166 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TARTE PLASMA CELL VS PLASMABLAST DN 309 206 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FERNANDEZ BOUND BY MYC 182 116 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PENG GLUCOSE DEPRIVATION DN 169 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FLECHNER BIOPSY KIDNEY TRANSPLANT REJECTED VS OK DN 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PENG RAPAMYCIN RESPONSE DN 245 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
彭谷氨酰胺剥夺DN 337 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan多发性骨髓瘤 64 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WEIGEL OXIDATIVE STRESS BY HNE AND H2O2 39 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BURTON ADIPOGENESIS 5 126 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yamazaki TCEB3靶向DN 215 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE AGING NEOCORTEX UP 89 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHOU TNF SIGNALING 30MIN 54 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21 TARGETS 2 UP 428 266 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tseng irs1靶向 113 71 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BILD MYC ONCOGENIC SIGNATURE 206 117 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 6HR DN 911 527 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 24HR DN 1011 592 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra目标RESPONSIVE TO ESTROGEN UP 31 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MUELLER PLURINET 299 189 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YOSHIMURA MAPK8 TARGETS DN 366 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AGUIRRE PANCREATIC CANCER COPY NUMBER UP 298 174 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G3 UP 188 121 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra目标 535 325 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤上课 605 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DANG MYC TARGETS UP 143 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DANG BOUND BY MYC 1103 714 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄胚胎干细胞核心 335 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

miRNA family 目标位置 mirna id miRNA seq
UTR start UTR end Match method
mir-128 92 99 1A,m8 HSA-MIR-128A UCACAGUGAACCGGUCUCUUUU
HSA-MIR-128B UCACAGUGAACCGGUCUCUUUC
miR-205 768 774 1A HSA-MIR-205 uccuucauucccggagucug
HSA-MIR-205 uccuucauucccggagucug
mir-27 93 100 1A,m8 hsa-miR-27a脑 UUCACAGUGGCUAAGUUCCGC
hsa-miR-27b脑 UUCACAGUGGCUAAGUUCUGC